本文關(guān)鍵詞：對(duì)基因組內(nèi)不同序列分布差異進(jìn)行量化的探討

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【摘要】：目的針對(duì)DNA詞頻分析中序列分布問(wèn)題,探討對(duì)基因組內(nèi)不同序列的分布差異進(jìn)行量化的可行性。方法該研究采用數(shù)值模擬的方法對(duì)Kolmogorov-Smirnov檢驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)量和累積概率曲線下圖形的圖心進(jìn)行了比較。結(jié)果隨著樣本含量的增加,兩個(gè)指標(biāo)的離散趨勢(shì)逐漸減小,但其集中趨勢(shì)并沒(méi)有受到明顯影響,且不同的分布集中于不同的位置;當(dāng)樣本含量為100時(shí),所能判別的最小統(tǒng)計(jì)量差異約為0.1,圖心差異約為0.02;使用統(tǒng)計(jì)量指標(biāo)時(shí),需采用兩個(gè)基準(zhǔn)分布才能將5個(gè)待測(cè)分布分開(kāi),而圖心指標(biāo)可以直接將5個(gè)待測(cè)分布分開(kāi)。結(jié)論兩個(gè)指標(biāo)都可以看作分布差異的量化指標(biāo),但在大多數(shù)情況下樣本含量應(yīng)該大于100;當(dāng)需要在同一坐標(biāo)系表示不同分布時(shí),圖心可能是一個(gè)較好的選擇。
【作者單位】： 山西醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;美國(guó)密西根州立大學(xué)統(tǒng)計(jì)與概率系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31071156)
【分類(lèi)號(hào)】：R3416
【正文快照】： 基因組常被比喻為一本“生命天書(shū)”,如果有幾個(gè)關(guān)鍵詞在書(shū)中出現(xiàn)的位置比較接近,則其關(guān)系可能比較密切。反之,若其出現(xiàn)的位置具有明顯差異,則其可能關(guān)系較遠(yuǎn)。如果把序列看作是基因組內(nèi)的關(guān)鍵詞,則序列在基因組上出現(xiàn)的位置差異則可能說(shuō)明這些序列之間的功能差異。如果兩個(gè)重

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1155833