新疆部分人群SEN病毒的感染狀況及亞型分析
本文選題:SEN病毒 + 聚合酶鏈反應(yīng)。 參考:《石河子大學》2007年碩士論文
【摘要】: 目的: 1.建立聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)篩查SENV的反應(yīng)體系和流程; 2.檢測SENV-D和SENV-H在新疆地區(qū)部分人群中的流行情況; 3.對SENV-D和H亞型進行進化地位分析。 方法: 1.對象:選取98例健康供血員作為對照組,113例HBV陽性、57例抗-HCV陽性、27例ALT升高者作為病例組; 2.用Ready PCR血清病毒DNA純化系統(tǒng)提取樣本血漿中的病毒DNA,針對SENV ORF1部分區(qū)域設(shè)計、合成引物,采用巢式聚合酶鏈反應(yīng)(nested-PCR)擴增SENV-D和SENV-H亞型; 3.運用SPSS10.0進行數(shù)據(jù)分析;用DNASTAR軟件分析SENV的系統(tǒng)進化情況。 結(jié)果: 1.建立的巢式聚合酶鏈式反應(yīng)(nPCR)具有較高的特異性和重復性; 2. SENV在對照組、HBV陽性組、抗-HCV陽性組、ALT升高組檢出率分別為35.7%、51.3%、36.8%和14.8%,其中HBV陽性組的檢出率與對照組有顯著差異(P 0.05); 3. SENV在漢族、維吾爾族和回族中的檢出率分別為41.9%、38.9%和15.8%; 4.系統(tǒng)進化樹分析,SENV-D和H亞型在進化過程中無地域差別。 結(jié)論: 1.建立了同時檢測SEN病毒D和H型的巢式聚合酶鏈檢測方法(nPCR); 2.獲得了3個SENV D型片段和2個SENV H型片段; 3.在新疆漢族、維吾爾族和回族中都存在SENV D和H亞型感染; 4. SENV與HBV有相似的傳播途徑,但可能更多依賴非輸血傳播; 5.系統(tǒng)發(fā)育分析顯示新疆分離株(SENV-D-XJ6、XJ-58和XJ-111以及SENV-H-X-J5和XJ-172)分別與己發(fā)表的SENV-D(AB059352)和SENV-H(AB059353)日本分離株同屬一個亞型;新疆分離株屬于TTV超家族。
[Abstract]:Objective: 1. To establish the reaction system and procedure for screening SENV by polymerase chain reaction (PCR). 2. To detect the prevalence of SENV-D and SENV-H in some populations in Xinjiang. The phylogenetic status of SENV-D and H subtypes was analyzed. Methods: 1. Participants: 98 healthy blood donors were selected as control group, 113 cases were HBV positive and 57 cases were anti-HCV positive and 27 cases were alt elevation. 2. Virus DNA was extracted from plasma by ready PCR system. Primers were synthesized and amplified by nested polymerase chain reaction (nested polymerase chain reaction) to amplify SENV-D and SENV-H subtypes. 3. SPSS 10.0 was used to analyze the data and DNASTAR software was used to analyze the evolution of SENV. Results: 1. The nested polymerase chain reaction (nPCR) has high specificity and reproducibility. 2. The positive rates of SENV in HBV positive group and anti-HCV positive group were 35.7% and 14.8%, respectively. There was significant difference between HBV positive group and control group (P 0.05; 3). The positive rates of SENV in Han, Uygur and Hui nationalities were 38.9% and 15.88%, respectively. Phylogenetic tree analysis showed that there was no difference between SENV-D and H subtypes in the evolution process. Conclusion: 1. A nested polymerase chain analysis method for simultaneous detection of SEN virus D and H was established. Three SENV D-type fragments and two SENV H-type fragments were obtained. SENV D and H subtypes were found in Han, Uygur and Hui nationalities in Xinjiang. SENV and HBV have similar transmission routes, but may rely more on non-transfusion transmission. Phylogenetic analysis showed that SENV-D-XJ6 XJ-58 and XJ-111, SENV-H-X-J5 and XJ-172) belong to the same subtype as the previously published SENV-DX AB059352) and SENV-HGX AB059353), and Xinjiang isolates belong to the TTV superfamily.
【學位授予單位】:石河子大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2007
【分類號】:R373
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本文編號:2047335
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