廣東省肇慶市2014—2015年登革病毒分子分型及初步溯源研究
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更多相關(guān)文章: 登革病毒 E基因 實(shí)時(shí)熒光RT-PCR 序列分析
【摘要】:目的了解廣東省肇慶市2014-2015年登革病毒(DENV)的基因型別和可能的輸入來(lái)源。方法收集登革熱臨床診斷病例急性期血清,對(duì)實(shí)時(shí)熒光反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)檢測(cè)陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行病毒培養(yǎng),分離株進(jìn)行E基因擴(kuò)增與序列測(cè)定,用Mega 5.1軟件進(jìn)行分子分型和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建。結(jié)果 409份樣品中147份實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)陽(yáng)性(35.94%),其中2014年陽(yáng)性144份(39.99%),以DENV 1(139/361)為主;2015年陽(yáng)性3份(6.25%),以DENV 3(2/48)為主。共獲得22株DENV分離株,其中20株為2014年DENV 1型的genotypeⅠ和Ⅲ,與2013-2014年廣州、佛山市分離株核苷酸同源性分別為99.40%~100.00%和99.20%~100.00%,與新加坡、泰國(guó)、馬來(lái)西亞和印度尼西亞分離株親緣關(guān)系次之;2株為2015年DENV 3的genotypeⅢ,與近年新加坡和印度尼西亞分離株的核苷酸同源性為98.20%~99.70%。結(jié)論廣東省肇慶市2014年暴發(fā)流行的DENV 1為genotypeⅠ和Ⅲ,可能由廣州市和佛山市輸入,2015年散發(fā)的DENV 3為genotypeⅢ,由佛山市輸入,疫情毒株可能源于新加坡、印度尼西亞等東南亞流行株。
【作者單位】: 肇慶市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 登革病毒 E基因 實(shí)時(shí)熒光RT-PCR 序列分析
【分類號(hào)】:R373.33
【正文快照】: 登革病毒(dengue virus,DENV)屬于黃病毒科(Flaviviridae)黃病毒屬(Flavivirus),主要通過(guò)埃及伊蚊或白紋伊蚊叮咬傳播[1]。近年來(lái),由于全球氣候變暖、生態(tài)環(huán)境改變、人口貿(mào)易跨境交往日益頻繁等因素,加劇了DENV的擴(kuò)散,估計(jì)有128個(gè)國(guó)家或地區(qū)約3.9億人口受感染,成為全球關(guān)注的
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,本文編號(hào):953468
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