本文關(guān)鍵詞：沙門菌MALDI-TOF-MS標(biāo)準(zhǔn)菌庫的建立及應(yīng)用研究　出處：《衛(wèi)生研究》2014年01期 　論文類型：期刊論文

  更多相關(guān)文章： 沙門菌 基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜 鑒定 菌庫建立

【摘要】：目的利用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)沙門菌株數(shù)據(jù)庫。方法利用MALDI-TOF-MS對21株標(biāo)準(zhǔn)沙門菌進行質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集,建立標(biāo)準(zhǔn)菌株數(shù)據(jù)庫。相關(guān)菌株質(zhì)譜數(shù)據(jù)通過菌株在相同培養(yǎng)環(huán)境不同培養(yǎng)時間下所得質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行優(yōu)化。通過血清型鑒定方法篩選出200株野生沙門菌,并利用自建數(shù)據(jù)庫和現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫對200株野生沙門菌進行MALDI-TOF-MS檢測,對自建數(shù)據(jù)庫進行評價。結(jié)果 Bruker原有數(shù)據(jù)庫、自建數(shù)據(jù)庫及合并數(shù)據(jù)庫對200株野生沙門菌鑒定,陽性率分別為87.5%、97.0%、97.5%。21株標(biāo)準(zhǔn)沙門菌株數(shù)據(jù)庫按親緣關(guān)系遠近可分為3大類。主成分分析發(fā)現(xiàn)不同菌種之間質(zhì)譜數(shù)據(jù)有一定的差異,個別菌種在不同培養(yǎng)條件下培養(yǎng),質(zhì)譜數(shù)據(jù)變化不明顯。結(jié)論本研究建立的標(biāo)準(zhǔn)菌庫對野生沙門菌的鑒定準(zhǔn)確性高,適用于實際檢測。研究結(jié)果豐富了已有的數(shù)據(jù)庫,同時也為其他細菌菌庫的建立提供了很好的借鑒。
[Abstract]:Objective to use matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). Methods 21 standard Salmonella strains were collected by mass spectrometry using MALDI-TOF-MS. The standard strain database was established. The mass spectrum data of related strains were optimized by mass spectrometry data obtained from the strains in the same culture environment and different culture time. 200 wild Salmonella strains were screened by serotype identification method. The self-built database and the existing database were used to detect 200 wild Salmonella strains by MALDI-TOF-MS, and the self-built database was evaluated. Results the original database of Bruker was used. The positive rates of 200 wild Salmonella strains were 87.5% and 97.0%, respectively. 97.5.21 standard Salmonella strains database can be divided into three categories according to the genetic relationship. Principal component analysis found that there are certain differences between different species of mass spectrum data. There was no obvious change in mass spectrum data of individual strains cultured under different culture conditions. Conclusion the standard bacterial bank established in this study has high accuracy for identification of wild Salmonella. The results enrich the existing database and provide a good reference for the establishment of other bacterial banks.
【作者單位】： 中國人民武裝警察部隊后勤學(xué)院天津市職業(yè)與環(huán)境危害防制重點實驗室;國家食品安全風(fēng)險評估中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.21077132) 武警后勤學(xué)院青年基金應(yīng)用類項目(No.whk201302)
【分類號】：R378
【正文快照】： 沙門菌是腸桿菌科中一類常見的致病菌屬,其致病因素復(fù)雜多變,是導(dǎo)致人類食物中毒的主要致病菌之一。近年來由其導(dǎo)致的食源性疾病事件持續(xù)增加,不但嚴重危害人類身體健康,而且給人類社會造成巨大經(jīng)濟損失[1-3]。沙門菌菌型繁多,傳統(tǒng)的生化和血清學(xué)分型方法準(zhǔn)確可靠,但操作復(fù)雜,

【參考文獻】

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【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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