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陰道毛滴蟲病毒基因組全長(zhǎng)cDNA克隆

發(fā)布時(shí)間:2018-09-05 14:16
【摘要】: 本研究首先從臨床分離陰道毛滴蟲,用肝浸湯進(jìn)行純培養(yǎng),提取蟲體總核酸,1%瓊脂糖凝膠電泳,初步篩選出一株攜帶陰道毛滴蟲病毒的蟲株;然后根據(jù)國外已發(fā)表的陰道毛滴蟲序列設(shè)計(jì)了一對(duì)覆蓋全長(zhǎng)的特異性引物,對(duì)陰道毛滴蟲病毒基因組進(jìn)行了全長(zhǎng)cDNA克隆并測(cè)序,測(cè)得我國陰道毛滴蟲病毒基因組全長(zhǎng)為4649bp。該序列編碼兩個(gè)閱讀框(ORF),二個(gè)閱讀框有14nt的重復(fù),在重復(fù)區(qū)有一個(gè)7聚體的滑動(dòng)體(C CTT TTT)。ORF1(nt290-2326)包含678個(gè)氨基酸,編碼分子量為74.9KDa的病毒衣殼蛋白;ORF2(nt2310-4581)包含756個(gè)氨基酸,編碼分子量為85.8KDa的RNA依賴的RNA聚合酶(RDRP)蛋白。本研究的結(jié)果為深入研究我國陰道毛滴蟲病毒奠定了良好基礎(chǔ)。
[Abstract]:In this study, Trichomonas vaginalis was isolated from clinic, cultured with liver steeping decoction, 1% agarose gel electrophoresis of total nucleic acid was extracted, and a strain carrying trichomonas vaginalis virus was screened. Then a pair of specific primers covering the whole length of Trichomonas vaginalis were designed according to the published sequences of Trichomonas vaginalis. The full-length cDNA of Trichomonas vaginalis virus was cloned and sequenced. The total length of the genome of Trichomonas vaginalis virus in China was 4649bp. The sequence encodes two reading frames, (ORF), two reading frames with 14nt repeats, a 7-mer slider (C CTT TTT) .ORF1 (nt290-2326) containing 678 amino acids, and a viral capsid protein (nt2310-4581) with a molecular weight of 74.9KDa containing 756 amino acids. Encoding RNA dependent RNA polymerase (RDRP) protein with molecular weight of 85.8KDa. The results of this study laid a good foundation for further study of Trichomonas vaginalis virus in China.
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2006
【分類號(hào)】:R382

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2224537

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