本文選題：鼠疫耶爾森氏菌 + 假結(jié)核耶爾森氏菌　； 參考：《中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院》2005年博士論文

【摘要】：鼠疫是由鼠疫菌引起的烈 性傳染病,同時(shí)鼠疫菌也是一種生物戰(zhàn)劑。鼠疫的流行曾給人類帶來巨大的災(zāi)難。目前,鼠疫雖得到有效控制,但世界衛(wèi)生組織已將鼠疫列為重新抬頭的傳染病,并且鼠疫菌生物劑用于生物戰(zhàn)和生物恐怖的可能性依然存在。因此,對鼠疫菌進(jìn)行深入研究具有重要意義。 耶爾森氏菌屬包括11個(gè)耶爾森氏菌種,其中鼠疫菌、假結(jié)核菌和小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌對人致病,其它種對人不致病。鼠疫菌與假結(jié)核菌非常近緣,它可能是在1,500-20,000年前由假結(jié)核菌株0∶1b進(jìn)化而來。然而,鼠疫菌引起令人恐怖的鼠疫,而假結(jié)核菌僅引起腸道疾病。鼠疫菌比假結(jié)核菌多兩個(gè)毒力質(zhì)粒,這在一定程度上能解釋它與假結(jié)核菌之間傳播方式的不同。然而,兩個(gè)毒力質(zhì)粒的存在不足以解釋鼠疫菌的特殊毒力。比較基因組學(xué)的方法有望闡明二者之間不同表型的分子機(jī)制。目前細(xì)菌比較基因組學(xué)的方法主要包括全基因組序列測定、全基因組芯片和抑制消減雜交等技術(shù)。利用全基因組序列進(jìn)行比較基因組學(xué)研究無疑是最佳選擇,但是,測定全基因組序列需要投入大量的人力和物力。細(xì)菌的不同生物型和不同分離株基因組之間存在著一定的差異。為比較它們之間的差異,不可能對每一株菌都進(jìn)行全基因組序列測定,只能選擇一些具有代表性的菌株進(jìn)行。測定,因此這個(gè)方法顯然不現(xiàn)實(shí)。目前已有三株鼠疫菌和一株假結(jié)核菌的全基因組序列測定完成,這為我們比較二者之間的差別提供了豐富的信息。另一個(gè)比較理想的比較細(xì)菌基因組的方法就是全基因組芯片。全基因組芯片要求包括基因組內(nèi)所有編碼序列,這樣的工作量和花費(fèi)的才力也是相當(dāng)巨大的。抑制消減雜交技術(shù)是近幾年發(fā)展起來的一種比較基因組的方法。它通過對兩組基因組DNA進(jìn)行比較篩選出差異序列,有效抑制相同序列的檢出,主要檢出差異序列,而且花費(fèi)的人力和物力相對較低。因此,本研究主要目的是通過抑制削減雜交技術(shù),篩選出假結(jié)核菌相對于鼠疫菌的差異序列,制備差異片段DNA芯片,用制備的芯片篩選多株鼠疫菌和假結(jié)核菌,希望找到二者之間具有代表性的差異片段,為正確認(rèn)
[Abstract]:Yersinia pestis is a severe infectious disease caused by Yersinia pestis, and Yersinia pestis is also a biological warfare agent. The plague once brought great disaster to mankind. At present, although plague is under effective control, the World Health Organization has listed plague as a newly rising infectious disease, and the possibility of using biological agents of Yersinia pestis in biological warfare and bioterror still exists. Therefore, it is of great significance to study Yersinia. Yersinia includes 11 Yersinia strains, including Yersinia pestis, pseudotuberculum and Yersinia enterocolitica. Yersinia pestis is closely related to pseudotuberculum, which probably evolved from Pseudotuberculosis strain 0: 1b between 1500 and 20, 000 years ago. Yersinia pestis, however, cause horrific plague, while pseudotuberculosis causes only intestinal disease. Yersinia pestis has two more virulent plasmids than pseudotuberculous bacillus, which can explain the different transmission modes between Yersinia pestis and pseudotuberculosis to some extent. However, the existence of two virulent plasmids is not sufficient to explain the specific virulence of Yersinia pestis. Comparative genomics is expected to clarify the molecular mechanisms of different phenotypes between them. At present, the methods of bacterial comparative genomics mainly include whole genome sequencing, whole genome chip and suppression subtractive hybridization. It is undoubtedly the best choice to use the whole genome sequence for comparative genomics research, but it takes a lot of manpower and material resources to determine the whole genome sequence. There are some differences between the genomes of different biotypes and isolates of bacteria. In order to compare the differences between them, it is impossible to sequence the whole genome of each strain, only some representative strains can be selected. Determination, therefore, this method is obviously unrealistic. Three strains of Yersinia pestis and one strain of pseudotuberculosis have been sequenced, which provides abundant information for comparing the differences between the two strains. Another ideal way to compare bacterial genomes is the whole genome chip. The entire genome chip requires all the coding sequences in the genome, and the workload and talent involved are enormous. Suppression subtractive hybridization is a relatively genomic method developed in recent years. By comparing the two groups of genomic DNA, it can effectively inhibit the detection of the same sequence, mainly detect the differential sequence, and spend relatively low manpower and material resources. Therefore, the main purpose of this study was to screen out the differential sequences of pseudotuberculous bacteria relative to Yersinia pestis by suppression and reduction hybridization, and to prepare the DNA microarray of differential fragments, and to screen several strains of Yersinia pestis and pseudotuberculous bacilli by using the microarray. Hope to find the representative difference between the two pieces, for the correct recognition
【學(xué)位授予單位】：中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2005
【分類號(hào)】：R378

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本文編號(hào)：2000864