本文關(guān)鍵詞：云南省大理地區(qū)HIV感染者丙型肝炎病毒基因分型研究

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【摘要】：目的對大理地區(qū)HIV感染合并丙型肝炎患者進(jìn)行丙型肝炎病毒(HCV)基因分型研究。方法采集患者血液,提取RNA,采用HCV特異性引物進(jìn)行巢式RT-PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物直接測序,采用生物信息學(xué)軟件進(jìn)行序列分析。結(jié)果在大理州人民醫(yī)院共采集疑似丙型肝炎病人血清13份,HCV核酸檢測4份(24~27號(hào))陽性。序列分析顯示4株病毒之間核苷酸同源性在80.4%~95.8%之間;24號(hào)與1b型HCV核苷酸同源性在98.6%以上,而其他基因型病毒核苷酸同源性在90.2%以下;25、27號(hào)與3b型HCV核苷酸同源性在92.1%~98.6%之間,而與其他基因型核苷酸同源性均在87.4%以下;26號(hào)與3a型HCV核苷酸同源性在94.4%~94.9%之間,而與其他基因型病毒核苷酸同源性在84.6%以下。遺傳進(jìn)化分析顯示25、27號(hào)病例為3bHCV感染,26號(hào)病例為3aHCV感染,24號(hào)為1bHCV感染。結(jié)論大理地區(qū)HIV感染人群中存在HCV基因1和基因3兩個(gè)基因型,3a、3b和1b3個(gè)基因亞型HCV感染。
【作者單位】： 昆明醫(yī)科大學(xué)病原生物學(xué)與免疫學(xué)系;大理州人民醫(yī)院檢驗(yàn)科;云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院 云南省熱帶亞熱帶動(dòng)物病毒重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【分類號(hào)】：R373.21
【正文快照】： 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是單股正鏈RNA病毒,屬黃病毒科丙型肝炎病毒屬。其RNA全長約9.4kb,基因組結(jié)構(gòu)由341bp的5′非編碼區(qū)(5′URT)、編碼3 011個(gè)氨基酸的長開放讀框和約27bp的3′非編碼區(qū)(3′URT)組成。在病毒復(fù)制中,氨基端有3個(gè)蛋白(C、E1、E2/NS1),羧基端有4

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本文編號(hào)：1195266