日本血吸蟲(chóng)性別差異表達(dá)分子Th細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)及鑒定
發(fā)布時(shí)間:2017-12-30 14:30
本文關(guān)鍵詞:日本血吸蟲(chóng)性別差異表達(dá)分子Th細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)及鑒定 出處:《中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院》2007年碩士論文 論文類(lèi)型:學(xué)位論文
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【摘要】: 血吸蟲(chóng)病是一種分布廣泛、危害嚴(yán)重的人畜共患病。血吸蟲(chóng)為吸蟲(chóng)中罕見(jiàn)的雌雄異體,性別的分化對(duì)血吸蟲(chóng)的發(fā)育及致病起著至關(guān)重要的作用。雌雄蟲(chóng)合抱是血吸蟲(chóng)雌蟲(chóng)發(fā)育成熟和產(chǎn)卵的關(guān)鍵,成熟雌蟲(chóng)所產(chǎn)生大量蟲(chóng)卵而引起肝臟病變是造成宿主主要病理?yè)p害和疾病再傳播的前提。 本研究基于Th細(xì)胞介導(dǎo)的免疫效應(yīng)機(jī)制可能在抗感染和抗生殖疫苗中發(fā)揮著主要作用這一事實(shí),從日本血吸蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄本組序列中篩選出性別差異表達(dá)分子,預(yù)測(cè)可能的Th細(xì)胞表位;同時(shí)對(duì)我們前期預(yù)測(cè)的分泌型分子的Th細(xì)胞表位進(jìn)行免疫學(xué)鑒定,為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究奠定基礎(chǔ)。 本研究應(yīng)用基于計(jì)算統(tǒng)計(jì)法的數(shù)字差異展示技術(shù)從日本血吸蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄本組序列中篩選性別差異表達(dá)分子,結(jié)合國(guó)家人類(lèi)基因組南方研究中心提供的相關(guān)序列信息,對(duì)選出的序列進(jìn)行注釋分析;應(yīng)用基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、隱馬爾科夫模型、及權(quán)重矩陣分析等蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)算法軟件,預(yù)測(cè)上述序列的信號(hào)肽及跨膜結(jié)構(gòu)。應(yīng)用基于結(jié)合基序、矩陣法和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等方法的多個(gè)服務(wù)器,預(yù)測(cè)上述序列中與人、鼠的MHCⅡ類(lèi)分子結(jié)合的肽;應(yīng)用基于分子動(dòng)力學(xué)算法的受體配體嵌合空間結(jié)合模擬服務(wù)器,預(yù)測(cè)肽與MHCⅡ分子的結(jié)合情況,,得到候選的Th細(xì)胞表位。用人工合成多肽法(偶聯(lián)到多聚賴(lài)氨酸骨架上)合成課題組前期預(yù)測(cè)出的日本血吸蟲(chóng)分泌型分子的5個(gè)候選Th細(xì)胞表位,MTT法和氚標(biāo)記法測(cè)定候選表位體外刺激免疫小鼠脾淋巴細(xì)胞增殖的情況。 結(jié)果共篩選到20個(gè)日本血吸蟲(chóng)性別差異表達(dá)分子全長(zhǎng)序列,即9個(gè)雄蟲(chóng)高表達(dá)分子,11個(gè)雌蟲(chóng)高表達(dá)分子;序列的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)其中7個(gè)為分泌型整合蛋白質(zhì)(2個(gè)雄蟲(chóng)高表達(dá),5個(gè)雌蟲(chóng)高表達(dá)),13個(gè)為非分泌型蛋白質(zhì);表位預(yù)測(cè)得到了與人和鼠MHCⅡ類(lèi)分子結(jié)合的21個(gè)Th細(xì)胞表位,結(jié)構(gòu)對(duì)接模擬預(yù)測(cè)優(yōu)化確定了6個(gè)混雜型候選Th細(xì)胞表位,其中來(lái)源于雌蟲(chóng)、雄蟲(chóng)高表達(dá)分子的各有3個(gè)表位,即CSPYFVICTTKQYTR(AY814326;雌蟲(chóng);分泌型假想蛋白質(zhì)分子)、YLCFVFGIIQAIYIF(AY813676;雄蟲(chóng);分泌型sj25四次跨膜超家族TE736分子)、SETLIQVWAVNKSVP (AY815950;雌蟲(chóng);具泛素巰基酯酶活性)、EGSSVLVQRTHKSTS(AY810358;雌蟲(chóng);具鈣蛋白激酶活性)、FGLKRRDLIKDTM(AY812918;雄蟲(chóng);具天冬酰氨肽鏈內(nèi)切酶活性)以及AEPIRMILVAAGVEF(AY816103;雄蟲(chóng);相似谷胱甘肽—S—轉(zhuǎn)移酶)。 對(duì)前期預(yù)測(cè)的表位實(shí)驗(yàn)鑒定結(jié)果顯示:5個(gè)候選表位中有2個(gè)(VVOSIGYKFHRHGYE(AY222874)和STGFYLCTARSSLGS(AY222926)可刺激淋巴細(xì)胞增殖,且VVQSIGYKFHRHGYE表現(xiàn)出較強(qiáng)的刺激作用。 本研究為進(jìn)一步篩選血吸蟲(chóng)候選Th細(xì)胞抗原,包括篩選可能的抗生殖抗病理的T細(xì)胞抗原/表位分子,提供了初步的理論預(yù)測(cè)和實(shí)驗(yàn)鑒定依據(jù)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2007
【分類(lèi)號(hào)】:R383
【引證文獻(xiàn)】
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1 李瑩;日本血吸蟲(chóng)鈣網(wǎng)織蛋白活化抗原提呈細(xì)胞功能的分析[D];上海師范大學(xué);2012年
本文編號(hào):1355345
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