發(fā)布時間：2017-06-04 03:12

  本文關鍵詞：腸致病性大腸埃希菌EPEC Deng致病島基因進化特點，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的分析腸致病性大腸埃希菌(EPEC)致病島(PAIs)基因進化特點。方法 EPEC Deng分離自我國嬰幼兒腹瀉患者糞便標本,鑒定該菌株血清型并進行藥敏試驗;采用Illumina 2000儀器對菌株進行全基因序列測序,PHAST軟件定位菌株原噬菌體(prophages,PPs)在染色體中的位置,MUMmer軟件進行共線性分析,構建系統(tǒng)發(fā)育樹,了解同源基因進化規(guī)律。應用PAI_finder軟件對基因組進行PAIs預測,了解PAIs核心區(qū)域(LEE)和核心基因同源進化規(guī)律,并進行遺傳多態(tài)性分析。結果 EPEC Deng菌株歸屬O119∶H6,藥敏結果顯示該菌株對環(huán)丙沙星、左氧氟沙星及氨芐西林耐藥,對其余的抗菌藥物均敏感�；蚪M(染色體)序列大小為5 025 482 bp(GC含量為50.52%),質粒序列大小為207 564 bp(GC含量為49.50%)。共找到17個PPs,系統(tǒng)發(fā)育樹分析發(fā)現(xiàn),EPEC Deng株基因組與O26∶H11、O111∶H同源性較高;EPEC Deng株PAIs和核心基因均與RDEC-1和O26∶H413/89-1株具有高同源性;遺傳多樣性分析結果顯示,緊密素(eae)及其受體(tir)多態(tài)性豐富,π值均0.10,Ⅲ型分泌系統(tǒng)(TTSS)分泌蛋白相對穩(wěn)定。結論此研究明確了EPEC Deng株基因組及PAIs的進化特點,有助于了解了本土分離的EPEC基因特點。
【作者單位】： 廣東醫(yī)學院附屬深圳市南山區(qū)人民醫(yī)院深圳市內源性感染診治重點實驗室;
【關鍵詞】： 腸致病性大腸埃希菌 高通量測序 全基因組序列 致病島 核心基因 同源性
【基金】：國家自然科學基金(81170370/H0312) 深圳市科創(chuàng)委項目(JCYJ20130402151227180) 深圳市衛(wèi)人委項目(201203203;201203211;201302199;201303186;201401083;201401084;201402130;201402131;201402133) 深圳市醫(yī)學重點學科經費資助
【分類號】：R378
【正文快照】： [Chin J Infect Control,2016,15(1):1-9]大腸埃希菌是目前腸道最常見的致病菌之一,而腸致病性大腸埃希菌(enteropathogenic Esche-richia coli,EPEC)是引起全球嬰幼兒腹瀉和成人散發(fā)性腹瀉的重要病原菌之一[1-4],目前未見我國EPEC全基因序列及基因結構特點的分析報道。近年,

【相似文獻】

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本文編號：419867