基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的馬爾尼菲青霉菌實(shí)時(shí)熒光定量PCR內(nèi)參基因篩選與鑒定
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更多相關(guān)文章: 馬爾尼菲青霉菌 內(nèi)參基因 實(shí)時(shí)熒光定量PCR DigA基因 FacpA基因
【摘要】:馬爾尼菲青霉菌是一種溫度依賴性雙相型條件致病真菌,可感染免疫缺陷人群,區(qū)域流行于東南亞地和我國南方,但其雙相轉(zhuǎn)換和致病性分子機(jī)制尚不清楚。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是馬爾尼菲青霉菌雙相轉(zhuǎn)換和致病性分子機(jī)制研究的重要手段,但仍缺乏用于馬爾尼菲青霉菌實(shí)時(shí)熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)化分析理想的內(nèi)參基因。本研究根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)篩選了四個(gè)表達(dá)最穩(wěn)定的Pfp、Rp123、FacpA、DigA基因與傳統(tǒng)的內(nèi)參基因18Sr RNA、β-actin(Act1)、β-tubulin(Btu)作為候選內(nèi)參基因,用Best Keeper和ge Norm軟件進(jìn)行基因表達(dá)穩(wěn)定性分析。結(jié)果表明FacpA和DigA基因在馬爾尼菲青霉菌雙相轉(zhuǎn)換過程中表達(dá)最為穩(wěn)定,可作為用于馬爾尼菲青霉菌實(shí)時(shí)熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)化分析的內(nèi)參基因。
【作者單位】: 廣西醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;廣西醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室;廣西高校基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣西高校生物分子醫(yī)學(xué)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣西醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室;廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院呼吸科;
【關(guān)鍵詞】: 馬爾尼菲青霉菌 內(nèi)參基因 實(shí)時(shí)熒光定量PCR DigA基因 FacpA基因
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81160195)資助
【分類號(hào)】:R379
【正文快照】: 馬爾尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM)是馬爾尼菲青霉病(Penicilliosis marneffei,PSM)的病原菌,是青霉屬中唯一的溫度依賴性雙相型真菌和機(jī)會(huì)性致病菌,在25℃時(shí)呈菌絲相,產(chǎn)生無性繁殖的分生孢子,37℃培養(yǎng)或感染人體后轉(zhuǎn)化為致病性酵母相,通過有絲分裂繁殖,區(qū)域性流行于東
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,本文編號(hào):683712
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