白念珠菌基因芯片的制備和應(yīng)用及兩個新基因的克隆和功能鑒定
本文選題:白念珠菌 + 基因芯片 ; 參考:《第二軍醫(yī)大學(xué)》2005年博士論文
【摘要】:白念珠菌是臨床免疫功能低下患者最為常見的致病真菌,常造成粘膜和深部真菌感染。我們利用SMART技術(shù)快速構(gòu)建了白念珠菌高比例全長cDNA文庫,并制備了含有3096個unigene的白念珠菌cDNA微陣列芯片。利用所構(gòu)建的基因芯片我們研究了共六對氟康唑敏感和耐藥白念珠菌配對菌株的大規(guī)模基因表達(dá)譜,證實(shí)不同環(huán)境下產(chǎn)生的白念珠菌耐藥性均與多藥耐藥基因CDR的mRNA表達(dá)增加有關(guān),并從中鑒定了一些與藥物耐受性相關(guān)的共同差異表達(dá)基因和一些有趣的功能連鎖基因群。同時,通過比較耐藥和敏感菌株之間的差異,我們從大量差異表達(dá)基因中篩選出兩個耐藥相關(guān)新基因,在詳盡生物信息學(xué)分析的基礎(chǔ)上,獲得新基因的完整編碼序列并從敏感性,外轉(zhuǎn)運(yùn),細(xì)胞周期,及形態(tài)毒力等幾方面對其功能進(jìn)行了系統(tǒng)研究。
[Abstract]:Candida albicans is the most common pathogenic fungus in patients with low immune function, often causing mucosal and deep fungal infection. We rapidly constructed a full-length cDNA library of Candida albicans by using SMART technique and fabricated a cDNA microarray of Candida albicans containing 3096 unigene. Using the constructed gene chip we studied the large-scale gene expression profiles of six pairs of fluconazole-sensitive and drug-resistant Candida albicans strains. The results showed that the drug resistance of Candida albicans in different environments was related to the increase of mRNA expression of multidrug resistance gene CDR, and some common differentially expressed genes related to drug tolerance and some interesting functional linkage gene groups were identified. At the same time, by comparing the differences between drug resistance and sensitive strains, we screened two new genes related to drug resistance from a large number of differentially expressed genes, which were based on detailed bioinformatics analysis. The complete coding sequence of the new gene was obtained and its function was systematically studied from the aspects of sensitivity, external transport, cell cycle and morphologic virulence.
【學(xué)位授予單位】:第二軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2005
【分類號】:R346
【相似文獻(xiàn)】
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1 金e,
本文編號:1948965
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