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PEP、DOP-PCR單細(xì)胞多基因位點(diǎn)檢測研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-19 21:11
   植入前遺傳學(xué)診斷(Preimplantation genetic Diagnosis,PGD)通過體 外輔助受精、胚胎細(xì)胞遺傳學(xué)分析,選擇正常胚胎移植,能將人類遺傳病控制 推進(jìn)到胚胎植入子宮內(nèi)膜之前,避免了異常妊娠的發(fā)生,具明顯的遺傳優(yōu)生學(xué) 意義。但由于PGD的分析材料僅限于1-2個(gè)活檢卵裂球細(xì)胞,單細(xì)胞多聚酶鏈 反應(yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)和熒光原位雜交(Fluorescence in-situ hybridization,F(xiàn)ISH)能提供的遺傳信息非常有限,難以滿足同時(shí) 檢測多個(gè)基因位點(diǎn)或重復(fù)檢測的需要。 全基因組擴(kuò)增(Whole genome amplification,WGA)技術(shù)通過擴(kuò)增微量 DNA模板甚至單個(gè)細(xì)胞的整個(gè)基因組,再將擴(kuò)增產(chǎn)物分為多份,作為模板,進(jìn) 行后續(xù)分析,增加微量DNA分析的遺傳信息量。應(yīng)用于PGD,實(shí)現(xiàn)了單次胚胎活 檢,可分析多種不同基因病或多次重復(fù)檢測同種基因病。WGA技術(shù)主要有擴(kuò)增 前引物延伸(Primer extension preamplification,PEP)、退變寡核苷酸引物 PCR(Degenerate oligonucleotide primer-PCR,DOP-PCR)。PEP以隨機(jī)組成 2001年浙江人學(xué)幀十學(xué)位論義 的 15堿基寡核昔酸作為引物,在低溫下連接、延伸,隨機(jī)擴(kuò)增整個(gè)基因組 DNA。 DOP—PCR引物序列為 5’-CCGACTCGAGN’N’N’NNNATGTGG-3’,經(jīng)低溫引物 隨機(jī)連接和常溫特異引物連接延伸兩步法擴(kuò)增,按比例均勻擴(kuò)增整個(gè)基因組 D「A。?2P和D0?-?[R的隨機(jī)引物眾多,單一循環(huán)的PCR條件無法使所有隨機(jī)引 物同時(shí)處于良好的復(fù)性和延伸狀態(tài),其擴(kuò)增全基因組DNA的完整性和擴(kuò)增效率 尚存許多亟待探討之處。 單細(xì)胞PEP用于檢測基因位點(diǎn)的研究國外開展較早,迄今已有利用PEP 進(jìn)行性別、神經(jīng)節(jié)昔脂病GM。I型、口地中海貧血.、IU:ln血型、高度多態(tài)短串 聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)等基因位點(diǎn)的研究,但尚未見p地中 海貧血 CD17和 nt-28突變基因及連鎖基因(An?rlyl?T)、18和 ZI號(hào)染色體特異短 串聯(lián)重復(fù)序列 D18551、D21511和 D2151411位點(diǎn)的報(bào)道。國內(nèi)研究才剛剛起步, 僅徐晨明和王敏分別進(jìn)行單個(gè)淋巴細(xì)胞、單個(gè)胚胎細(xì)胞和單個(gè)胎兒有核紅細(xì)胞 的杜氏肌營養(yǎng)不良癥基因的檢測。單細(xì)胞DOP-PCR全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物目前局 限于比較基因組雜交,檢測全基因組或染色體組缺失和重復(fù),應(yīng)用于基因病的 檢測報(bào)道甚少。若能在DOP-PCR全基因組擴(kuò)增,CGH染色體非整倍體檢測的 同時(shí),利用其DOP-PCR產(chǎn)物,開展基因病的檢測或篩查,將具有明顯的臨床 應(yīng)用價(jià)值。 