目的研究L02/HBx細胞與L02/pcDNA3.0細胞的長鏈非編碼RNA（lncRNA）表達譜,對差異基因進行初步生物信息學(xué)分析。 方法選取實驗組L02/HBx,對照組轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒的L02細胞（L02/pcDNA3.0）作為實驗對象,分別提取兩組細胞的總RNA并純化,檢驗RNA質(zhì)量,反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,并合成生物素標記的cRNA探針。利用lncRNA芯片技術(shù)檢測兩組的lncRNAs和mRNAs表達譜的差異,經(jīng)過對原始數(shù)據(jù)進行預(yù)處理、均一化后,篩選出差異表達的lncRNAs和mRNAs,進行統(tǒng)計學(xué)分析。分別選取上調(diào)的lncRNA4個：TCONS₀0006195, ENST00000557524, NR₀37597, ENST00000539975,下調(diào)的lncRNA3個：ENST00000508424, ENST00000447433, uc0011va.4,采用SYBRGREEN I實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)（RT-PCR）在兩細胞株中驗證,并用GAPDH做內(nèi)參。綜合NCBI RefSeq, UCSC, RNAdb, lncRNAs等數(shù)據(jù)... 

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
符號說明
前言
第一部分 L02/HBx細胞的lncRNA芯片結(jié)果分析
    1 材料及方法
        1.1 實驗對象
        1.2 儀器
        1.3 試劑
        1.4 實驗方法和技術(shù)
    2 實驗結(jié)果
        2.1 RNA質(zhì)量控制
        2.2 lncRNA芯片結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
第二部分 L02/HBx細胞與L02/pcDNA3.0細胞差異表達lncRNA的實時熒光定量PCR驗證
    1 材料和方法
    2 實驗結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
第三部分 L02/HBx與L02/pcDNA3.0差異表達基因的初步生物信息學(xué)研究
    1 材料和方法
    2 實驗結(jié)果
        2.1 差異表達基因在基因本體論三個功能方面的富集表達譜
        2.2 差異表達mRNA數(shù)據(jù)KEGG生物學(xué)通路分析
    3 討論
    4 結(jié)論
參考文獻
附錄
綜述
    參考文獻
攻讀學(xué)位期間主要的研究成果
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3684224