本文選題：腸道病毒A型 + 傳播鏈��； 參考：《中國(guó)疫苗和免疫》2014年03期

【摘要】：目的研究太原市手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)患者中,腸道病毒A71型(Enterovirus Type A71,EVA71)的分子進(jìn)化特征。方法采集太原市HFMD患者的咽拭子和糞便標(biāo)本,采用熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法檢測(cè)EV核酸。然后隨機(jī)選取11株EVA71陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行衣殼蛋白(Capsid Protein)VP1編碼區(qū)基因擴(kuò)增、核苷酸序列測(cè)定和分析,與其他48株各基因型和基因亞型的EV71代表株構(gòu)建基因親緣性關(guān)系樹(shù)。結(jié)果太原市11株EVA71均屬于C4基因亞型C4a進(jìn)化分支,但11株EVA71在VP1編碼區(qū)核苷酸和氨基酸的同源性分別為95.7%~100.0%和99.0%~100.0%。在親緣進(jìn)化樹(shù)中顯示,這些EVA71處在不同的簇中,表現(xiàn)為11株EVA71至少屬于3條病毒傳播鏈。結(jié)論太原市流行的EVA71屬于C4基因亞型C4a進(jìn)化分支,并且存在多個(gè)傳播鏈。與中國(guó)其他地區(qū)流行的EVA71在基因親緣關(guān)系和流行時(shí)間關(guān)系上都很接近,說(shuō)明太原市EVA71不是獨(dú)立進(jìn)化的,而是與中國(guó)其他地區(qū)流行的EVA71在共同進(jìn)化。
[Abstract]:Objective to study the molecular evolution characteristics of enterovirus A71 (Enterovirus Type A71, EVA71) in patients with Hand (Hand, Foot and Mouth Disease, HFMD). Methods the pharynx swabs and fecal specimens of the HFMD patients in Taiyuan were collected and the fluorescence quantitative reverse transcriptase chain reaction was used. RT-PCR method was used to detect EV nucleic acid. Then 11 EVA71 positive specimens were randomly selected to amplify the gene of capsid protein (Capsid Protein) VP1 coding region, nucleotide sequence determination and analysis, and construct genetic relationship tree with the other 48 genotypes and gene subtypes EV71 representative strains. The results of 11 EVA71 in Taiyuan belong to C4a of C4 subtype C4a. Evolutionary branches, but the homology of nucleotide and amino acids in the 11 EVA71 VP1 coding region is 95.7%~100.0% and 99.0%~100.0%. in the phylogenetic tree respectively. These EVA71 are in different clusters, showing that 11 strains of EVA71 belong to at least 3 virus transmission chains. Conclusion the prevalent EVA71 in Taiyuan belongs to the C4a evolutionary branch of the C4 gene subtype and is stored in the subtype of C4 gene. In multiple transmission chains, the EVA71, which is popular in other parts of China, is close to the relationship between genetic relationship and epidemic time. It shows that the Taiyuan EVA71 is not independent of evolution, but is coevolved with the popular EVA71 in other regions of China.
【作者單位】： 太原市疾病預(yù)防控制中心;中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所 衛(wèi)生部醫(yī)學(xué)病毒學(xué)和病毒病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 世界衛(wèi)生組織西太平洋區(qū)脊髓灰質(zhì)炎參比實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：山西省衛(wèi)生廳科學(xué)技術(shù)攻關(guān)項(xiàng)目(編號(hào)201302026) 國(guó)家科學(xué)技術(shù)艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治重大專(zhuān)項(xiàng)——病毒性傳染病病原譜流行規(guī)律及變異研究(編號(hào)2013ZX10004202) 國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃:編號(hào)2011CB504902) 國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào)30900063、30901259)
【分類(lèi)號(hào)】：R373.11

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 陳立,李秀珠,張禮璧,朱暉,胡家瑜,丁曉光,祝雙利,清水博之;一起引發(fā)手足口病流行的腸道病毒71型的分子特征[J];中國(guó)計(jì)劃免疫;2003年05期

2 檀曉娟;李崇山;紀(jì)峰;張勇;祝雙利;王海巖;張玉軍;嚴(yán)冬梅;朱暉;陳立;王東艷;姬奕昕;徐愛(ài)強(qiáng);王顯軍;李巖;唐瀏英;毛乃穎;朱貞;安洪秋;許文波;;山東省2007年腸道病毒71型基因特征分析[J];中國(guó)疫苗和免疫;2008年02期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 余壽杰;劉江;王晨琨;劉笑梅;;淮南市2010年手足口病病原檢測(cè)結(jié)果分析[J];安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2011年06期

