本文關(guān)鍵詞：高通量測序篩選結(jié)核分枝桿菌耐藥株差異基因

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【摘要】：目的比較結(jié)核分枝桿菌中敏感株、多耐藥株、廣泛耐藥株三者間基因表達(dá)的差異,為進(jìn)一步針對耐藥菌株的研究提供方向。方法從深圳市第三人民醫(yī)院收集敏感株、多耐藥株、廣泛耐藥株各1株,提取菌株RNA,然后構(gòu)建cDNA文庫,使用Genome Analyzer IIx高通量測序儀進(jìn)行全基因組測序,經(jīng)過篩選比對后得到測序結(jié)果 ,再比較3個(gè)菌株間的基因表達(dá)差異。結(jié)果高通量測序后共得到基因3 968個(gè)。將耐藥株與敏感株的基因進(jìn)行比較,選取表達(dá)差異高于10倍的基因,篩選得到多耐藥株差異基因16個(gè)、廣泛耐藥株差異基因10個(gè)。這些表達(dá)差異基因大部分與毒素-抗毒素系統(tǒng)、PE/PPE家族蛋白、金屬轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白相關(guān)。還在多耐藥株中發(fā)現(xiàn)了一系列高表達(dá)的前噬菌體基因及噬菌體整合相關(guān)的基因。結(jié)論通過高通量測序篩選得到一系列耐藥株差異表達(dá)基因,為未來對耐藥菌株的研究提供依據(jù)。
【作者單位】： 中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室;中山大學(xué)熱帶病防治研究教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣東醫(yī)學(xué)院附屬深圳市第三人民醫(yī)院肝病研究所;暨南大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院深圳市人民醫(yī)院胸外科;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 耐藥株 高通量測序
【基金】：國家自然科學(xué)基金(C080102) 國家自然科學(xué)基金委員會(huì)與美國國立衛(wèi)生研究院合作研究項(xiàng)目(812111408)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： 結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)是世界上嚴(yán)重危害人類的病原體之一。結(jié)核病至20世紀(jì)70年代一度得到抑制,發(fā)病率不斷下降,其后由于耐藥菌株的出現(xiàn),以及艾滋合并結(jié)核病人的增多,結(jié)核病再度死灰復(fù)燃[1]。據(jù)衛(wèi)生部2007-2008年的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,我國每年新發(fā)耐多藥肺結(jié)核

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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1 黃海蓉;馬s，

本文編號：1004362