【摘要】：2013年在中國臺灣地區(qū)發(fā)現(xiàn)了第一例人感染H6N1禽流感,研究該地區(qū)H6N1病毒血凝素基因(HA)的適應(yīng)性進(jìn)化特征和種群動力學(xué),將為人感染H6N1病毒的來源、進(jìn)化及致病機(jī)制的理解提供更多信息,為進(jìn)一步的研究和防治提供一定幫助。本研究從Flu和GISAID兩大數(shù)據(jù)庫中獲得中國臺灣地區(qū)所有已釋放的H6N1病毒的HA序列,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹和進(jìn)化動力曲線,并推測其進(jìn)化速率,分析其適應(yīng)性進(jìn)化特征。結(jié)果表明中國臺灣地區(qū)H6N1病毒的HA有五種類型,其中人感染H6N1病毒的HA所屬類型為目前當(dāng)?shù)貎?yōu)勢類型;該病毒種群于1971年底第一次擴(kuò)張,2008年迅速減少,而后又略有增加。同時在長期的進(jìn)化過程中,3個位點(diǎn)受到正選擇作用的影響,增加了病毒的適應(yīng)能力;89個位點(diǎn)受負(fù)選擇作用的影響,它們在病毒的復(fù)制、流行中可能具有重要的功能;其中剪切位點(diǎn)附近的329位所受負(fù)選擇作用強(qiáng)烈(PSLAC0.001、PFEL0.000、BFREL137),此位點(diǎn)可能與病毒毒力有關(guān)。中國臺灣地區(qū)H6N1病毒的HA已發(fā)生了明顯的適應(yīng)性進(jìn)化,具有發(fā)生疫情的可能性,人們應(yīng)高度重視,并能及時給與監(jiān)測和防治。
[Abstract]:The first case of human infection with H6N1 avian influenza was found in Taiwan in 2013. The study of the adaptive evolutionary characteristics and population dynamics of the (HA) gene of H6N1 virus hemagglutinin in this area will be the source of human H6N1 virus infection. The understanding of evolution and pathogenesis provides more information for further study and prevention. In this study, HA sequences of all released H6N1 viruses were obtained from Flu and GISAID databases in Taiwan, China. Phylogenetic trees and evolutionary dynamics curves were constructed, and their evolutionary rates were estimated and their adaptive evolution characteristics were analyzed. The results showed that there were five types of HA of H6N1 virus in Taiwan area of China. The HA of human infected with H6N1 virus belonged to the local dominant type, and the population of H6N1 virus expanded for the first time at the end of 1971, then decreased rapidly in 2008, and then increased slightly. At the same time, during the long evolutionary process, 3 sites were affected by positive selection, which increased the adaptability of virus, 89 sites were affected by negative selection, which may play an important role in virus replication and epidemic. The negative selection of 329 sites near the shear site (PSLAC0.001 PFEL0.000 BFREL137) may be related to the virulence of the virus. The HA of H6N1 virus in Taiwan area of China has undergone obvious adaptive evolution and has the possibility of outbreak. People should attach great importance to it and be able to monitor and prevent it in time.
【作者單位】： 皖南醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)教研室;
【基金】：省級優(yōu)秀青年人才基金(WK200921) 校重點(diǎn)科研項(xiàng)目(WK2014Z02)
【分類號】：R373.9

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3 陳永燕,鐘揚(yáng),田波,楊繼,李德銖;被子植物SQUA類基因適應(yīng)性進(jìn)化的統(tǒng)計檢測[J];自然科學(xué)進(jìn)展;2004年09期

4 梁山;周仁超;董穗穗;施蘇華;;紅樹植物的鹽適應(yīng)性及其進(jìn)化的研究進(jìn)展[J];科學(xué)通報;2008年08期

5 佚名;;誰逼迫人類加速進(jìn)化[J];21世紀(jì);2010年11期

6 田海峰;文建凡;;寄生原生動物線粒體與適應(yīng)性進(jìn)化[J];動物學(xué)研究;2010年01期

7 ;南昌工程學(xué)院科研項(xiàng)目介紹[J];南昌工程學(xué)院學(xué)報;2010年01期

8 儲昭燦;李金鋼;李月明;;三種嚙齒類動物前肢挖掘效率分析[J];動物學(xué)雜志;2007年02期

9 石愛民;任國棟;;青藏高原擬步甲科昆蟲足的特化及其適應(yīng)性[J];西華師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2008年02期

10 張雁峰;張銳;宿兵;;MicroRNA基因簇的多樣性與進(jìn)化[J];中國科學(xué)(C輯:生命科學(xué));2009年01期

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2 張體操;喬琴;屈明志;鐘揚(yáng);;青藏高原魚腥藻基因組適應(yīng)性進(jìn)化研究[A];2012年中國青年遺傳學(xué)家論壇會議文集[C];2012年

3 吳寶成;杭悅宇;趙亞美;王筱璐;周義鋒;;薯蕷屬植物花結(jié)構(gòu)與花形態(tài)[A];全國系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)研討會暨第九屆系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)青年研討會論文摘要集[C];2006年

