本文關(guān)鍵詞：雙歧桿菌Ⅱ型毒素-抗毒素系統(tǒng)-MazEF的分子進(jìn)化分析

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【摘要】：目的:對雙歧桿菌屬編碼的Ⅱ類毒素-抗毒素(TA)系統(tǒng)MazEF進(jìn)行分子進(jìn)化分析。方法:利用PSI-BLAST在NCBI中搜索獲得雙歧桿菌編碼的MazF分子序列,在NCBI蛋白數(shù)據(jù)庫、核酸數(shù)據(jù)庫分別下載其他菌屬基因組編碼的MazF蛋白序列和本研究所涉及菌屬的16 S rRNA序列,應(yīng)用Clustal X2和MEGA4軟件對Maz F做分子進(jìn)化分析。結(jié)果:共搜索到雙歧桿菌株染色體編碼毒素蛋白MazF 26個。分子進(jìn)化分析顯示:整個雙歧桿菌屬的MazF保守性不好;MazF與16 S rRNA的共進(jìn)化僅在個別菌種中發(fā)現(xiàn),大部分MazF的聚類結(jié)果與相應(yīng)菌種16 S rRNA的聚類結(jié)果不同。結(jié)論:雙歧桿菌中的TA系統(tǒng)MazEF可能是通過基因的水平轉(zhuǎn)移整合入基因組中,屬于菌株非核心基因組部分。
【作者單位】： 徐州醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;徐州醫(yī)學(xué)院口腔醫(yī)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31300029) 江蘇省自然科學(xué)基金(BK20130213) 江蘇省高校自然科學(xué)基金項目(12KJB320015)
【分類號】：R378
【正文快照】： The Molecular Evolution of TypeⅡToxin-antitoxin(TA)System-Maz EF in Bifidobacterial Genomes/WEI Yan-xia,LIU Dian-bin,ZHENG Ji-wei,et al.//Medical Innovation of China,2014,11(34):016-019Ⅱ類毒素-抗毒素(TA)系統(tǒng),最早在1982年于大腸埃希菌的低拷貝質(zhì)粒中發(fā)現(xiàn)。

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本文編號：1200079