本文關鍵詞：云南省大理地區(qū)HIV感染者丙型肝炎病毒基因分型研究

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【摘要】：目的對大理地區(qū)HIV感染合并丙型肝炎患者進行丙型肝炎病毒(HCV)基因分型研究。方法采集患者血液,提取RNA,采用HCV特異性引物進行巢式RT-PCR擴增,PCR產物直接測序,采用生物信息學軟件進行序列分析。結果在大理州人民醫(yī)院共采集疑似丙型肝炎病人血清13份,HCV核酸檢測4份(24~27號)陽性。序列分析顯示4株病毒之間核苷酸同源性在80.4%~95.8%之間;24號與1b型HCV核苷酸同源性在98.6%以上,而其他基因型病毒核苷酸同源性在90.2%以下;25、27號與3b型HCV核苷酸同源性在92.1%~98.6%之間,而與其他基因型核苷酸同源性均在87.4%以下;26號與3a型HCV核苷酸同源性在94.4%~94.9%之間,而與其他基因型病毒核苷酸同源性在84.6%以下。遺傳進化分析顯示25、27號病例為3bHCV感染,26號病例為3aHCV感染,24號為1bHCV感染。結論大理地區(qū)HIV感染人群中存在HCV基因1和基因3兩個基因型,3a、3b和1b3個基因亞型HCV感染。
【作者單位】： 昆明醫(yī)科大學病原生物學與免疫學系;大理州人民醫(yī)院檢驗科;云南省畜牧獸醫(yī)科學院 云南省熱帶亞熱帶動物病毒重點實驗室;
【分類號】：R373.21
【正文快照】： 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是單股正鏈RNA病毒,屬黃病毒科丙型肝炎病毒屬。其RNA全長約9.4kb,基因組結構由341bp的5′非編碼區(qū)(5′URT)、編碼3 011個氨基酸的長開放讀框和約27bp的3′非編碼區(qū)(3′URT)組成。在病毒復制中,氨基端有3個蛋白(C、E1、E2/NS1),羧基端有4

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 解瑩;謝晨;;丙型肝炎病毒基因分型的研究進展[J];大連醫(yī)科大學學報;2010年04期

2 李崢;高玉紅;畢勝;楊曦;張桂前;臺虹;;云南省丙型肝炎病毒基因型及3b型遺傳進化樹分析[J];國際檢驗醫(yī)學雜志;2006年11期

3 蘇英豪;;丙型肝炎病毒基因分型及其意義:近3年的研究進展[J];國外醫(yī)學(微生物學分冊);1999年01期

4 黃永建;劉劍榮;夏洪嬌;李鳳中;楊劍;;102例丙型肝炎病毒基因分型結果分析[J];檢驗醫(yī)學與臨床;2010年19期

5 張繼明,尹有寬,謝怡,盧清,張清波,鄔祥惠,翁心華;基于丙型肝炎病毒NS5B基因序列分析的基因分型[J];中國抗感染化療雜志;2003年05期

6 祁欣,賈文祥,楊春,楊遠,曾蔚,陳恬;我國西部1a型丙肝病毒結構區(qū)的cDNA克隆和序列分析[J];生物技術通訊;2004年02期

7 王志強;王怡;詹林盛;;丙型肝炎病毒感染性細胞模型的研究進展[J];生物技術通訊;2009年01期

8 謝堯,趙輝,鷗蔚妮,閆杰,杜邵財,徐道振;不同感染途徑慢性丙型肝炎患者HCV基因型分布的差異[J];中華實驗和臨床病毒學雜志;2004年03期

9 張立新;安勇;張孝國;劉靚雯;于進紅;;山東地區(qū)慢性HCV感染者病毒的基因型分布[J];中國病原生物學雜志;2011年08期

10 劉麗君;張瑞;李俊強;田園;杜紹財;魏來;;中國南部和西南地區(qū)HCV感染的基因型分布特征[J];中國現(xiàn)代醫(yī)學雜志;2007年19期

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 徐少保;熊自忠;高人燾;沈強;;丙型肝炎病毒基因型的研究進展[J];安徽醫(yī)藥;2009年08期

