本文選題：兼性胞內(nèi)寄生菌 + 基因組　； 參考：《浙江大學(xué)》2006年碩士論文

【摘要】：Phenylobacterium zucineum是一種我們近期在一種腫瘤細(xì)胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)的兼性胞內(nèi)寄生菌,不僅與目前已知的菌種均不相同,而且具有獨(dú)特的生物學(xué)特性和潛在的重要意義。由于該菌寄生在腫瘤細(xì)胞內(nèi),而目前大多數(shù)胞內(nèi)寄生菌都是病原體,因此該菌很可能與致病性相關(guān);由于該菌是兼性胞內(nèi)寄生菌,所以在胞內(nèi)和胞外的細(xì)菌生存形態(tài)不同,研究其侵入人宿主細(xì)胞的機(jī)制有著重要意義;由于本組的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)研究表明,該菌的侵入方式為“拉鏈”方式,即通過表達(dá)一些表面蛋白,并于真核細(xì)胞表面受體相互作用,該受體-配體的結(jié)合引起宿主細(xì)胞骨架發(fā)生重排、細(xì)胞膜延伸并包裹該菌,形成吞噬泡并侵入細(xì)胞,所以尋找其表達(dá)的蛋白以及受體-配體相互作用機(jī)制,是研究中的一個(gè)重點(diǎn);由于目前尚未有類似特征的細(xì)菌發(fā)現(xiàn),該菌的發(fā)現(xiàn)在具有開創(chuàng)新的同時(shí)又具有爭議性,所以需要尋找該菌潛在的一些不顯而易見的生物學(xué)意義是至關(guān)重要的。要解決上述問題,需要從整體上、根本上觀察該菌的實(shí)質(zhì),從而對(duì)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的方向提供一定的指向性,挖掘潛在意義。全基因組測(cè)序是一個(gè)很好的根本方法,因?yàn)橥ㄟ^全基因組序列的獲得,可以預(yù)測(cè)重要基因和蛋白,了解其功能和可能機(jī)制,促進(jìn)潛在生物學(xué)意義的發(fā)掘。 細(xì)菌基因組的全基因組測(cè)序目前已經(jīng)是相當(dāng)成熟的技術(shù),隨著美國能源部1994啟動(dòng)微生物基因組計(jì)劃以來,2000后基因組測(cè)序技術(shù)的完善使得世界上細(xì)菌全基因組測(cè)序項(xiàng)目以平均每年近50%的增長。截至2006年5月,NCBI上已全基因組測(cè)序的細(xì)菌已達(dá)343種(株)。 細(xì)菌基因組測(cè)序帶來的意義和應(yīng)用相當(dāng)廣闊。在研究病原菌的致病性與疾病的預(yù)防和治療方面,通過全基因組測(cè)序可以鑒定致病相關(guān)基因、開發(fā)和研究疫苗、開發(fā)新型抗生素等;在生物技術(shù)的應(yīng)用方面,從抗輻射到氮源利用,從生物降解到耐熱酶開發(fā)帶來PCR技術(shù)的誕生,從而引發(fā)分子生物學(xué)的一場(chǎng)革命;在研究微生物的進(jìn)化方面,由于細(xì)菌間,甚至原核生物間,存在廣泛的水平基因轉(zhuǎn)移,所以,單個(gè)基因的進(jìn)化并不等同于物種的進(jìn)化,通過全基因組測(cè)序,
[Abstract]:Phenylobacterium zucineum is a facultative intracellular parasite found in a tumor cell recently. It is not only different from the known species, but also has unique biological characteristics and potential significance. Because it is parasitic in tumor cells and most of the intracellular parasites are pathogens at present, it is likely to be related to pathogenicity. Because it is a facultative intracellular parasitic bacterium, the intracellular and extracellular bacteria exist in different forms. It is of great significance to study the mechanism of its invasion into human host cells. As the biological experiments in this group have shown that the invasion mode of the bacterium is "zipper" mode, that is, by expressing some surface proteins and interacting with the surface receptors of eukaryotic cells, The binding of the receptor-ligand causes the cytoskeleton of the host cell to rearrange, and the cell membrane extends and encapsulates the bacterium, forming phagocytic vesicles and invading the cells, so we look for the protein expression and the mechanism of the receptor-ligand interaction. Is a focus of research; since no bacteria with similar characteristics have yet been found, the discovery of this bacterium is both new and controversial. So the need to look for potential biological implications of the bacterium is critical. In order to solve the above problems, it is necessary to observe the essence of the fungus from the whole, so as to provide certain directivity to the direction of biological experiment and to excavate the potential significance. Whole genome sequencing is a good fundamental method because it can predict important genes and proteins, understand their functions and possible mechanisms, and promote the exploration of potential biological significance through the acquisition of whole genome sequences. The whole genome sequencing of bacteria is now quite a mature technology. With the improvement of genome sequencing technology since the launch of the microbial Genome Project in 1994 by the US Department of Energy, the worldwide bacterial genome sequencing project has increased by an average of nearly 50% a year. As of May 2006, 343 species of bacteria had been sequenced in NCBI. The significance and application of bacterial genome sequencing is very wide. In studying the pathogenicity of pathogenic bacteria and the prevention and treatment of diseases, we can identify the pathogenicity related genes, develop and study vaccines, develop new antibiotics and so on through the whole genome sequencing. From radiation resistance to the use of nitrogen sources, from biodegradation to the development of heat-resistant enzymes, the birth of PCR technology has led to a revolution in molecular biology; in the study of the evolution of microbes, because of bacteria and even prokaryotes, There is a wide range of horizontal gene transfer, so the evolution of a single gene is not the same as the evolution of a species, by sequencing the entire genome.
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2006
【分類號(hào)】：R378

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1793129