2 崔愛(ài)利,許文波,李秀珠,胡家瑜,凌華,唐偉,楊智宏,張燕,陳立,Hiroyuki Shimizu;腸道病毒71型的RT-PCR診斷及基因特征[J];病毒學(xué)報(bào);2004年02期

3 張勇;南立娟;武桂森;檀曉娟;徐冬冬;顧蘇儀;祝雙利;嚴(yán)冬梅;安洪秋;許文波;;2007年內(nèi)蒙古一起手足口病暴發(fā)的流行病學(xué)和病原學(xué)分析[J];病毒學(xué)報(bào);2009年03期

4 陶澤新;李巖;王海巖;宋立志;劉桂芳;劉堯;林小娟;馮蕾;楊赫;樊慶瑩;徐愛(ài)強(qiáng);;腸道病毒A組山東地方株的基因型分布[J];病毒學(xué)報(bào);2009年06期

5 何雅青;齊銳;楊洪;冼慧霞;姚相杰;陽(yáng)帆;張海龍;楊小柯;許文波;;2005～2008年深圳地區(qū)腸道病毒71型基因特征研究[J];病毒學(xué)報(bào);2009年06期

6 劉國(guó)軍;吳燕;田炳均;寸建萍;尹潔;姜黎黎;馬躍;陸林;徐聞;;云南省2009～2010年腸道病毒71型的基因特征分析[J];病毒學(xué)報(bào);2012年04期

7 郭芳;劉曉輝;王永光;李月;聶丹文;楊威;;隨州市2010年手足口病流行病學(xué)與病原學(xué)特征研究[J];公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué);2012年01期

8 葉春紅;;測(cè)定雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度在診斷手足口病中的作用[J];國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2012年11期

9 呂元聰;;手足口病研究新進(jìn)展[J];應(yīng)用預(yù)防醫(yī)學(xué);2008年03期

10 閻巖;王定明;莊妍;陶沁;胡靜;莊麗;周敬祝;余春;;貴州省手足口病的流行病學(xué)特征及病原鑒定[J];貴州醫(yī)藥;2010年03期

相關(guān)會(huì)議論文 前2條

1 毛群穎;郭增兵;李清;梁爭(zhēng)論;李鳳祥;王軍志;;2010年我國(guó)人免疫球蛋白中EV71中和抗體效價(jià)的比較研究[A];2010年中國(guó)藥學(xué)大會(huì)暨第十屆中國(guó)藥師周論文集[C];2010年

2 裴耀文;李忠;張華寧;呂慧;孫娜;張巖;王爽;王宇路;王顯軍;;2009年山東省手足口病病例的病原學(xué)檢測(cè)分析[A];華東地區(qū)第十次流行病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨華東地區(qū)流行病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議20周年慶典論文集[C];2010年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前3條

1 茅凌翔;腸道病毒71型分子流行病學(xué)調(diào)查及miRNA抑制腸道病毒71型體外復(fù)制的研究[D];江蘇大學(xué);2011年

2 劉丹;致死性EV71感染的病理學(xué)及分子病毒學(xué)研究[D];華中科技大學(xué);2012年

3 王驥濤;2009年河南省洛陽(yáng)市、開(kāi)封市手足口病病原譜研究[D];山西大學(xué);2013年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 雷紅娟;腸道病毒71型H6株在Vero細(xì)胞上的傳代適應(yīng)[D];河南師范大學(xué);2010年

2 周艷;手足口病患兒細(xì)胞因子和免疫球蛋白水平的研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2011年

3 楊赫;人類(lèi)腸道病毒A組山東地方株的基因型分布及其所致疾病分子流行病學(xué)研究[D];山東大學(xué);2011年

4 孫大鵬;山東省手足口病流行特征及重癥危險(xiǎn)因素分析[D];山東大學(xué);2011年

5 王穎;EV71 IgM AlphaLISA檢測(cè)方法的初步建立[D];安徽理工大學(xué);2011年

6 張偉;合肥市手足口病流行狀況及高危人群危險(xiǎn)因素分析[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2011年

