本文關(guān)鍵詞：功能基因在皮膚微生物群落分析中的應(yīng)用

  更多相關(guān)文章： 皮膚微生物 功能基因 通用引物 細(xì)菌群落特征分析 細(xì)菌鑒定

【摘要】：使用16S rRNA基因可變區(qū)分析皮膚微生物群落時存在一定的不足,需要開發(fā)一些功能基因引物對其進(jìn)行補充。在分析皮膚微生物群落中細(xì)菌的優(yōu)勢種屬的基礎(chǔ)上,設(shè)計并篩選了3對擴(kuò)增功能基因的引物,并將之應(yīng)用于較大規(guī)模樣本的皮膚微生物群落特征分析中。新設(shè)計的引物不僅能夠?qū)⒓?xì)菌準(zhǔn)確地鑒定到種這一層級,而且也能實現(xiàn)對不同樣品間的微生物群落結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行比較。新設(shè)計的引物在皮膚微生物群落的分析中取得了較好的效果,有較好的應(yīng)用前景。
【作者單位】： 中國人民公安大學(xué)刑事科學(xué)技術(shù)學(xué)院;上海市刑事科學(xué)技術(shù)研究院;
【關(guān)鍵詞】： 皮膚微生物 功能基因 通用引物 細(xì)菌群落特征分析 細(xì)菌鑒定
【基金】：上海市刑事科學(xué)技術(shù)研究院現(xiàn)場物證重點實驗室開放課題(2014XCWZK14)
【分類號】：R37
【正文快照】： 1引言人類皮膚微生物組指所有在人類皮膚上的微小生物,如細(xì)菌、真菌和病毒等[1]。針對細(xì)菌的分析主要是基于16S rRNA基因的測序結(jié)果,而這種分析方法存在一定的劣勢。首先,該基因并非單拷貝基因,因此,其測序結(jié)果總體上來說僅僅是半定量的[2],會影響微生物群落的α多樣性及β多

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1 師舞陽;王淑玉;施劍鋒;;酸性礦坑廢水及目前研究酸性礦坑廢水微生物群落的方法(英文)[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2009年15期

2 陳曉倩,殷浩文;微生物群落多樣性分析方法的進(jìn)展[J];上海環(huán)境科學(xué);2003年03期

3 易維潔;賀江舟;曲東;;不同水稻土微生物群落利用有機酸的鐵還原特征[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2008年06期

4 王秀麗,徐建民,姚槐應(yīng),謝正苗;重金屬銅、鋅、鎘、鉛復(fù)合污染對土壤環(huán)境微生物群落的影響[J];環(huán)境科學(xué)學(xué)報;2003年01期

5 曾翠平;魯安懷;李艷;吳婧;王鑫;丁瑞;顏云花;;紅壤中微生物群落對半導(dǎo)體礦物日光催化作用的響應(yīng)[J];高校地質(zhì)學(xué)報;2011年01期

6 李卓佳;林亮;楊鶯鶯;林小濤;;芽孢桿菌制劑對蝦池環(huán)境微生物群落的影響[J];農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報;2007年03期

7 葉央芳;閔航;;代謝指紋評估苯噻草胺對水稻土微生物群落的短期影響[J];土壤學(xué)報;2006年02期

8 曾煒;曾光明;黃丹蓮;馮沖凌;胡霜;;鉛污染對垃圾堆肥中微生物群落演替規(guī)律的影響[J];中國環(huán)境科學(xué);2007年06期

9 李旭;謝世鵬;胡聰聰;呂鋮;徐清萌;邢輝;;安徽銅陵酸性礦山環(huán)境中微生物群落構(gòu)成調(diào)查[J];中學(xué)生物學(xué);2014年04期

10 ;附件[J];生物工程學(xué)報;2014年01期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 趙立平;;分子生態(tài)學(xué)與微生物群落的動力學(xué)監(jiān)測、結(jié)構(gòu)解析及功能調(diào)控[A];微生物生態(tài)學(xué)研究進(jìn)展——第五屆微生物生態(tài)學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2003年

2 李慧;何晶晶;張穎;徐慧;史榮久;陳冠雄;;選擇16S rDNA不同高變區(qū)研究微生物群落多樣性的比較[A];第十次全國環(huán)境微生物學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2007年

3 趙立平;;生態(tài)基因組學(xué)與復(fù)雜微生物群落的結(jié)構(gòu)解析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物微生態(tài)學(xué)分會第三屆第七次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2004年

4 朱玲;張銳;錢培元;;南海海盆微生物群落的空間結(jié)構(gòu)特征[A];中國海洋湖沼學(xué)會第九次全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編[C];2007年

5 陳曉倩;殷浩文;;微生物群落多樣性分析方法的進(jìn)展[A];全面建設(shè)小康社會：中國科技工作者的歷史責(zé)任——中國科協(xié)2003年學(xué)術(shù)年會論文集（下）[C];2003年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 張夢然;南極冰川湖下有各種微生物群落棲息[N];科技日報;2014年

2 華凌;南北極海洋微生物群落差異顯著[N];科技日報;2012年

3 記者 劉海英;英發(fā)現(xiàn)以異糖酸為食的微生物群落[N];科技日報;2014年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 郭建國;造紙和農(nóng)藥污染對大凌河微生物群落影響特征[D];大連海事大學(xué);2015年

2 王尚;滇藏?zé)崛⑸锶郝浞植技捌淇刂埔蛩匮芯縖D];中國地質(zhì)大學(xué)(北京);2015年

3 劉正輝;東江氨氮污染河段的微生物群落特征[D];華南理工大學(xué);2011年

4 謝建平;功能基因芯片（GeoChip）在兩種典型環(huán)境微生物群落分析中應(yīng)用的研究[D];中南大學(xué);2011年

5 肖升木;分子生態(tài)學(xué)技術(shù)在環(huán)境微生物群落與功能基因中的應(yīng)用研究[D];東華大學(xué);2010年

6 張衍;化工園區(qū)廢水排放對杭州灣納污區(qū)域微生物群落影響研究[D];清華大學(xué);2014年

7 劉學(xué)端;海底及污染環(huán)境中微生物群落分子多樣性研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 李林佳;青島市不同季節(jié)霧霾期與非霧霾期空氣微生物多樣性比較研究[D];青島理工大學(xué);2015年

2 陳棋炯;浸礦微生物群落基因組芯片的構(gòu)建與評估及其在酸性環(huán)境中的應(yīng)用[D];中南大學(xué);2008年

3 辛遠(yuǎn)征;黃河三角洲退化濕地微生物群落特性及影響因素初探[D];中國海洋大學(xué);2009年

4 吳彬;遼河三角洲影響甲烷產(chǎn)生與氧化的微生物群落研究[D];長春理工大學(xué);2013年

5 武麗婧;青島及黃海生物氣溶膠中微生物群落多樣性研究[D];中國海洋大學(xué);2014年

6 于政升;黃河蘭州段微生物群落功能和結(jié)構(gòu)在重金屬還原過程中的變化以及重金屬還原菌的篩選[D];蘭州大學(xué);2014年

7 盛華芳;基于BIPES分析微生物群落的生物信息學(xué)方法的建立[D];南方醫(yī)科大學(xué);2012年

8 胡海嘯;基于微生物群落特征的海岸帶生境診斷方法研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2014年

9 陳智學(xué);土霉素對酶活性及微生物群落代謝的影響[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2013年

10 劉麟;基于k-tuple頻度統(tǒng)計的微生物群落測序數(shù)據(jù)分析[D];廈門大學(xué);2014年

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