本文關(guān)鍵詞：人巨細(xì)胞病毒臨床株UL133基因序列遺傳變異分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的研究人巨細(xì)胞病毒(HCMV)臨床感染株的UL133基因序列特征。方法采集HCMV-DNA陽性者的臨床標(biāo)本,PCR擴(kuò)增UL133基因全序列,陽性擴(kuò)增產(chǎn)物克隆到pEASYTM載體后進(jìn)行序列測(cè)定,結(jié)合來自于NCBI數(shù)據(jù)庫的15條序列進(jìn)行UL133基因多態(tài)性分析。結(jié)果獲得20例HCMV感染者的UL133全長(zhǎng)序列。多態(tài)性分析顯示HCMV臨床株UL133基因核苷酸變異率為0~9.7%,氨基酸變異率為0~40.2%;不同感染者UL133序列5'端的第32-45位發(fā)生了相對(duì)集中的非同義突變,其他部分序列較少出現(xiàn)氨基酸缺失及錯(cuò)義突變。其中1例臨床感染者UL133序列在163-166位核苷酸出現(xiàn)移碼突變。綜合NCBI數(shù)據(jù)庫的15株序列分析顯示,UL133序列分為G1、G2、G3、G4、G5、G6等6個(gè)型,但未發(fā)現(xiàn)基因型與HCMV感染的臨床表現(xiàn)具有顯著關(guān)聯(lián)性。編碼蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)包括酪蛋白激酶磷酸化位點(diǎn)(CKP),蛋白激酶C位點(diǎn)(PKC)以及NLS_BP核定位信號(hào)(NLS_BP)。與Toledo株相比,有1株發(fā)生移碼突變,其他臨床株UL133基因編碼產(chǎn)物翻譯后修飾位點(diǎn)相對(duì)保守。結(jié)論 HCMV UL133基因核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列高度保守,但仍具有一定的多態(tài)性。這種多態(tài)性與HCMV感染臨床癥狀的關(guān)系尚待進(jìn)一步研究。
【作者單位】： 溫州醫(yī)科大學(xué)微生物學(xué)和免疫學(xué)教研室;溫州醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院;溫州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中心;溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【關(guān)鍵詞】： 人巨細(xì)胞病毒 UL基因 多態(tài)性
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81472308) 浙江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.LQ16H190003) 溫州市科技局項(xiàng)目(No.Y20170744) 浙江省大學(xué)生新苗計(jì)劃項(xiàng)目(No.2014R413058,2015R413069)
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 3溫州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中心,浙江溫州325035;4溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗(yàn)科,浙江溫州325000)***ymorphism of the UL133gene of HCMV and clinical symptoms of HCMV infection need to be investigated further.人巨細(xì)胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)屬于皰疹病毒

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本文編號(hào)：425344