本文選題：結(jié)核分枝桿菌 + 基因分型　； 參考：《浙江預(yù)防醫(yī)學(xué)》2014年03期

【摘要】：目的初步評(píng)價(jià)15個(gè)可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)位點(diǎn)對(duì)結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的分型能力,尋找適合湖州地區(qū)結(jié)核分枝桿菌基因分型的位點(diǎn)。方法 2011年1—4月連續(xù)收集湖州地區(qū)結(jié)核分枝桿菌臨床分離株,采用多位點(diǎn)數(shù)目多位點(diǎn)串聯(lián)系復(fù)序列(MLVA)分析方法,對(duì)15個(gè)VNTR位點(diǎn)進(jìn)行基因多態(tài)性檢測(cè),分析單個(gè)位點(diǎn)以及15個(gè)位點(diǎn)組合的基因分型能力(Hunter-gaston指數(shù),HGDI)。結(jié)果分辨率較好的多態(tài)性位點(diǎn)有2個(gè):Mtub-21和Mtub-39;分辨率中等的多態(tài)性位點(diǎn)共7個(gè):ETR-A,ETR-C,MIRU-10,MIRU-23,MIRU-27,MIRU-40和Mtub-30;分辨率較差的多態(tài)性位點(diǎn)有6個(gè):ETR-B,ETR-D,ETR-E,MIRU-16和MIRU-26和MIRU-39。通過(guò)計(jì)算,本次研究運(yùn)用15個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型的HGDI為0.99,分辨能力好。結(jié)論 VNTR位點(diǎn)對(duì)結(jié)核分枝桿菌基因的分辨力較好,但還需繼續(xù)尋找其他豐富多態(tài)性的VNTR位點(diǎn),以便快速分型,提高分辨力。
[Abstract]:Objective to evaluate the ability of 15 variable tandem repeat (VNTR) loci for the typing of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates and to find suitable loci for the genotyping of Mycobacterium tuberculosis in Huzhou. Methods the clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis in Huzhou area were collected from January to April 2011. The gene polymorphisms of 15 VNTR loci were detected by multilocus multiple locus tandem sequence analysis. The genotyping ability of single locus and 15 locus combinations was analyzed and the Hunter-gaston index (HGDIA) was analyzed. Results the polymorphic sites with better resolution were 2: Mtub-21 and Mtub-39, and the middle resolution polymorphic loci were 7: ETR-An ETR-C ~ (1 +) MIRU-10 / MIRU-23 / MIRU-27 / MIRU-40 and Mtub-30, and 6: ETR-BETR-DETR-EETR-EMIRU-16, MIRU-26 and MIRU-3939. The HGDI of 15 loci genotyping in this study was 0.99, and the resolution was good. Conclusion the VNTR locus has better resolution to Mycobacterium tuberculosis gene, but it is necessary to continue to search for other rich polymorphic VNTR loci in order to quickly type and improve the resolution.
【作者單位】： 湖州市疾病預(yù)防控制中心;
【分類號(hào)】：R378.911

【參考文獻(xiàn)】

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5 余海若;征服癌癥的艱辛歷程[N];大眾科技報(bào);2000年

6 吳一福;MTHFRC667T基因分型技術(shù)問(wèn)世[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2005年

7 何瑤;美發(fā)現(xiàn)致病“熱點(diǎn)”DNA序列[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2002年

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10 通訊員廖定國(guó) 馮琳 記者馮競(jìng);西南醫(yī)院發(fā)現(xiàn)新的結(jié)構(gòu)蛋白[N];科技日?qǐng)?bào);2002年

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本文編號(hào)：1984240