發(fā)布時(shí)間：2017-09-13 07:41

  本文關(guān)鍵詞：一株柯薩奇病毒A9分離株的VP1基因遺傳特征分析

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【摘要】：目的分析引起病毒性腦炎(viral encephalitis,VE)的一株柯薩奇病毒(Coxsackievirus,CV)A9分離株(CVA9)的VP1基因遺傳特征。方法采用KMB17細(xì)胞對VE患兒糞便標(biāo)本進(jìn)行病毒分離,利用RT-PCR法從分離的病毒中擴(kuò)增VP1全基因,并測序,采用Mega 6.1和Geneious 5.6.5等軟件分析其序列,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果從5份VE患兒糞便中分離到一株人CVA9,命名為A108/YN/CHN/2009,其全長VP1基因的核苷酸長度與其他CVA9一致,均為906 bp。與中國其他分離株的核苷酸和氨基酸序列同源性分別為88.4%~98.2%和96.4%~99.3%,而與國外分離株的核苷酸和氨基酸序列同源性分別為81.0%~96.0%和92.7%~99.0%。在進(jìn)化樹上與其他中國分離株屬同一分支中不同兩個(gè)亞分支,與JB141230009親緣關(guān)系較近。結(jié)論 A108/YN/CHN/2009分離株為腸道病毒CVA9血清型,與其他中國分離株同屬一個(gè)基因簇。
【作者單位】： 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所云南省重大傳染病疫苗研發(fā)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 柯薩奇病毒A VP基因 遺傳特征
【基金】：云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究項(xiàng)目(2013FZ136)
【分類號】：R373.23;Q75
【正文快照】： 柯薩奇病毒A(Coxsackievirus A,CVA)屬于小RNA病毒科(Picornaviridae)腸道病毒屬(Enterovirus)。CVA可引起手足口病、無菌性腦炎、麻痹、肝炎、心肌炎和出疹等病癥[1]。CVA的衣殼由VP1~VP4結(jié)構(gòu)蛋白組成,而VP1與其分型相一致,已作為其遺傳特征分析的對象[2]。CVA9雖為CVA,但其

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