本文關(guān)鍵詞：HBV基因分型芯片的構(gòu)建及臨床初步應(yīng)用　出處：《中國醫(yī)科大學(xué)》2006年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：背景及目的 乙肝病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染呈世界性分布,其分型有血清型和基因型兩種。它是一種高變異病毒,目前根據(jù)其基因組核苷酸序列差異已將HBV基因型分為A-H型。由于傳統(tǒng)的血清學(xué)分析不能真正反映基因組的改變,不能反映HBV的進(jìn)化關(guān)系及變異情況,而基因型在近年的研究中發(fā)現(xiàn)其與病毒的熱點(diǎn)突變、疾病的活動(dòng)度、抗病毒藥物的療效及疾病的預(yù)后等都有一定相關(guān)性,所以鑒別基因分型對(duì)流行病學(xué)調(diào)查與指導(dǎo)個(gè)性化治療具有十分重要的意義,因此開發(fā)簡便、有效的基因分型方法有很大的實(shí)用價(jià)值。 基因芯片的問世為HBV分型檢測提供了一個(gè)較好的解決辦法,其高通量、并行化檢測的特點(diǎn)在HBV分型方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。目前國內(nèi)對(duì)基因芯片的報(bào)道諸多,但尚沒有成熟的HBV芯片應(yīng)用到臨床,并且我國的基因型研究開展較少,所以本研究使用本實(shí)驗(yàn)室建立的技術(shù)流程自行構(gòu)建HBV基因分型芯片,著重解決分型探針的設(shè)計(jì)問題,優(yōu)化雜交條件,對(duì)芯片的重復(fù)性與可靠性進(jìn)行檢測分析,并應(yīng)用于臨床,對(duì)150例不同類型的乙肝患者進(jìn)行HBV基因分型,為本地HBV基因型分布提供調(diào)查資料。 實(shí)驗(yàn)材料與方法 一、實(shí)驗(yàn)材料 臨床血清標(biāo)本來自中國醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)院傳染科住院患者。 PCR試劑盒(華美生物工程公司) 引物與探針(上海博亞生物工程公司合成) PCR擴(kuò)增儀(Biometra Personal PCR system,Germany)生物芯片點(diǎn)樣儀(Micro Grind Ⅱ600,Biorobtics Ltd,England)
[Abstract]:Background and purpose
Hepatitis B virus (Hepatitis B, Virus, HBV) infection is a worldwide distribution, the type of serotype and genotype in two. It is a high variability of the virus, according to the nucleotide sequence of the HBV gene type differences have been divided into A-H type. Because the traditional serological analysis can not really reflect the change of genome that does not reflect the evolution and variation of HBV, and the genotype in recent studies found that mutations in the virus and hot, disease activity, disease curative effect and prognosis of antiviral drugs have some relevance, so the identification of genotypes is very important for epidemiological investigation and guiding personalized therapy therefore the development of simple and effective genotyping method has great practical value.
The advent of gene chip provides a good solution for HBV genotyping, the high flux, has a unique advantage of parallel detection in HBV typing. At present, many reports of gene chips, but there is no mature HBV chip applied to the clinical and research of genotype in China carry out less, so the laboratory technology process establishment constructed HBV genotyping chip used in this study, focus on solving the design problem type probe, optimization of hybridization conditions, the repeatability and reliability of the chip were analyzed, and should be used clinically in 150 cases of hepatitis B patients with different HBV genotypes with the survey data, the local distribution of HBV genotypes.
Experimental materials and methods
First, experimental materials
The clinical serum specimens are from the inpatients in the infectious department of the Second Clinical Hospital of China Medical University.
PCR Kit (Huamei bioengineering company)
Primers and probes (Shanghai Boya bio engineering company synthesis)
PCR amplification instrument (Biometra Personal PCR system, Germany) biochip dot sampler (Micro Grind II 600, Biorobtics Ltd, England)

【學(xué)位授予單位】：中國醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2006
【分類號(hào)】：R346

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1 金e，

本文編號(hào)：1382403