本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用16S rRNA高通量測(cè)序法比較人與常用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物口腔菌群的異同

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【摘要】：目的應(yīng)用16S rRNA高通量測(cè)序法測(cè)定幾種常用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物(西藏小型豬、比格犬、獼猴、新西蘭兔、Wistar大鼠)的口腔菌群,并和人的口腔菌群進(jìn)行對(duì)比分析,為口腔微生態(tài)的動(dòng)物模型研究提供基礎(chǔ)性資料。方法用一次性棉拭子采集西藏小型豬、比格犬、獼猴、新西蘭兔、Wistar大鼠和人的口腔菌群標(biāo)本,提取樣品總DNA,使用帶標(biāo)簽的通用引物擴(kuò)增16S rRNA V4區(qū)片段,Illumina測(cè)序,經(jīng)BIPES以及QIIME分析比較菌群多樣性及結(jié)構(gòu)。結(jié)果人與5種常用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物口腔菌群的豐富度均差異顯著(P0.05),不同種類動(dòng)物有其各自獨(dú)特的口腔菌群,但猴的口腔菌群與人最為相似。結(jié)論根據(jù)與人口腔某類菌群的相似程度,5種動(dòng)物中,猴口腔的梭菌屬(Fusobacterium)、卟啉菌屬(Porphyromonas)水平與人最相似,提示猴可能是研究人口腔菌群較適宜的模型動(dòng)物。從特定菌門(mén)角度,西藏小型豬可能是研究與變形菌門(mén)(Proteobacteria)相關(guān)疾病的較適宜模型動(dòng)物;比格犬可能是研究與螺旋體門(mén)(Spirochaetes)相關(guān)疾病的較適宜模型動(dòng)物。
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心;南方醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)院;廣東醫(yī)科大學(xué);南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)部;
【關(guān)鍵詞】： 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 口腔菌群 S rRNA 西藏小型豬 比格犬 獼猴 新西蘭兔 Wistar大鼠
【基金】：廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(編號(hào):2013B030300040,2015A030302076) 東莞松山湖高新區(qū)生物醫(yī)藥外包服務(wù)基地建設(shè)(編號(hào):2012B011000004)
【分類號(hào)】：R-332
【正文快照】： communities from those animals were compared with that of humans using BIPES and QIIME analysis after Illuminasequencing of 16S rRNA V4 fragments.Results The richness of the oral microbial communities of humans and the fivespecies of laboratory animals w

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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9 吳婭菲;楊美薷;肖曉蓉;蔣寒青;張舉之;;口腔菌群中螺旋體的分布[J];中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志;1990年01期

10 凌均h，

本文編號(hào)：758741