2 胡志軍;丁輝;汪曉軍;;69例慢性丙型肝炎患者基因型與肝功能指標、HCV RNA及中醫(yī)證型的相關性分析[J];北京中醫(yī)藥;2012年03期

3 趙偉,萬建民,劉偉,劉全俊,張林,劉新鈺,張漢榮;基因芯片法對丙型肝炎病毒RNA的基因型分析[J];第二軍醫(yī)大學學報;2003年05期

4 林秀蓉;陳巧繪;林海;;TaqMan-MGB探針對HCV基因的檢測及分型研究[J];東南國防醫(yī)藥;2012年01期

5 蔡怡珊;黃金寶;鄭大利;;中國部分地區(qū)丙型肝炎病毒核心區(qū)基因分型的研究[J];中國國境衛(wèi)生檢疫雜志;2006年03期

6 張培男;佟偉軍;孫洪生;何龍英;李令保;吳海磊;;出入境人員丙型肝炎傳染性及危險因子研究[J];中國國境衛(wèi)生檢疫雜志;2012年03期

7 李崢;高玉紅;畢勝;楊曦;張桂前;臺虹;;云南省丙型肝炎病毒基因型及3b型遺傳進化樹分析[J];國際檢驗醫(yī)學雜志;2006年11期

8 常靜霞;張怡青;王潔;孟運運;汪茂榮;;慢性丙型肝炎患者病毒基因分型與血清HCV RNA水平的關系探討[J];實用肝臟病雜志;2012年04期

9 黃艷秋;史昌河;;丙型病毒性肝炎基因分型及臨床意義[J];青島大學醫(yī)學院學報;2012年05期

10 濮翔科;杭雙熊;申紅玉;陳敏;王永忠;;常州地區(qū)丙型肝炎病毒基因分型及臨床分析[J];放射免疫學雜志;2012年06期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 范可;王宇明;陳文;范懿;吳小翎;;慢性丙型肝炎病人基因型分布、傳播途徑及發(fā)現(xiàn)時間的調查研究[A];病毒性肝炎慢性化、重癥化基礎與臨床研究進展學術會議論文匯編[C];2009年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 葉鶯;福建省丙型肝炎流行特征及體外細胞培養(yǎng)模型的構建與應用[D];福建醫(yī)科大學;2011年

2 張立新;丙型肝炎病毒5’非編碼區(qū)及非結構蛋白5A的基因變異及其臨床意義[D];山東大學;2011年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉星;HCV單獨感染者與HIV/HCV共感染者HCV病毒負荷和基因亞型研究[D];復旦大學;2011年

2 郭艷;CD8~+T細胞免疫壓力對丙型肝炎病毒進化的影響[D];華中科技大學;2011年

3 何立華;HCV準種變異特性及其免疫逃逸機制初步研究[D];昆明理工大學;2011年

4 張國英;山東煙臺地區(qū)HCV基因分型研究[D];青島大學;2011年

5 師慶紅;丙型肝炎病毒基因分型及其臨床意義的研究[D];吉林大學;2007年

6 張孝國;酒精對丙型肝炎病毒高變區(qū)準種變化影響的初步研究[D];山東大學;2008年

7 李小寧;皖南地區(qū)丙型肝炎病毒感染的基因型研究[D];安徽醫(yī)科大學;2009年

8 孫慧慧;酒精對慢性丙型肝炎患者HCV基因型分布及細胞因子變化的影響研究[D];山東大學;2009年

9 李立飛;延邊地區(qū)丙型肝炎傳播危險因素及基因分型的研究[D];延邊大學;2010年

10 黃輝紅;HCV基因型和亞型：分型技術、臨床意義及其流行病學研究[D];南方醫(yī)科大學;2010年

【二級參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 霍艷英,徐德忠,趙小寧,李如琳,劉蓬勃,王全楚,王歆;西安和鄭州地區(qū)丙型肝炎患者的HCV基因分型[J];第四軍醫(yī)大學學報;2002年08期

