本文關(guān)鍵詞：miRDOA:集數(shù)據(jù)存儲與在線分析于一體的綜合型microRNA數(shù)據(jù)庫

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【摘要】：miRNA(microRNA)是一類小的非編碼RNA,普遍存在于動物、植物等多個物種中,研究表明在原生生物以及病毒中也有miRNA。miRNA在生物的成長、發(fā)育、細胞凋亡、神經(jīng)紊亂、癌癥等多個方面都起到至關(guān)重要的作用,miRNA還可作為Biomarker應(yīng)用于癌癥等疾病的診斷和治療。miRDOA(miRNA Database and Online Analysis)數(shù)據(jù)庫存儲了二百多個物種的miRNA相關(guān)信息,提供了基本的瀏覽和搜索功能。用戶可以通過物種來瀏覽miRNA相關(guān)數(shù)據(jù),也可以通過miRNA、靶基因或者序列進行檢索。除此之外,miRDOA還提供了在線分析模塊,主要對高通量測序數(shù)據(jù)進行初步分析,在此基礎(chǔ)上,添加了靶基因預測、表達譜數(shù)據(jù)差異分析,以及在線BLAST功能。miRDOA是一個完全免費的開源的數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站,并實時更新。
【作者單位】： 北京市計算中心;
【關(guān)鍵詞】： miRNA 高通量測序 靶基因 在線分析
【基金】：北京市科學研究院萌芽項目
【分類號】：TP311.13;R3416
【正文快照】： miRNA是一類非編碼的短RNA,長度~22nt,以單鏈的形式存在于細胞中,通過對靶基因的調(diào)控來實現(xiàn)生物學功能[1-2]。miRNA最初在細胞內(nèi)反轉(zhuǎn)錄成pri-miRNA,之后通過一系列的加工生成pre-miRNA,再經(jīng)過復雜加工生成成熟的miRNA[3]。miRNA主要通過與靶基因的互補配對來調(diào)控基因表達,主要

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本文編號：1091982