目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析hsa-miR-206序列,并進(jìn)行靶基因功能富集分析、信號(hào)通路富集分析,靶基因編碼蛋白相互作用分析,為后續(xù)研究其功能提供理論基礎(chǔ)。方法通過(guò)miRbase、Target Scan、DIANA-microT、MiRDB據(jù)庫(kù)、VENN在線工具、DAVID在線數(shù)據(jù)庫(kù)、STRING數(shù)據(jù)庫(kù)及Cytoscape軟件等在線工具分析hsa-miR-206序列及保守性,預(yù)測(cè)其靶基因,對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行功能富集分析(GO分析)、KEGG通路富集分析,并篩選出關(guān)鍵基因。結(jié)果 hsa-miR-206序列在各物種間高度保守,GO分析發(fā)現(xiàn)hsa-miR-206靶基因功能主要富集在生物合成調(diào)節(jié)、有機(jī)物代謝過(guò)程調(diào)節(jié)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)等生物學(xué)過(guò)程,KEGG分析表明主要參與Wnt信號(hào)通路、T細(xì)胞受體信號(hào)通路、癌癥通路等。蛋白互作顯示編碼蛋白間存在復(fù)雜的相互作用,與hsa-miR-206關(guān)系最密切的蛋白有27個(gè),如天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸-天冬氨酸盒解螺旋酶5(DDX5)、人遠(yuǎn)端上游原件結(jié)合蛋白(FUBP1)、天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸-組氨酸盒解螺旋酶15(DHX15)等。結(jié)論 hsa-miR-206可能參...

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【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 miR-206的序列保守性分析
    1.2 miR-206的靶基因預(yù)測(cè)
    1.3 miR-206靶基因的GO功能注釋及KEGG通路富集分析
    1.4 關(guān)鍵靶基因篩選
2 結(jié)果
    2.1 miR-206的染色體定位及序列保守性分析
    2.2 hsa-miR-206的靶基因預(yù)測(cè)結(jié)果
    2.3 hsa-miR-206靶基因GO功能注釋和KEGG通路富集分析
    2.4 miR-206預(yù)測(cè)靶基因所編碼蛋白質(zhì)間的相互作用分析
3 討論



本文編號(hào)：3737402