發(fā)布時間：2017-10-16 08:32

  本文關(guān)鍵詞：中國廣西登革3型病毒分離株基因組序列特征分析

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【摘要】：目的對我國廣西登革3型病毒分離株桂登-1株(GD-1株)和桂登-11株(GD-11株)進行全基因組序列測定和分析,為了解其地理來源提供依據(jù)。方法根據(jù)GenBank提交的登革3型病毒基因序列設(shè)計9對引物,RT-PCR方法分段擴增GD-1和GD-11株基因序列,測序后進行拼接,得到其全基因組序列。結(jié)果兩株病毒全長均為10 707nt,與國際參考株H87株核苷酸同源性為96.0%,氨基酸同源性為98.8%。GD-1株和GD-11株間僅有4個氨基酸差異,二者與H87株分別存在39和41個氨基酸差異。對3'UTR二級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測,二者與H87株存在較大差異。根據(jù)E蛋白基因序列對兩株病毒進行進化分析,GD-1和GD-11均屬于亞型Ⅱ,與分離自泰國的兩毒株進化關(guān)系較近。結(jié)論 GD-1和GD-11均屬于登革3型病毒亞型Ⅱ,二者可能是源自泰國的病原。
【作者單位】： 中國食品藥品檢定研究院;
【關(guān)鍵詞】： 登革型病毒 亞型 二級結(jié)構(gòu) 進化樹
【分類號】：R373
【正文快照】： 登革病毒(Dengue virus)屬黃病毒科(Flaviviridae)黃病毒屬(Flavivirus),根據(jù)其抗原性分為DEN-1、DEN-2、DEN-3和DEN-4等4個血清型。登革病毒可引起登革出血熱(dengue hemorrhagic fever,DHF)和登革熱休克綜合征(dengue shock syndrome,DSS)。目前普遍認為DEN-1、DEN-2、DEN-3

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