【摘要】：目的對無錫1月份暴發(fā)的一起諾如病毒急性胃腸炎疫情進行病原基因測序分析,以鑒定其病原體,并對其基因進行進一步分型和分析。方法采用實時熒光定量RT-PCR法對10份疫情樣本進行諾如病毒I型和II型檢測,諾如病毒II型陽性樣本經半巢氏RT-PCR擴增,然后進行產物純化、測序,基因數據庫比對,并用Clustal X、MEGA 5.1等分析軟件構建序列進化樹。結果 10份疫情樣本中7份樣本測出諾如病毒II型陽性,陽性樣本經基因擴增、測序,所獲序列經基因數據庫比對后發(fā)現3個為GII.4型,其余為GII.7型,系統(tǒng)進化樹分析顯示本次病毒株的RdRp區(qū)和衣殼區(qū)的N/S區(qū)的同源分類相同,證明了沒有重組株的存在。結論序列測定和分析結果證實這起無錫急性胃腸炎疫情是GII.4型和GII.7型諾如病毒混合感染所致。
[Abstract]:Objective To study the pathogenic gene sequencing of an outbreak of Norovirus acute gastroenteritis in Wuxi in January, to identify its pathogen and to further classify and analyze its gene. Methods A real-time fluorescence quantitative RT-PCR method was used to detect the virus type I and type II of the 10 epidemic samples. The positive samples of the virus type II were amplified by half-nested RT-PCR, then the product was purified, sequenced, and the gene database was compared. The analysis software, such as the MEGA 5.1, builds the sequence tree. Results Among the 10 cases,7 samples were positive, and the positive samples were amplified by gene and sequenced. The obtained sequence was found to be in the form of GII.4 and the rest was type GII.7. The phylogenetic tree analysis showed that the homologous classification of the N/ S region of the RdRp region and the capsid region of the virus strain is the same, and the existence of no recombinant strain is proved. Conclusion The results of sequence determination and analysis confirm that the epidemic of acute gastroenteritis in Wuxi is caused by the mixed infection of GII.4 and GII.7.
【作者單位】： 無錫市疾病預防控制中心;
【基金】：2013無錫市科技發(fā)展資金資助課題(CSE31N1301)
【分類號】：R373;R446.5

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本文編號：2523251