湖南省日本血吸蟲DNA多態(tài)性的研究
本文關(guān)鍵詞:湖南省日本血吸蟲DNA多態(tài)性的研究 出處:《湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)》2006年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
更多相關(guān)文章: 日本血吸蟲 核糖體DNA 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS) cox1 nad4 聚合酶鏈反應(yīng) 序列分析 遺傳變異
【摘要】:對湖南省日本血吸蟲DNA多態(tài)性進(jìn)行研究,旨在闡明湖南省日本血吸蟲種內(nèi)的遺傳變異,為進(jìn)一步的分子遺傳學(xué)和分子診斷學(xué)研究奠定基礎(chǔ)。采用PCR擴增、克隆、測序和序列分析等方法對湖南省日本血吸蟲核糖體DNA(rDNA)內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)序列、線粒體(mtDNA)NADH脫氫酶亞單位Ⅳ基因(nad4)和細(xì)胞色素c氧化酶笫Ⅰ亞基(cox1)序列的多態(tài)性進(jìn)行研究。結(jié)果表明:1.首次在國內(nèi)報道湖南省長沙及岳陽錢糧湖農(nóng)場日本血吸蟲ITS序列,其中日本血吸蟲ITS-1全序列的報道是國際上首次。與GenBanK中收錄的日本血吸蟲部分ITS-1及ITS-2全序列做比較,發(fā)現(xiàn)它們之間有一定差異。2.nad4基因序列的PCR擴增引物是作者根據(jù)GenBanK中收錄的日本血吸蟲與肝片吸蟲的nad4基因序列設(shè)計的一對兼并引物,擴增片段為500bp左右。日本血吸蟲nad4基因序列的報道在國內(nèi)是首次。不同的代表性樣品nad4序列差異明顯,堿基差異在1.0%~2.9%之間。3.cox1基因序列分析表明,采自湖南岳陽君山、岳陽汨羅的樣品cox1序列之間有一定差異,堿基差異在0.2%~1.2%之間。 本研究證明了ITS、nad4及cox1三段序列確為理想的種內(nèi)變異研究的遺傳標(biāo)記,研究結(jié)果有助于日本血吸蟲的生活史、傳播途徑、流行病學(xué)、種群遺傳學(xué)的研究和其相關(guān)疾病的診斷。
[Abstract]:Research on the Hunan province of Schistosoma japonicum DNA polymorphism, to elucidate the genetic variation of Schistosoma japonicum in Hunan Province, lay a foundation for study on molecular genetics and molecular diagnosis. Further study by PCR amplification, cloning, sequencing and sequence analysis and other methods of Hunan Province on Schistosoma japonicum ribosomal DNA (rDNA) internal transcribed spacer (ITS) sequence (mtDNA), mitochondrial NADH dehydrogenase subunit gene (nad4) and cytochrome c oxidase subunit I (cox1) in the study of the polymorphic sequences. The results showed that: 1. for the first time in China reported in Hunan province and Yueyang Changsha farm of Schistosoma japonicum ITS sequence, the whole sequence of Schistosoma japonicum ITS-1 report is the first international. With GenBanK included ITS-1 and Schistosoma japonicum ITS-2 sequence comparison, found.2.nad4 gene sequence differences between them is PCR primer A pair of primers designed according to the sequence of nad4 gene of Schistosoma japonicum and Fasciola GenBanK included in the amplified fragment was about 500bp. Schistosoma japonicum nad4 gene sequence reported in China for the first time. A representative sample of nad4 sequence differences obviously, alkali difference in 1% ~ 2.9% between.3.cox1 gene sequence analysis showed that collected from Hunan Yueyang Junshan, there are some differences between the samples of cox1 Series in Yueyang Miluo, base difference at 0.2% ~ 1.2%.
This study proves that ITS, nad4 and cox1 three segment sequences are ideal genetic markers for intraspecific variation research. The research results are helpful for Schistosoma japonicum's life history, transmission route, epidemiology, population genetics research and related diseases diagnosis.
【學(xué)位授予單位】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2006
【分類號】:R383
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本文編號:1409159
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