4 吳初新;楊攀;陳瓊;王娜;胡成鈺;;草魚GRP78基因分子特征、表達(dá)特性及其適應(yīng)性進(jìn)化分析[A];第五屆廣東、湖南、江西、湖北四省動物學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編[C];2008年

5 張馳宇;魏繼福;;SARS-CoV從果子貍向人類跨種傳播中S蛋白的適應(yīng)性進(jìn)化研究[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會2006年學(xué)術(shù)交流會論文集[C];2006年

6 丁建清;;植物入侵、天敵防御機(jī)制的適應(yīng)性進(jìn)化以及生物防治[A];中國植物學(xué)會七十五周年年會論文摘要匯編（1933-2008）[C];2008年

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8 鄭小波;王源超;馮潔;彭德良;強(qiáng)勝;竇道龍;洪曉月;胡白石;李保平;劉太國;周益林;李世訪;董莎萌;錢國良;;課題2“重要入侵物種與寄主的適應(yīng)性互作與進(jìn)化”主要研究進(jìn)展[A];第三屆全國生物入侵大會論文摘要集——“全球變化與生物入侵”[C];2010年

9 陳良標(biāo);;持久低溫下的基因組進(jìn)化和新基因的產(chǎn)生[A];“基因、進(jìn)化與生理功能多樣性”海內(nèi)外學(xué)術(shù)研討會暨中國生理學(xué)會第七屆比較生理學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要[C];2009年

10 陳詠梅;周仁超;施蘇華;;印度-西太平洋區(qū)域正紅樹(Rhizophora apiculata Blume)的群體基因組學(xué)研究[A];2011年全國系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)暨第十屆青年學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2011年

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2 記者 羅爭光;新成果圓遺傳學(xué)界20年夢想[N];新華每日電訊;2010年

3 陳勇;1米長的蜥蜴曾進(jìn)化成10多米的“海中霸王龍”[N];新華每日電訊;2005年

4 記者 熊燕;中科院昆明動物研究所揭示蚊子吸血特性[N];云南日報;2009年

5 留美學(xué)者，，生物化學(xué)博士 方舟子;生物是如何進(jìn)化的(下)[N];經(jīng)濟(jì)觀察報;2010年

6 本報記者 伍平 通訊員 張剛強(qiáng);人類表型多樣性遺傳機(jī)制研究取得重要突破[N];云南科技報;2010年

7 熊燕;中國—喜馬拉雅白珠樹屬植物的物種多樣性成因[N];云南日報;2011年

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3 趙方慶;螺旋藻基因組結(jié)構(gòu)分析和藻膽蛋白的適應(yīng)性進(jìn)化[D];中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所）;2006年

4 朱英;大熊貓Ⅰ類MHC分子標(biāo)記系統(tǒng)的建立及其適應(yīng)性進(jìn)化研究[D];浙江大學(xué);2012年

5 張原;SARS冠狀病毒的分子進(jìn)化研究[D];復(fù)旦大學(xué);2007年

6 應(yīng)南嬌;大腸桿菌輻射損傷適應(yīng)性機(jī)制及耐輻射球菌γ-射線誘導(dǎo)蛋白質(zhì)組研究[D];浙江大學(xué);2008年

7 嚴(yán)云志;撫仙湖外來魚類生活史對策的適應(yīng)性進(jìn)化研究[D];中國科學(xué)院研究生院（水生生物研究所）;2005年

8 張文娟;基于密碼子水平的生物信息學(xué)分析及進(jìn)化研究[D];復(fù)旦大學(xué);2006年

9 孫錚;昆蟲基因組密碼子使用及進(jìn)化分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

10 趙佳媛;靈長類二氧化碳感知通路相關(guān)基因的進(jìn)化及生物信息學(xué)分析[D];復(fù)旦大學(xué);2010年

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3 王娜;草魚轉(zhuǎn)鐵蛋白和趨化因子4的克隆、鑒定及其特征分析[D];南昌大學(xué);2008年

4 韓秀群;舊大陸果蝠肌球蛋白Ⅵ基因Myo6適應(yīng)性進(jìn)化研究[D];華東師范大學(xué);2012年

5 丁娜;HIV-1和A/H1N1的適應(yīng)性進(jìn)化研究及HIV-1重組分析方法的評價[D];江蘇大學(xué);2010年

6 田婕;�？崎艑僦参锏南到y(tǒng)發(fā)育學(xué)及其在果實(shí)性狀進(jìn)化系統(tǒng)學(xué)檢驗(yàn)中的應(yīng)用[D];中國科學(xué)院研究生院（西雙版納熱帶植物園）;2006年

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8 陶敏;鯽魚PKR-like Zα結(jié)構(gòu)域與核酸的親和性及趨化因子等蛋白質(zhì)的適應(yīng)性進(jìn)化[D];南昌大學(xué);2007年

9 胡麗珍;基于序列的Nedd4家族泛素連接酶進(jìn)化與功能研究[D];南京航空航天大學(xué);2012年

10 劉英;Philotrypesis屬榕小蜂CYP6基因克隆和進(jìn)化分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

本文編號：2188879