本文關(guān)鍵詞：利用miRNA發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：隨著研究者對疾病和基因之間關(guān)系的探討性研究,兩者間的關(guān)聯(lián)逐漸為人們所認(rèn)知,尤其相關(guān)技術(shù)的發(fā)展更是極大促進(jìn)了研究的深入,比如基因測序技術(shù)。隨著高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展,研究者們可以獲取更多更直接的編碼和非編碼物質(zhì)在人類疾病中表達(dá)的數(shù)據(jù)。由于調(diào)控人類發(fā)育的編碼物質(zhì)數(shù)量巨大,如當(dāng)前基因樣本數(shù)高達(dá)兩萬多維,隨著維數(shù)的增加,獲取關(guān)鍵基因的難度也隨之增加。近年來關(guān)于基因和疾病之間的成果越來越多,研究者們發(fā)現(xiàn)眾多種疾病間存在很多共性,比如某些基因在多種疾病中都有相似的表達(dá),因此需要通過一定方法鑒別與多種疾病相關(guān)的基因,從而探討基因之間的聯(lián)系,研究更深層次的疾病網(wǎng)絡(luò)問題,此背景下PanCancer項目應(yīng)運(yùn)而生,用于研究多種疾病間聯(lián)系的問題。本文針對復(fù)雜疾病和基因之間的關(guān)系進(jìn)行了研究,以PanCancer項目給出的數(shù)據(jù)為對象,基于miRNA和基因之間的靶定關(guān)系,提出了一種利用miRNA發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因的方法,避免了直接分析高維基因表達(dá)數(shù)據(jù)的不便。論文取得的創(chuàng)新性成果如下:1.提出了一種利用miRNA發(fā)現(xiàn)復(fù)雜疾病相關(guān)基因的方法,miTOm(miRN A TOmRNA)。miTOm通過分析低維的miRNA數(shù)據(jù),再結(jié)合miRNA和基因間的靶定關(guān)系,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)復(fù)雜疾病的相關(guān)基因,可以避免直接分析高維的mRNA基因表達(dá)數(shù)據(jù)。2.將提出的方法用于PanCancer項目的數(shù)據(jù)分析。首先利用miTOm分析了PanCancer中的幾種單一癌癥的樣本數(shù)據(jù),接著對六種癌癥樣本合成的組合數(shù)據(jù)進(jìn)行了共性分析,結(jié)果表明,miTOm方法可以甄別出復(fù)雜疾病的相關(guān)基因和風(fēng)險通路。本文提出的miTOm的方法也可以擴(kuò)展用于其他復(fù)雜疾病的分析,為復(fù)雜疾病的生物靶向治療、生物藥物研制、致病機(jī)理及風(fēng)險預(yù)測提供借鑒。
【關(guān)鍵詞】：miRNA PanCancer 致病基因 基因表達(dá) 復(fù)雜疾病 風(fēng)險通路
【學(xué)位授予單位】：西安電子科技大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R3416
【目錄】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-10
• 符號對照表10-11
• 縮略語對照表11-14
• 第一章 緒論14-18
• 1.1 研究背景14-15
• 1.2 研究內(nèi)容15
• 1.3 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀15-17
• 1.4 研究意義17
• 1.5 文章結(jié)構(gòu)17-18
• 第二章 利用miRNA發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因18-32
• 2.1 PanCancer項目18-19
• 2.2 miRNA概念19-24
• 2.2.1 miRNA命名規(guī)則20-21
• 2.2.2 miRNA靶基因技術(shù)21-24
• 2.3 Relief算法24-26
• 2.4 miTOm發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因26-30
• 2.5 本章小結(jié)30-32
• 第三章 基于miTOm方法的疾病相關(guān)基因發(fā)現(xiàn)32-42
• 3.1 數(shù)據(jù)集選定32-33
• 3.2 miTOm發(fā)現(xiàn)單個疾病相關(guān)基因?qū)嶒?/span>33-38
• 3.2.1 BRC A數(shù)據(jù)實驗33-35
• 3.2.2 KIRC數(shù)據(jù)實驗35-37
• 3.2.3 單個疾病實驗結(jié)果37-38
• 3.3 miTOm發(fā)現(xiàn)多種疾病相關(guān)基因?qū)嶒?/span>38-41
• 3.4 本章小結(jié)41-42
• 第四章 實驗結(jié)果分析42-60
• 4.1 單個疾病實驗結(jié)果分析42-53
• 4.1.1 BRC A實驗結(jié)果分析42-48
• 4.1.2 KIRC實驗結(jié)果分析48-53
• 4.2 多種疾病基因?qū)嶒灲Y(jié)果分析53-58
• 4.3 實驗結(jié)果分析58
• 4.4 本章小結(jié)58-60
• 第五章 結(jié)論和展望60-62
• 5.1 研究結(jié)論60
• 5.2 研究展望60-62
• 參考文獻(xiàn)62-66
• 致謝66-68
• 作者簡介68-69

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

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  本文關(guān)鍵詞：利用miRNA發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：295329