抗菌肽與細(xì)胞膜相互作用機(jī)制的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究
本文選題:抗菌肽 切入點(diǎn):分子動(dòng)力學(xué)模擬 出處:《德州學(xué)院學(xué)報(bào)》2014年06期 論文類型:期刊論文
【摘要】:抗菌肽由于其具有天然抗菌特性,且對(duì)生物體毒副作用小,有望作為新一代抗菌藥物而得到了廣泛的關(guān)注.作為研究生物大分子的有效工具,分子動(dòng)力學(xué)模擬技術(shù)被用來(lái)研究抗菌肽的抗菌機(jī)制及與細(xì)菌膜的相互作用.回顧近年來(lái)抗菌肽與膜相互作用分子動(dòng)力學(xué)模擬研究,理清利用全原子模型和粗粒化模型模擬抗菌肽與細(xì)菌膜作用情況,包括模擬力場(chǎng)的選擇、細(xì)菌膜模型的建立,以及利用模擬得到肽/膜作用信息等,對(duì)了解抗菌肽的抗菌活性及新藥設(shè)計(jì)提供幫助.
[Abstract]:Because of its natural antibacterial properties and low toxicity to organisms, antimicrobial peptides are expected to be a new generation of antimicrobial agents, which is an effective tool for the study of biological macromolecules. Molecular dynamics simulation techniques have been used to study the antibacterial mechanism of antimicrobial peptides and their interaction with bacterial membranes. The interaction between antimicrobial peptide and bacterial membrane was simulated by whole atom model and coarse-grained model, including the selection of simulated force field, the establishment of bacterial membrane model, and the use of simulation to obtain peptide / membrane interaction information, etc. It is helpful to understand the antibacterial activity of antimicrobial peptides and the design of new drugs.
【作者單位】: 山東省功能大分子生物物理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 德州學(xué)院物理與電子信息學(xué)院;山東師范大學(xué)物理與電子科學(xué)學(xué)院;
【分類號(hào)】:R329.2
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