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云南省惡性瘧原蟲青蒿素耐藥性相關(guān)基因K13 kelch結(jié)構(gòu)域序列多態(tài)性的分析

發(fā)布時(shí)間:2017-06-05 19:10

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【摘要】:目的分析云南省惡性瘧現(xiàn)癥病例中惡性瘧原蟲(Plasmodium falciparum)K13基因kelch結(jié)構(gòu)域的序列多態(tài)性,為掌握云南省惡性瘧青蒿素耐藥性提供依據(jù)。方法2013年1月-2015年12月,從云南省16個(gè)州(市)收集惡性瘧現(xiàn)癥病例的濾紙血樣和相關(guān)信息,通過流行病學(xué)調(diào)查判定其感染來源,根據(jù)中國疾病預(yù)防控制信息系統(tǒng)疫情登記確認(rèn)病例發(fā)現(xiàn)地。使用巢式PCR擴(kuò)增惡性瘧原蟲K13基因kelch結(jié)構(gòu)域并測序,與惡性瘧原蟲標(biāo)準(zhǔn)株3D7(PF3D7_1343700)序列進(jìn)行比對。使用Mega 5.04分析序列多態(tài),計(jì)算序列間變異位點(diǎn)、遺傳距離等,計(jì)算氨基酸突變位點(diǎn)構(gòu)成比并進(jìn)行χ~2檢驗(yàn)。結(jié)果2013-2015年共收集惡性瘧現(xiàn)癥病例血樣202例,190例為輸入性病例,12例為云南本地感染病例,各年的病例構(gòu)成比分別為30.7%(62/202)、34.2%(69/202)和35.1%(71/202),呈逐年增多趨勢。192例血樣K13基因kelch結(jié)構(gòu)域巢式擴(kuò)增陽性,190例測序成功,66例存在K13基因錯(cuò)義突變,突變率為34.7%(66/190)。各年的突變病例檢出構(gòu)成比分別為40.9%(27/66)、37.9%(25/66)和21.2%(14/66),呈逐年減少趨勢。共檢出F446I、A578S、N458Y、P574L、A676D、G449A、C469Y、V566I、E556D和S16L等10種突變型,突變率最高的為F446I,占72.7%(48/66)。F446I突變型在18~56歲、農(nóng)民、感染地為東南亞等病例中的檢出比例分別為58.3%(28/48)、70.8%(34/48)和91.7%(44/48),高于同組其他病例的41.7%(20/48)、29.2%(14/48)和8.3%(4/48)(χ~2=4.633、5.556、5.152,P0.05)。190例K13基因kelch結(jié)構(gòu)域的同源性片段為248 bp,其中保守位點(diǎn)占94.8%(235/248),變異位點(diǎn)占5.2%(13/248),簡約信息位點(diǎn)占2.0%(5/248),單態(tài)位點(diǎn)占3.2%(8/248)。190例DNA序列間遺傳距離為0.000~0.036,平均為(0.001±0.001)。結(jié)論云南省惡性瘧現(xiàn)癥病例的K13基因kelch結(jié)構(gòu)域存在10種突變型,以F446I位點(diǎn)突變最常見。
【作者單位】: 大理大學(xué)病原與媒介生物研究所普洱分部;云南省寄生蟲病防治所 云南省瘧疾研究中心 云南省蟲媒傳染病防控研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】惡性瘧原蟲 青蒿素 耐藥性 基因 多態(tài) 分析 云南省
【基金】:國家自然科學(xué)基金國際(地區(qū))合作與交流項(xiàng)目(No.81220108019);國家自然科學(xué)基金地區(qū)科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81660559) 云南省科技項(xiàng)目應(yīng)用基礎(chǔ)計(jì)劃青年項(xiàng)目(No.Y0120150295)~~
【分類號】:R382.31
【正文快照】: 自20世紀(jì)60、70年代起,一些瘧疾地方性流行區(qū)逐漸出現(xiàn)耐藥性瘧原蟲,并呈迅速蔓延的趨勢[1]。迄今,已發(fā)現(xiàn)惡性瘧原蟲(Plasmodium falciparum)對所有抗瘧藥產(chǎn)生了不同程度的耐藥性。云南是全球繼南美、東南亞之后發(fā)現(xiàn)的抗氯喹惡性瘧長期流行地區(qū)之一[2-5],至1983年,抗氯喹惡性瘧

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