人巨細胞病毒臨床株UL133基因序列遺傳變異分析
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【摘要】:目的研究人巨細胞病毒(HCMV)臨床感染株的UL133基因序列特征。方法采集HCMV-DNA陽性者的臨床標本,PCR擴增UL133基因全序列,陽性擴增產物克隆到pEASYTM載體后進行序列測定,結合來自于NCBI數據庫的15條序列進行UL133基因多態(tài)性分析。結果獲得20例HCMV感染者的UL133全長序列。多態(tài)性分析顯示HCMV臨床株UL133基因核苷酸變異率為0~9.7%,氨基酸變異率為0~40.2%;不同感染者UL133序列5'端的第32-45位發(fā)生了相對集中的非同義突變,其他部分序列較少出現氨基酸缺失及錯義突變。其中1例臨床感染者UL133序列在163-166位核苷酸出現移碼突變。綜合NCBI數據庫的15株序列分析顯示,UL133序列分為G1、G2、G3、G4、G5、G6等6個型,但未發(fā)現基因型與HCMV感染的臨床表現具有顯著關聯(lián)性。編碼蛋白翻譯后修飾位點包括酪蛋白激酶磷酸化位點(CKP),蛋白激酶C位點(PKC)以及NLS_BP核定位信號(NLS_BP)。與Toledo株相比,有1株發(fā)生移碼突變,其他臨床株UL133基因編碼產物翻譯后修飾位點相對保守。結論 HCMV UL133基因核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列高度保守,但仍具有一定的多態(tài)性。這種多態(tài)性與HCMV感染臨床癥狀的關系尚待進一步研究。
【作者單位】: 溫州醫(yī)科大學微生物學和免疫學教研室;溫州醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院;溫州醫(yī)科大學基礎醫(yī)學實驗中心;溫州醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院檢驗科;
【關鍵詞】: 人巨細胞病毒 UL基因 多態(tài)性
【基金】:國家自然科學基金項目(No.81472308) 浙江省自然科學基金項目(No.LQ16H190003) 溫州市科技局項目(No.Y20170744) 浙江省大學生新苗計劃項目(No.2014R413058,2015R413069)
【分類號】:R373
【正文快照】: 3溫州醫(yī)科大學基礎醫(yī)學實驗中心,浙江溫州325035;4溫州醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院檢驗科,浙江溫州325000)***ymorphism of the UL133gene of HCMV and clinical symptoms of HCMV infection need to be investigated further.人巨細胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)屬于皰疹病毒
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