7 楊永華;腸道病毒71型的層析純化[D];河南師范大學(xué);2011年

8 楊全中;腸道病毒71型的檢測(cè)及初步純化[D];河南師范大學(xué);2011年

9 陳真真;腸道病毒71型感染對(duì)小鼠IL-6，TNF-α和腦細(xì)胞凋亡的影響[D];青島大學(xué);2011年

10 聶艷萍;萎縮性舌炎患者舌背菌群及相關(guān)因素的研究[D];四川大學(xué);2006年

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前5條

1 崔愛(ài)利,許文波,李秀珠,胡家瑜,凌華,唐偉,楊智宏,張燕,陳立,Hiroyuki Shimizu;腸道病毒71型的RT-PCR診斷及基因特征[J];病毒學(xué)報(bào);2004年02期

2 張禮壁，李杰，原稔，鄭紅，侯曉輝，陸群，，方勇，吉倉(cāng)廣;中國(guó)脊髓灰質(zhì)炎Ⅰ型野毒株的PCR－RFLP法分析[J];病毒學(xué)報(bào);1994年02期

3 李秀珠,胡家瑜,丁曉光,張家琪;上海市手足口病患者腸道病毒71型的分離[J];中國(guó)計(jì)劃免疫;2003年01期

4 陳立,李秀珠,張禮璧,朱暉,胡家瑜,丁曉光,祝雙利,清水博之;一起引發(fā)手足口病流行的腸道病毒71型的分子特征[J];中國(guó)計(jì)劃免疫;2003年05期

5 陳立,張禮璧,朱暉;一起引發(fā)腦膜炎流行的ECHO病毒的序列分析[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2001年04期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 鮑勇,沐桂藩;用SP2/0細(xì)胞誘發(fā)制備抗腸道病毒70、71型小鼠免疫腹水[J];中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報(bào);1986年S1期

2 張麗娟;酶擴(kuò)增及核酸雜交對(duì)腸道病毒進(jìn)行分子水平檢測(cè)及鑒定[J];國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;1991年03期

3 趙雅男,姜慶五,姜仁杰,沈進(jìn)進(jìn),陳胤忠,汪華;蘇北地區(qū)2003年病毒性腦膜炎爆發(fā)病原分離株Echo30的序列分析[J];中華流行病學(xué)雜志;2005年04期

4 編輯部;;似曾相識(shí)的腸道病毒[J];新知客;2008年06期

5 胡燕;侯俊;沈宏輝;白冰珂;王志杰;于曉方;貌盼勇;;1株新型腸道病毒的生物學(xué)特性鑒定[J];傳染病信息;2009年03期

6 秦賢;白莉;;醫(yī)院污水中脊髓灰質(zhì)炎等腸道病毒消長(zhǎng)動(dòng)態(tài)的初步觀察[J];微生物學(xué)雜志;1983年Z1期

7 李質(zhì)懷;董女;李培雄;曾瓊英;粟惜蘭;鄺昆炎;黎愛(ài)蓮;劉素容;;一九八一年廣州市急性出血性結(jié)膜炎臨床分析及其病原研究 二、病毒分離與鑒定[J];眼科研究;1985年01期

8 張壽斌,廖華,黃呈輝,李婉華,譚慶瑜;深圳地區(qū)手足病腸道病毒5′端非編碼區(qū)部分基因克隆和序列分析[J];江西醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2002年01期

9 肖明華;葉智貞;張之倫;田秀琴;鄭建民;劉祖義;;天津市首次從手足口病人分離出Cox A_(16)腸道病毒[J];天津醫(yī)藥;1985年06期

10 何健民,李曉眠,劉民,李電東,劉瓊巖;抗生素S_(632)A_3在體外抗腸道病毒及單純皰疹病毒I型(HSV-1)作用的初步研究[J];天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2001年02期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 陳宗波;郭華;;臨床標(biāo)本中腸道病毒VP1序列的分子分型研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十四次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

2 蔡麗君;王均;許紅梅;常國(guó)輝;;2009年重慶地區(qū)腸道病毒71型流行株的分離鑒定及病毒基因特征[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十五次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編（上冊(cè)）[C];2010年

3 吳海波;沃恩康;王怡婷;尤金彪;李穎;王聞?wù)?陳亞峰;王怡;郭潮潭;;中國(guó)大陸腸道病毒71型VP1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)及B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[A];浙江省醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)微生物與免疫學(xué)及醫(yī)學(xué)病毒學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2009年

4 胡小云;王長(zhǎng)兵;朱冰;鐘家禹;鄺璐;;RD細(xì)胞上EV71病毒候選受體的篩選[A];新發(fā)和再發(fā)傳染病防治熱點(diǎn)研討會(huì)論文集[C];2011年

5 王衛(wèi);朵建英;佟巍;叢U

本文編號(hào)：1983933