本文選題：甲型HN流感病毒 + 基因序列分析��； 參考：《中國病原生物學雜志》2014年09期

【摘要】：目的研究甲型H1N1流感病毒的基因特征和變化規(guī)律,為流感疫苗評價提供依據(jù)。方法選取2009年6月-2013年4月本院分離出的15株甲型H1N1病毒分離株,提取病毒RNA進行反轉(zhuǎn)錄。采用PCR方法擴增15株甲型H1N1流感病毒HA和NA全基因并進行測序分析。利用軟件Bioedit和MEGA軟件對序列進行拼接,繪制種系發(fā)生樹,采用鄰位相臨法構建進化樹。結(jié)果 15株甲型H1N1流感病毒均為低致病性病毒,對神經(jīng)氨酸酶抑制劑敏感,對金剛烷胺類呈耐藥性。實驗毒株HA基因序列與國內(nèi)和國外毒株同源性為99.1%~99.7%。該地區(qū)流感毒株抗原變異程度較大,其中毒株HA發(fā)生14個氨基酸點位改變,分別為:A215E,D127E,E235K,E374K,G170E,H138R,L161I,I321V,L191I,P83S,R45K,S185T,S203T和V234I。其中第83位和第321位與國內(nèi)代表株相同,但是與國外代表株不同。NA發(fā)生15個氨基酸點位改變,分別為A20V,N44S,V83M,V106I,E128G,H144Y,I188T,V241I,S247N,N248D,S334N,N369K,N449K,D451G和G454S。其中所有毒株均發(fā)生V106I和S247N的變化。結(jié)論通過對HA和NA基因序列對比分析,該地區(qū)流感疫苗對當?shù)鼐用裼斜Ｗo作用,但是毒株與疫苗株間發(fā)生相對抗原漂移,需要進一步觀察毒株變異情況。
[Abstract]:Objective to study the gene characteristics and changes of influenza A virus (H1N1), and to provide the basis for the evaluation of influenza vaccine. Methods 15 isolates of H1N1 virus isolated from our hospital in June 2009, -2013, April were selected to reverse transcription of virus RNA. The whole gene of HA and NA of 15 strains of influenza A virus (H1N1) was amplified by PCR and sequenced and analyzed. The sequence was spliced with software Bioedit and MEGA, and the phylogenetic tree was plotted and the evolution tree was constructed by adjacent phase approach. Results 15 strains of H1N1 influenza A virus were both low pathogenic virus, sensitive to neuraminidase inhibitors and resistant to amantanes. The HA gene sequence of the experimental strain was homologous to the domestic and foreign strains. The variation degree of influenza virus antigen in 99.1%~99.7%. is large, and the strain HA of the strain has 14 amino acid sites, which are: A215E, D127E, E235K, E374K, G170E, H138R, L161I, I321V, L191I, P83S, eighty-third and 321st are the same as the domestic representative strains, but 15 are different from the foreign representative strains. A20V, N44S, V83M, V106I, E128G, H144Y, I188T, V241I, S247N, N248D, S334N, N369K, etc. It is necessary to further observe the variation of the virus relative to the antigen shift.

【作者單位】： 哈勵遜國際和平醫(yī)院老年病二科;中國人民解放軍白求恩國際和平醫(yī)院;河南省第二人民醫(yī)院藥劑科;黑龍江省齊齊哈爾市第七醫(yī)院傳染一科;
【分類號】：R373

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