本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌潛伏感染相關(guān)蛋白Rv2004c的抗原表位預(yù)測

  更多相關(guān)文章： 結(jié)核分枝桿菌 Rvc 表位預(yù)測 生物信息學(xué)

【摘要】：本文應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測結(jié)核分枝桿菌潛伏感染相關(guān)蛋白Rv2004c的抗原表位,為結(jié)核病的診斷和疫苗研發(fā)篩選合適的抗原靶位。通過Blast分析發(fā)現(xiàn)Rv2004c蛋白與人類蛋白的同源性較低;采用DNAStar軟件包中的Protean軟件分析其二級結(jié)構(gòu)、親水性、抗原性、柔韌性及表面可能性,預(yù)測該蛋白有10個(gè)候選B細(xì)胞抗原表位;應(yīng)用RANKPEP及SYFPEITHI法預(yù)測該蛋白有37個(gè)候選Th細(xì)胞抗原表位,主要位于第200位氨基酸之后,其中HLA-DRB1*0401及HLA-DRB1*0701表型相對的表位數(shù)目較多且某些候選表位的主要組織相容性復(fù)合體(MHC)限制類型存在交叉重疊;應(yīng)用SYFPEITHI法、BIMAS法及NetCTL法預(yù)測該蛋白有10個(gè)候選細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞(CTL)表位,其中以HLA-A2限制性表位數(shù)目較多、分值較高。由此得出結(jié)論:Rv2004c蛋白含有較多潛在的T細(xì)胞和B細(xì)胞抗原表位,可作為新的結(jié)核病診斷試劑和疫苗研發(fā)的候選靶蛋白。
【作者單位】： 河北北方學(xué)院;解放軍第三O九醫(yī)院全軍結(jié)核病研究所全軍結(jié)核病防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/結(jié)核病診療新技術(shù)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 Rvc 表位預(yù)測 生物信息學(xué)
【基金】：國家重大傳染病防治科技重大專項(xiàng)基金資助項(xiàng)目(2012ZX10003008002) 軍隊(duì)醫(yī)學(xué)科技“十二五”重點(diǎn)資助項(xiàng)目(BWS11J050) 北京市科技創(chuàng)新基地培育與發(fā)展工程專項(xiàng)資助項(xiàng)目(Z141107004414021)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： 引言結(jié)核病是全世界范圍內(nèi)危害人類健康的主要傳染性疾病之一,是全世界由單一致病菌導(dǎo)致死亡最多的疾病,每年約導(dǎo)致150萬人死亡和超過900萬的新發(fā)結(jié)核病病例[1]。據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì),全世界約有1/3的人感染過結(jié)核分枝桿菌,大多數(shù)呈潛伏感染狀態(tài),潛伏感染者如不進(jìn)行治療,有5%~1

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本文編號：897059