西藏藏族結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的MIRU-VNTR基因多態(tài)性分析與評價
本文選題:結(jié)核分枝桿菌 + 基因型��; 參考:《中國人獸共患病學報》2014年02期
【摘要】:目的了解西藏地區(qū)藏族人群中結(jié)核分枝桿菌24位點MIRU-VNTR的基因多態(tài)性及其評價。方法應用歐盟推薦的24位點MIRU-VNTR分型方法,將本次分型結(jié)果與MIRU-VNTRplus數(shù)據(jù)庫進行比對,并應用BioNumerics5.0軟件進行聚類分析。結(jié)果 577株結(jié)核分枝桿菌分為347種基因型,其中299株分為69個基因簇,另278株表現(xiàn)為獨特的基因型。MIRU31、Qub11b2、Qub26、Qub4156c、Mtub21、MIRU20和MIRU26七個位點對西藏地區(qū)藏族人群中結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的分辨力較高,另17個位點的分辨力較低,其中MIRU24位點分辨率為0。結(jié)論西藏地區(qū)藏族人群中結(jié)核分枝桿菌MIRU-VNTR分型具有良好的多態(tài)性,且該地區(qū)以現(xiàn)代型結(jié)核分枝桿菌為流行優(yōu)勢菌。
[Abstract]:Objective to investigate the genetic polymorphism and evaluation of Mycobacterium tuberculosis 24 locus MIRU-VNTR in Tibetan population in Tibet. Methods using the 24 locus MIRU-VNTR typing method recommended by EU, the results were compared with the MIRU-VNTRplus database, and the cluster analysis was carried out by BioNumerics5.0 software. Results 577 strains of Mycobacterium tuberculosis were classified into 347 genotypes, of which 299 strains were divided into 69 gene clusters. The other 278 strains showed unique genotypes. MIRU31, Qub11b2OQub26Qub4156cU Mtub21, MIRU20 and MIRU26 had high resolution to clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis in Tibetan population in Tibet, and the resolution of the other 17 loci was lower, among which the resolution of MIRU24 locus was 0. Conclusion Mycobacterium tuberculosis MIRU-VNTR genotyping has a good polymorphism in Tibetan population in Tibet, and modern Mycobacterium tuberculosis is the most prevalent bacterium in this area.
【作者單位】: 西藏自治區(qū)第一人民醫(yī)院感染科;中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所;
【基金】:國家自然科學基金項目(No.30860243)資助~~
【分類號】:R378
【參考文獻】
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