本文關(guān)鍵詞：人星狀病毒臨床分離株感染CaCo-2細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組分析

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【摘要】：人星狀病毒(human astrovirus,HAstV)是引起嬰幼兒病毒性腹瀉的重要病原之一,但其致病機(jī)制及與宿主相互作用的數(shù)據(jù)非常有限。本研究旨在了解HAstV感染細(xì)胞后對宿主基因在轉(zhuǎn)錄水平上的影響。首先,利用臨床分離HAstV毒株感染CaCo-2細(xì)胞,用實時定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcriptasepolymerase chain reaction,RT-PCR)檢測細(xì)胞培養(yǎng)上清液中的病毒總RNA,結(jié)果顯示接種后9~24h病毒總RNA拷貝數(shù)明顯增加。然后,利用轉(zhuǎn)錄組測序全面比較感染與未感染HAstV的CaCo-2細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本,篩選兩者間的差異表達(dá)基因;并應(yīng)用KEGG信號通路富集性方法分析差異表達(dá)基因相關(guān)的信號通路。結(jié)果顯示,差異基因富集在兩條信號通路上(P0.05),分別為軸突導(dǎo)向通路和Ras信號通路。本研究首次利用深度測序技術(shù)分析了HAstV感染對宿主基因在轉(zhuǎn)錄水平上的影響,為進(jìn)一步研究HAstV致病機(jī)制等提供了方向。
【作者單位】： 上海市疾病預(yù)防控制中心;復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院教育部/衛(wèi)生部醫(yī)學(xué)分子病毒學(xué)重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 人星狀病毒 轉(zhuǎn)錄組測序 轉(zhuǎn)錄組
【基金】：“十二五”國家科技重大專項(2012ZX10004-211-03) 上海市第四輪公共衛(wèi)生三年行動計劃重點學(xué)科建設(shè)(15GWZK0101)
【分類號】：R373.2
【正文快照】： 人星狀病毒(human astrovirus,HAstV)是病毒性腹瀉的重要病原之一,可導(dǎo)致急性胃腸炎,主要感染5歲以下嬰幼兒,也可感染老人及免疫缺陷患者[1-4]。HAstV主要通過糞-口途徑傳播,既可引起散發(fā)性腹瀉,也可引起暴發(fā)性腹瀉,目前還沒有疫苗及有效藥物。HAstV是無包膜單股正鏈RNA病毒,

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 王永霞;段招軍;李宇寧;;人星狀病毒研究進(jìn)展[J];病毒學(xué)報;2012年04期

2 吳立夢;翁康生;陸曄;陳敏;吳凡;王文靜;;人星狀病毒1型衣殼蛋白原核表達(dá)、純化及多克隆抗體制備的研究[J];生物醫(yī)學(xué)工程與臨床;2012年03期

3 �？�;單思;巴彩鳳;;人星狀病毒Ⅰ型衣殼蛋白序列分析[J];解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2013年04期

4 ;[J];;年期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 向文龍;逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測人星狀病毒1型[D];南方醫(yī)科大學(xué);2010年

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本文編號：895345