2 蔡怡珊;黃金寶;鄭大利;;中國部分地區(qū)丙型肝炎病毒核心區(qū)基因分型的研究[J];中國國境衛(wèi)生檢疫雜志;2006年03期

3 邱艷;HCV基因分型研究進展[J];國外醫(yī)學.病毒學分冊;2002年03期

4 高玉紅;李崢;臺虹;;丙型肝炎病毒基因分型方法研究進展[J];國際檢驗醫(yī)學雜志;2006年10期

5 蘇英豪;;丙型肝炎病毒基因分型及其意義:近3年的研究進展[J];國外醫(yī)學(微生物學分冊);1999年01期

6 劉安國,胡國齡,譚德明,張錚,李聰智,李亮珍;丙型肝炎病毒家庭內傳播的4年隨訪和分子流行病學調查[J];湖南醫(yī)科大學學報;1998年01期

7 張立新,王磊,徐皖蘇,耿大影,王麗;山東地區(qū)丙型肝炎病毒的基因型及血清學分型的研究[J];臨床肝膽病雜志;2005年04期

8 杜紹財,吳娟,張敏,劉峰,韓建德;脫氧尿嘧啶核苷酸摻入量對尿苷酶抗污染效果的影響[J];臨床檢驗雜志;2001年06期

9 邱國華,張瑞,杜紹財,劉峰,田園,魏來;中國丙型肝炎病毒基因型的進化樹分析[J];臨床檢驗雜志;2005年03期

10 遲寶榮,郭曉林,劉陽;RT-PCR檢測HCV-RNA及基因分型的研究[J];中國全科醫(yī)學;1999年02期

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 李寧,毛紅菊,祁自柏,劉康棟,關洪全,趙建龍;基因芯片法特異性檢測丙型肝炎病毒的基因分型[J];中國免疫學雜志;2005年09期

2 萬祥輝;曾照芳;楊細媚;;丙型肝炎病毒基因分型及core蛋白區(qū)的分子演化分析[J];生物化學與生物物理進展;2008年08期

3 張厚勤;;丙型肝炎病毒基因型的研究進展[J];中國現(xiàn)代醫(yī)生;2007年15期

4 王芹;;丙型肝炎病毒NS5區(qū)的研究及其臨床意義[J];國外醫(yī)學(微生物學分冊);2002年03期

5 楊大利;孟祥偉;;丙肝病毒基因分型方法學研究進展[J];吉林醫(yī)學;2006年03期

6 萬祥輝;曾照芳;楊細媚;;用生物信息學方法確定丙型肝炎病毒基因分型的最佳區(qū)域[J];生物技術通報;2008年03期

7 聞玉梅;;國外肝炎病毒研究的新進展[J];國外醫(yī)學(微生物學分冊);1995年05期

8 萬祥輝;曾照芳;;用系統(tǒng)進化樹重建方法確定HCV基因分型的最佳區(qū)域[J];生物數(shù)學學報;2010年03期

9 周君霞;梁寧;;丙型肝炎病毒不同分型方法的分析及分型意義[J];標記免疫分析與臨床;2007年03期

10 許可;蔣春梅;鄧小昭;丁偉良;談永飛;張云;;蘇南地區(qū)1b型丙型肝炎病毒包膜區(qū)變異進化研究[J];中國病毒學(英文版);2006年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王敏;韓紅星;蔣小玲;陸堅;徐六妹;;HCV RNA定量檢測與基因分型的研究[A];第一次全國中西醫(yī)結合傳染病學術會議論文匯編[C];2006年

2 嚴艷;李卓;郭向華;林尊會;;北京地區(qū)慢性丙型肝炎患者病毒基因分型的分布和臨床意義[A];中華中醫(yī)藥學會第十三屆內科肝膽病學術會議論文匯編[C];2008年

3 嚴艷;李卓;郭向華;林尊會;;北京地區(qū)慢性丙型肝炎患者病毒基因分型的分布和臨床意義[A];全國第2屆中西醫(yī)結合傳染病學術會議暨國家中醫(yī)藥管理局第1屆傳染病協(xié)作組會議論文匯編[C];2008年

4 陳青鋒;郭振華;楊彥麟;肖萍;熊亞星;李瑩;岳偉;;甘肅地區(qū)HCV血清分型與基因分型及干擾素抗體關系研究[A];第二屆全國人工肝及血液凈化學術年會論文集[C];2005年

5 師慶紅;徐雪松;謝風;;長春地區(qū)丙型肝炎病毒基因分型的研究[A];中華醫(yī)學會第七次全國檢驗醫(yī)學學術會議資料匯編[C];2008年

6 郭振華;陳青鋒;肖萍;楊彥麟;景濤;王志劍;;丙型肝炎病毒基因分型及IFN-α1b干擾素療效相關因素探討[A];第二屆全國人工肝及血液凈化學術年會論文集[C];2005年

