本文關(guān)鍵詞：耶爾森氏菌91001株基因組測(cè)序、比較基因組學(xué)及Ⅲ型分泌系統(tǒng)研究　出處：《中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院》2005年博士論文　論文類(lèi)型：學(xué)位論文

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【摘要】：鼠疫耶爾森氏菌是烈性傳染病鼠疫的病原體,曾在世界上引起過(guò)三次大流行,造成至少一億六千萬(wàn)人的死亡。近年,隨著鼠疫作為生物恐怖戰(zhàn)劑的活動(dòng)有所增加,鼠疫病例的上升,多重耐藥菌的出現(xiàn)及致病機(jī)制仍不十分明確,因此,進(jìn)行鼠疫的致病研究非常重要。為了進(jìn)一步探索鼠疫致病的分子機(jī)制,我們進(jìn)行鼠疫耶爾森氏菌91001株基因組測(cè)序、強(qiáng)致病性與弱致病性株間的比較基因組學(xué)分析,比較已知毒力島及毒力基因的變化,鑒定可能的新毒力因子,并進(jìn)一步分析了鼠疫耶爾森氏菌等革蘭氏陰性菌中廣泛存在的毒力島——Ⅲ型分泌系統(tǒng)的序列及結(jié)構(gòu)特征,深入探索了基于模體保守和結(jié)構(gòu)保守的可能的分子伴侶分泌信號(hào)機(jī)制。 鼠疫耶爾森氏菌91001株的全基因組序列測(cè)定及注釋 通過(guò)鳥(niǎo)槍法測(cè)定對(duì)人無(wú)致病性,而對(duì)小白鼠表現(xiàn)強(qiáng)毒的91001株全基因組序列,并與完成測(cè)序的對(duì)人具有強(qiáng)致病性的CO92株和KIM株進(jìn)行對(duì)比研究,從基因組水平了解鼠疫耶爾森氏菌對(duì)人致病機(jī)制的序列基礎(chǔ),尋找新的毒力基因,進(jìn)一步揭開(kāi)鼠疫對(duì)人體致病的分子基礎(chǔ)。通過(guò)鳥(niǎo)槍法測(cè)序獲得一條染色體序列及四個(gè)質(zhì)粒pPCP1、pMT1、pCD1和pCRY序列,分別長(zhǎng)約4,595,065bp,9,609bp,106,642bp,70,159bp,21,742bp,其中質(zhì)粒pMT1、pCD1和pPCP1的序列與參考株CO92和KIM株基本一致,質(zhì)粒pCRY為新發(fā)現(xiàn)的、未見(jiàn)報(bào)道的質(zhì)粒,具有獨(dú)立復(fù)制能力,編碼Ⅳ型分泌系統(tǒng)基因。染色體基因組上共編碼4,037個(gè)CDS,其中信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制有關(guān)基因100個(gè),細(xì)胞運(yùn)動(dòng)和分泌基因204個(gè),DNA復(fù)制、重組和修復(fù)基因296個(gè),轉(zhuǎn)錄、調(diào)控基因205個(gè),假基因141個(gè)。pCD1質(zhì)粒上共預(yù)測(cè)基因98個(gè),主要編碼Ⅲ型分泌系統(tǒng)基因簇,pMT1質(zhì)粒上共預(yù)測(cè)基因129個(gè),大部分是假定蛋白。通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)分析,鑒定了1193個(gè)蛋白,占基因組預(yù)測(cè)CDS的28.7%,完全對(duì)應(yīng)于染色體上的預(yù)測(cè)基因。 鼠疫耶爾森氏菌比較基因組學(xué)研究 通過(guò)生物信息學(xué)方法比較鼠疫耶爾森氏菌CO92、KIM和91001株的基因組發(fā)
[Abstract]:Yersinia pestis is the pathogen of plague, which has caused three pandemics in the world and killed at least 160 million people in recent years. With the increase of plague as a bioterrorist warfare agent and the increase of plague cases, the emergence and pathogenesis of multidrug resistant bacteria are not very clear. It is very important to study the pathogenesis of plague. In order to further explore the molecular mechanism of plague, we sequenced the genome of 91001 strains of Yersinia pestis. Comparative genomics analysis between strong pathogenicity and weak pathogenicity plants compared known virulence islands and virulence genes and identified possible new virulence factors. Furthermore, the sequence and structural characteristics of virulence island type 鈪，

本文編號(hào)：1362926