本文選題：微生物組 + Illumina測序��； 參考：《生態(tài)科學(xué)》2014年05期

【摘要】：收集人、大豬、小豬、大鼠、小鼠以及雞五個不同個體的糞便樣品,每個個體取兩個平行樣,提取總DNA;PCR擴(kuò)增,獲得16S r RNA V6標(biāo)簽片段;Illumina測序;經(jīng)BIPES以及QIIME分析并比較菌群結(jié)構(gòu)及多樣性。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),不同物種之間腸道菌群差異較大。五類物種腸道菌群均以厚壁菌門、擬桿菌門、以及變形菌門為主,但雞的厚壁菌門顯著減少,而變形菌門顯著增加。從?多樣性角度來看,豬腸道菌群種屬豐富度及Shannon指數(shù)均顯著高于人及雞腸道菌群。從?多樣性角度,盡管不同人之間的腸道菌群相似度較低,但不同物種之間相比較,小豬與大鼠腸道菌群與人相似性高于小鼠和雞腸道菌群。與人類相比,小豬的腸道微生物組最相近,而雞的腸道菌群相似度最低。
[Abstract]:The fecal samples of human, pig, piglet, rat, mouse and chicken were collected. Two parallel samples were taken from each individual, and the total DNA-DNA fragment was amplified by PCR, and the 16s r RNA V6 tag fragment was sequenced. The flora structure and diversity were analyzed by BIPES and QIIME. The results showed that there were significant differences in intestinal flora among different species. The intestinal flora of five species were mainly phylum, Bacteroides and Proteus, but the phylum of Chicken decreased significantly, while the phylum of Proteus increased significantly. From? From the point of view of diversity, the abundance and Shannon index of pig intestinal flora were significantly higher than those of human and chicken intestinal flora. From? In terms of diversity, although the similarity of intestinal flora among different people was lower, the similarity between pig and rat intestinal flora was higher than that between mice and chicken. Compared with humans, pigs had the most similar intestinal microflora, while chickens had the lowest intestinal microflora similarity.
【作者單位】： 廣州市職業(yè)病防治院職業(yè)衛(wèi)生評價檢測中心 廣州市醫(yī)學(xué)重點學(xué)科職業(yè)健康監(jiān)護(hù)科 廣州市職業(yè)環(huán)境與健康效應(yīng)實驗室;南方醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)院;內(nèi)蒙古自治區(qū)赤峰市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金面上項目(31270152) 廣東省自然基金面上項目(S2011010004136) 廣東省教育廳科研處科技創(chuàng)新項目(2012KJCX0031) 廣州市“121人才梯隊工程”后備人才項目
【分類號】：R37

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本文編號：1820253