第一部分 單細(xì)胞PEP多基因位點(diǎn)檢測的研究 目的:探索建立單細(xì)胞PEP全基因組擴(kuò)增,后續(xù)巢式PCR 6地中海貧血 CD17和 nt-28突變基因及連鎖基因(ATTTTTT)、18和 21號(hào)染色體短串聯(lián)重復(fù)序 列 D18S51、D21Sll和 D2lS1411位點(diǎn)檢測技術(shù),考察單細(xì)胞陀P同步檢測上述 基因位點(diǎn)以及囊性纖維病CF A F508及連鎖基因(GATT)、杜氏肌營養(yǎng)不良癥DMD 2 2001年浙江人學(xué)J袖十學(xué)位論義 基岡外顯子尸和48、Y染色體性別決定基因SRY的擴(kuò)增準(zhǔn)確率,分析單細(xì)胞 陀P擴(kuò)增全基【間mA的完整性。方法:顯微操作獲取單個(gè)人淋巴細(xì)胞和胚胎 細(xì)胞,PEP全基回組擴(kuò)增,后續(xù)特異性巢式PCR,檢測上述川個(gè)基囚位點(diǎn)的單 細(xì)胞擴(kuò)增率(特異產(chǎn)物擴(kuò)增出現(xiàn)的比率)、假陽性率(陰性管內(nèi)山現(xiàn)擴(kuò)增產(chǎn)物 的比率)、假陰性率(川性管內(nèi)未出現(xiàn)擴(kuò)增產(chǎn)物的比率)。擴(kuò)增準(zhǔn)確率(單 細(xì)胞利陰性、川性擴(kuò)增產(chǎn)物的符合率)。結(jié)果:1.成功建立單細(xì)胞陀P全基 回組擴(kuò)增,后續(xù)巢式 PCR D地中海貧血 CD17 t[ nt-28突變基因及連鎖基因 (ATI”TT)、18和 21號(hào)染色體短串聯(lián)重復(fù)序列 D18551、D21511和 D2151411位 點(diǎn)檢測技術(shù)。2.成功進(jìn)行單細(xì)胞PEP-巢式PCR,上述基因位點(diǎn)以及綴性纖維病 CF八F508及連鎖基因(GATTTT)、杜氏肌營養(yǎng)不良癥皿D基因外顯子17和48、Y 染色體性別決定基因 SRY 10個(gè)位點(diǎn)的同步分析,單個(gè)淋巴細(xì)胞和單個(gè)胚胎細(xì)胞 擴(kuò)增準(zhǔn)確率分別達(dá)97.17%(583/600)和 gi.58%(174/190)。3.單個(gè)淋巴擴(kuò)增 PEP后續(xù)巢式PCR擴(kuò)增準(zhǔn)確率高于單個(gè)胚胎細(xì)胞,假陽性率低于胚胎細(xì)胞,兩 者有顯著性差異(P<0.05)。 第二部分 單細(xì)胞DOP-PCR多基因位點(diǎn)檢測的研究 日的:探索建立單細(xì)胞DOP-PCR全基因組擴(kuò)增,后續(xù)巢式PCR上述10個(gè) 基岡位點(diǎn)的同步檢測技術(shù)?
【學(xué)位單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2001
【中圖分類】:R710.2;R394.3
【文章目錄】:
一、 中文摘要
二、 英文摘要
三、 正 文
前言
第一部分 單細(xì)胞PEP多基因位點(diǎn)檢測的研究
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
第二部分 單細(xì)胞DOP-PCR多基因位點(diǎn)檢測的研究
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
四、 綜 述
Ⅰ. 全基因組擴(kuò)增技術(shù)的研究進(jìn)展
Ⅱ. 熒光PCR在植入前遺傳學(xué)診斷的應(yīng)用
五、 致 謝

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 金帆,黃荷鳳,葉英輝,邢來鳳;單細(xì)胞的DOP—PCR—CGH分析[J];中國計(jì)劃生育學(xué)雜志;1999年08期

2 金帆,黃荷鳳,葉英輝,徐晨明,邢蘭鳳;簡并寡核苷酸引物聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增單細(xì)胞全基因組均勻性研究[J];中華婦產(chǎn)科雜志;2000年08期



本文編號(hào):2847734

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