本文關(guān)鍵詞：吉林省漢坦病毒宿主動(dòng)物攜帶病毒的遺傳進(jìn)化分析

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【摘要】：目的對(duì)吉林省漢坦病毒(Hantavirus,HV)宿主動(dòng)物攜帶病毒進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。方法采集吉林省不同地區(qū)鼠肺樣品,應(yīng)用間接免疫熒光法(indirect immunofluorescence assay,IFA)鑒定出HV感染的陽(yáng)性樣本,利用Trizol試劑提取病毒RNA,RT-PCR法擴(kuò)增陽(yáng)性樣本中M和S片段基因,并進(jìn)行測(cè)序,應(yīng)用DNASTAR軟件對(duì)M和S片段基因的核苷酸同源性進(jìn)行分析,并與漢城病毒(Seoul virus,SEOV)參考株進(jìn)行比較;利用MegAligh軟件進(jìn)行蛋白序列中氨基酸差異性分析;利用MEGA 5.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生分析。結(jié)果共捕獲719只嚙齒動(dòng)物,其中褐家鼠(R.norvegicus)555只,黑線姬鼠(A.agrarius)74只,小家鼠(M.musculus)90只,HV抗原陽(yáng)性率為1.39%(10/719);10份陽(yáng)性樣本中,7份來(lái)自褐家鼠,2份來(lái)自小家鼠,1份來(lái)自黑線姬鼠。用全長(zhǎng)S引物擴(kuò)增得到的10株病毒全長(zhǎng)S基因片段,經(jīng)同源性分析比較發(fā)現(xiàn),各序列間的核苷酸同源性在92.8%~95.1%之間,與其他SEOV核苷酸同源性在90.2%~94.7%之間;用M引物擴(kuò)增得到的部分基因片段,經(jīng)同源性分析比較發(fā)現(xiàn),各序列間的核苷酸同源性在96.5%~99.5%之間,而與其他SEOV核苷酸同源性在91.5%~97.7%之間;10株病毒全部屬于SEOV。黑線姬鼠G蛋白365~769位點(diǎn)間有5個(gè)氨基酸差異位點(diǎn)(V494L、C546S、Y626C、M630L和V637I),小家鼠G蛋白365~769位點(diǎn)間主要有5個(gè)氨基酸差異位點(diǎn)(C378G/R、F420L、Q436P/R、E535G/A和C589G/W),但同種間在378、436、535和589位點(diǎn)也有差異;黑線姬鼠N蛋白1~430位點(diǎn)間存在P298L變異;小家鼠N蛋白變異位點(diǎn)較多,主要在M24K/N、A37D、I140M、M173K、D192E、L219V、P229A、D237E、H265Y、V284L、T333S、A389G和V425E變異。分離得到的10株病毒根據(jù)不同的來(lái)源地可分為兩個(gè)不同的進(jìn)化分支。結(jié)論研究表明吉林省宿主動(dòng)物攜帶的HV仍以SEOV為主,其遺傳進(jìn)化呈現(xiàn)多樣性。
【作者單位】： 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究所;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所;長(zhǎng)春市疾病控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 漢坦病毒 遺傳 進(jìn)化 漢城病毒
【基金】：863計(jì)劃(2013BAD12B04)
【分類號(hào)】：R373.9
【正文快照】： 在過(guò)去的幾十年,漢坦病毒(Hantavirus,HV)作為重要的動(dòng)物性病原,一直是人們關(guān)注的重點(diǎn),鼠類是其主要的儲(chǔ)存宿主和傳染源[1-2]。該病是世界上分布最廣、發(fā)病數(shù)量最多、危害最大的一種出血性疾病。HV屬于布尼亞病毒科(Bunyaviddae)漢坦病毒屬的成員,基因組均由3個(gè)片段(L、M、S)

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 唐麗華;張全福;修梅紅;扈光偉;沈博;楊顯達(dá);梁米芳;李德新;;在我國(guó)發(fā)現(xiàn)普馬拉病毒新亞型[J];病毒學(xué)報(bào);2007年04期

2 張永振,肖東樓,王玉,王洪霞,孫黎,陶曉霞,屈永剛;中國(guó)腎綜合征出血熱流行趨勢(shì)及其防制對(duì)策[J];中華流行病學(xué)雜志;2004年06期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 李澄;胡玉琳;任治興;閆紹宏;;2001—2010年內(nèi)蒙古腎綜合征出血熱流行病學(xué)特征分析[J];吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2012年02期

2 yと炅，

本文編號(hào)：1029467