7 丁世雄;梁曉岳;胡愛榮;周文紅;翁彭劍;;寧波地區(qū)丙型肝炎病毒基因分型檢測[A];2011年浙江省檢驗醫(yī)學學術年會論文匯編[C];2011年

8 王大明;吳國光;唐斯;鄒紅巖;李楨;;8000份樣本快速全血DNA抽提結果影響因素的分析[A];中國輸血協(xié)會第三屆輸血大會論文專輯[C];2004年

9 劉梅;;MLVA、spoligotyping技術應用于結核分枝桿菌基因分型的初步研究[A];中華醫(yī)學會結核病學分會2010年學術年會論文匯編[C];2010年

10 楊光;陳姝;崔金環(huán);;利用基因膜芯片技術進行乙型和丙型肝炎病毒聯(lián)合診斷與分型[A];肝臟病防治學術研討會及新進展學習班�？痆C];2005年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 靜雨;HIV感染者應避免過早應用抗病毒藥[N];中國醫(yī)藥報;2002年

2 相洪琴;治療HIV感染者脂肪萎縮癥新藥問世[N];中國醫(yī)藥報;2005年

3 喬地;河南HIV感染者25036例[N];科技日報;2004年

4 盧維;丙肝檢測添基因分型手段[N];健康報;2003年

5 張中橋;重視對HIV感染者的急診檢測[N];中國醫(yī)藥報;2002年

6 顧蓓紅;基因分型抗病毒有的放矢 PEG干擾變異者難逃“羅”網(wǎng)[N];科技日報;2003年

7 楊立群;艾滋病防控形勢嚴峻[N];解放日報;2003年

8 ;克服困難，坦然面對人生[N];人民日報;2004年

9 張?zhí)燔?肺結核與艾滋病“合謀”危害人類[N];中國醫(yī)藥報;2003年

10 ;接種甲肝疫苗對HIV感染者有益[N];中國醫(yī)藥報;2005年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 李建紅;沙眼衣原體高分辨率溶解曲線基因分型方法的建立及其在男男性行為者流行病學調查中的應用[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2010年

2 張瑞;人乳頭瘤病毒基因分型檢測參考物質及其應用研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2013年

3 袁治國;丙型肝炎病毒6型和2型分子遺傳學研究[D];中山大學;2012年

4 姜曉穎;北京地區(qū)結核分枝桿菌基因分型及與耐藥性關系的研究[D];北京市結核病胸部腫瘤研究所;2012年

5 鄧艷琴;結核分枝桿菌基因分型及異煙肼新耐藥突變位點的確認研究[D];福建醫(yī)科大學;2009年

6 李衛(wèi)華;表達HCV-NS3抗原的重組腺病毒載體疫苗的實驗研究[D];四川大學;2005年

7 劉文杰;特應性皮炎中醫(yī)辨證分型與HLA-DR基因的相關性探討[D];廣州中醫(yī)藥大學;2006年

8 洪沙;缺失突變HCV核蛋白DNA免疫效果的初步評價[D];第四軍醫(yī)大學;2005年

9 胡巍;丙型肝炎病毒NS3蛋白酶及抑制肽研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2005年

10 鄭義;丙型肝炎病毒NS4B蛋白的功能[D];武漢大學;2005年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 師慶紅;丙型肝炎病毒基因分型及其臨床意義的研究[D];吉林大學;2007年

2 徐光;吉林地區(qū)丙型肝炎病毒基因分型的臨床研究[D];吉林大學;2008年

3 解瑩;大連地區(qū)丙型肝炎病毒基因分型及其臨床意義的研究[D];大連醫(yī)科大學;2008年

4 李小寧;皖南地區(qū)丙型肝炎病毒感染的基因型研究[D];安徽醫(yī)科大學;2009年

5 王麗納;應用RAPD對申克孢子絲菌線粒體類別進行4型內及種群分析[D];中國醫(yī)科大學;2007年

6 譚磊;基于PCR的牛源金黃色葡萄球菌基因分型研究[D];黑龍江八一農墾大學;2008年

7 王曉云;DPYD基因分型芯片的制備及應用基礎研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2003年

8 張振穎;利用核糖體基因進行孢子絲菌種內分型及一株播散型孢子絲菌的基因鑒定[D];大連醫(yī)科大學;2005年

9 孫志剛;RHCE基因分型的實驗性研究[D];中國醫(yī)科大學;2005年

10 趙文瑾;HBV基因分型芯片的構建及臨床初步應用[D];中國醫(yī)科大學;2006年

，

本文編號：1195266