發(fā)布時間：2017-08-24 03:00

  本文關(guān)鍵詞：基于高通量測序的黑胸大蠊轉(zhuǎn)錄組分析

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【摘要】：目的利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù)獲得非模式生物黑胸大蠊的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),為今后開展分子生物學(xué)研究打下基礎(chǔ)。方法利用Illumina測序技術(shù)對黑胸大蠊Periplaneta fuliginosa進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。測序結(jié)果取閾值e≤10~(-10)在SwissProt、NR、KEGG、COG、GO和Pfam等公共序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。結(jié)果獲得黑胸大蠊轉(zhuǎn)錄組信息數(shù)據(jù)量13.63 G,39576個unigene,總長度32 297 597 bp,最長27 693 bp,平均長度816 bp。共獲得61 167個注釋結(jié)果。發(fā)現(xiàn)黑胸大蠊單核苷酸的多態(tài)性位點(SNP)置換33 955個,顛換16 561個,找到2 666個微衛(wèi)星序列。結(jié)論數(shù)量巨大的轉(zhuǎn)錄組信息為黑胸大蠊新基因的克隆和基因組學(xué)研究提供了有價值的信息。
【作者單位】： 浙江出入境檢驗檢疫局;溫州出入境檢驗檢疫局;西南大學(xué);
【關(guān)鍵詞】： 黑胸大蠊 高通量測序 轉(zhuǎn)錄組
【基金】：國家質(zhì)檢總局科技計劃項目(2015IK303) 浙江出入境檢驗檢疫局科技計劃項目(2015-ZKZ-02)
【分類號】：R384
【正文快照】： 黑胸大蠊(Periplaneta fuliginosa)是南方常見的大蠊種類,屬蜚蠊目(Blattodea),蜚蠊科(Blattidae),大蠊屬(Peripalneta),是我國重要的病媒生物。適應(yīng)能力、繁殖能力、行動能力很強,能機械攜帶痢疾桿菌、大腸桿菌等腸道病原菌、病毒、霉菌和蛔蟲卵,對公共衛(wèi)生安全造成影響[1]。

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 徐紹銳;汪世平;吳仕筠;肖小芹;曾少華;余俊龍;戴橄;羅臣;;黑胸大蠊室內(nèi)繁殖、發(fā)育的生物學(xué)特性研究[J];中國人獸共患病學(xué)報;2006年10期

2 柳建發(fā);汪世平;蔣雯雯;張R奸，

本文編號：728805