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小鼠頜骨發(fā)育過(guò)程中長(zhǎng)鏈非編碼RNA的表達(dá)譜變化

發(fā)布時(shí)間:2018-04-27 20:23

  本文選題:頜骨發(fā)育 + 長(zhǎng)鏈非編碼RNA ; 參考:《中華口腔醫(yī)學(xué)研究雜志(電子版)》2014年06期


【摘要】:目的研究在小鼠頜骨發(fā)育過(guò)程中長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lnc RNA)的表達(dá)譜變化情況。方法利用lnc RNA-seq測(cè)序技術(shù)檢測(cè)孕18 d及出生后14 d的C57小鼠下頜骨組織樣本中的lnc RNA表達(dá)譜差異,經(jīng)對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理達(dá)到均一化后,篩選出差異表達(dá)lnc RNA,進(jìn)行分析。結(jié)果孕18 d與出生后14 d的C57小鼠下頜骨組織樣本相比較,2倍以上變化并有顯著差異(FDR≤0.001)的lnc RNA,確定為差異表達(dá)lnc RNA。2倍以上變化的共6617條,占所有l(wèi)nc RNA的17.16%;2倍以上升高的共3720條;2倍以上降低的共2897條;5倍以上升高的共714條;5倍以上降低的共288條;10倍以上升高為共645條;10倍以上降低的共211條。結(jié)論孕18 d與出生后14 d的C57小鼠下頜骨組織樣本相比較,lnc RNA表達(dá)譜發(fā)生顯著變化。提示差異性表達(dá)的lnc RNA可能參與了小鼠頜骨發(fā)育的調(diào)控。
[Abstract]:Objective to study the expression profile of long chain non coding RNA(lnc during the development of mouse jaw. Methods lnc RNA-seq sequencing technique was used to detect the difference of lnc RNA expression profile in the mandibular tissue samples of C57 mice on the 18th day of pregnancy and 14 days after birth. After homogenization of the original data, differential expression lnc was screened and analyzed. Results compared with those of C57 mice on the 14th day of gestation, there were more than 2 times changes in the mandibular tissue samples and there were significant differences in lnc RNAs between them. A total of 6617 lnc RNAs were identified as differential expression of lnc RNA.2. The total number of 3720 more than twice increased in all lnc RNA was more than 2 times that of 2897 more than 5 times higher than that of 2897 and more than 5 times higher. The total number of more than 10 times lower than 10 times of the total number of lnc RNA was increased to that of the total of 645 or more than 10 times of the decrease of the total number of 211. Conclusion the expression profile of LNC RNA in mandibular tissues of C57 mice on the 18th day of gestation was significantly different from that of the C57 mice on the 14th day of gestation. These results suggest that the differentially expressed lnc RNA may be involved in the regulation of jaw development in mice.
【作者單位】: 中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院口腔科;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金項(xiàng)目(81200825)
【分類號(hào)】:R333.1

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1812178

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