本文關(guān)鍵詞：戈登菌mmpL3同源基因序列分析及功能預(yù)測

  更多相關(guān)文章： 支氣管戈登菌 mmpL同源基因 生物信息學(xué)分析

【摘要】：目的分析支氣管戈登菌臨床株mmpL3(Rv0206c)同源基因(Gbro4481)序列,并預(yù)測其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及功能,為Gbro4481蛋白的進一步研究奠定基礎(chǔ)。方法根據(jù)全基因組測序結(jié)果和同源比對找到支氣管戈登菌的mmpL3同源基因,應(yīng)用expasy工具預(yù)測支氣管戈登菌MmpL3同源蛋白理化性質(zhì);利用Interproscan和Gene ontology工具對蛋白保守序列和功能進行預(yù)測;使用TMHMM在線工具進行拓撲結(jié)構(gòu)預(yù)測。結(jié)果篩選出MmpL3同源蛋白(Gbro4481),該蛋白含有2個膜轉(zhuǎn)運蛋白結(jié)構(gòu)域和1個固醇敏感多肽區(qū);TMHMM預(yù)測Gbro4481蛋白有10個跨膜區(qū)。結(jié)論支氣管戈登菌的Gbro4481蛋白與結(jié)核分枝桿菌H37Rv的mmpL3蛋白同源,是分枝菌酸的轉(zhuǎn)運蛋白,參與胞內(nèi)小分子的運輸和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。
【作者單位】： 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院;上海公共衛(wèi)生臨床中心;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫與微生物學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】： 支氣管戈登菌 mmpL同源基因 生物信息學(xué)分析
【基金】：武漢輕工大學(xué)研究生創(chuàng)新基金項目(No.2014cx019)
【分類號】：R378.91
【正文快照】： ***戈登菌與分枝桿菌同屬于抗酸染色陽性菌,且能引起疑似結(jié)核病的肺部感染,易誤診為結(jié)核病,且對抗結(jié)核藥多耐藥。近年來,武漢地區(qū)致病性戈登菌的感染呈逐漸上升的趨勢[1]。MmpL蛋白為分枝桿菌特有的一類蛋白,其中mmpL3基因編碼的膜蛋白參與分枝桿菌胞壁分枝菌酸的代謝,影響細

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 成軍,李克,王琳,陸蔭英,劉妍,王剛,張玲霞;牛丙型肝炎病毒核心蛋白結(jié)合蛋白6同源基因的克隆化研究[J];中國人獸共患病雜志;2003年05期

2 杜鵬程;張雯;劉翟;陳晨;;基于同源基因的病原菌鑒定和分型靶位點的功能基因組學(xué)研究[J];中國科學(xué):生命科學(xué);2011年08期

3 成軍,李克,王琳,劉妍,鐘彥偉,李莉;丙型肝炎病毒核心蛋白結(jié)合蛋白6猴同源基因N的克隆化與序列分析[J];中西醫(yī)結(jié)合肝病雜志;2003年06期

4 滿朝來;李響;曹敏;;雞Akirin同源基因的克隆與組織表達分析[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報;2011年01期

5 亓翠英,寧順斌,王寧,李立家,宋運淳;人類p53和c-myc同源基因在玉米穎果發(fā)育過程中的表達(英文)[J];遺傳學(xué)報;2003年09期

6 肖月華,侯磊,袁小紅,楊星勇,裴穎,羅小英,裴炎;植物Ⅴ類幾丁酶苦瓜同源基因(McChi5)的克隆及特征分析[J];遺傳學(xué)報;2002年11期

7 任新瑜;梁智勇;劉彤華;;DNA干擾——無啟動子同源基因片段對基因表達調(diào)控的作用[J];解剖學(xué)報;2008年01期

8 呂立夏,徐磊,楊翠香,李學(xué)禮,王堯;鴿左視網(wǎng)膜摘除視蓋的人TMEFF2同源基因差異表達[J];同濟大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2001年05期

9 蘭滿;劉英;石文偉;趙卉;許亮文;譚曉華;李金濤;孟強;石磊;楊磊;;漢族人群Trib1同源基因rs17321515多態(tài)性分布及其與血脂水平相關(guān)性研究[J];衛(wèi)生研究;2013年01期

10 鄒永華,倪斌,謝智群,葉志純;應(yīng)用同源基因定量PCR方法快速檢測Down綜合征[J];中國優(yōu)生與遺傳雜志;2001年02期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 張可浩;傅玉才;章家新;;單細胞原生動物陰道毛滴蟲中沉默信息調(diào)節(jié)因子2同源基因克隆及其原核表達[A];中國細胞生物學(xué)學(xué)會2005年學(xué)術(shù)大會、青年學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2005年

2 宋虎衛(wèi);;枇杷成花相關(guān)基因EJTFL1 cDNA的克隆與表達特性研究[A];中國遺傳學(xué)會第八次代表大會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要匯編（2004-2008）[C];2008年

3 李全梓;李興國;白書農(nóng);陸文j;張憲省;;風(fēng)信子(Hyacinthus orientalis)HAP2基因的克隆及功能分析[A];全國植物分子生物學(xué)與生物技術(shù)學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2000年

4 彭建宗;王小菁;;非洲菊PRGL基因的克隆和表達[A];中國植物學(xué)會七十五周年年會論文摘要匯編（1933-2008）[C];2008年

5 曹家樹;王玲平;葉紈芝;向s，

本文編號：676655