銅綠假單胞菌調(diào)節(jié)蛋白VqsR、Arr及T3SS系統(tǒng)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白PopB/D的結(jié)構(gòu)與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-22 06:48
銅綠假單胞菌是一種十分常見(jiàn)的條件性致病菌,當(dāng)身體存在傷口或者免疫力比較低的時(shí)候,它才會(huì)感染和致病,而且非常難以除去,產(chǎn)生慢性感染最終可能導(dǎo)致死亡。因?yàn)樗菀赘腥緜?因此是醫(yī)院手術(shù)和一些治療后感染的一個(gè)主要來(lái)源,并常存在于患有囊性纖維化個(gè)體中引起肺部感染。群體效應(yīng)是細(xì)胞間的一種交流,可以使細(xì)菌根據(jù)細(xì)胞的濃度來(lái)調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。群體效應(yīng)途徑中包含大量的調(diào)節(jié)子,這些調(diào)節(jié)子可以控制很多毒性因子的表達(dá),使得病原體能夠適應(yīng)各種環(huán)境,抵抗各種治療方式。在銅綠假單胞菌中有l(wèi)as和rhl兩個(gè)主要的群體效應(yīng)系統(tǒng),并且las系統(tǒng)會(huì)正向調(diào)節(jié)rhl系統(tǒng),形成層級(jí)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。細(xì)菌雖然是一個(gè)個(gè)結(jié)構(gòu)比較簡(jiǎn)單的個(gè)體,但通常它們不會(huì)單獨(dú)生存,大部分的都是聚集在一起相互影響共同生存,其中一種常見(jiàn)的存在方式就是生物膜。形成生物膜后,菌落對(duì)抗生素等藥物的抵抗能力會(huì)明顯的增強(qiáng)。環(huán)二鳥(niǎo)苷酸(C-di-GMP)是各種調(diào)控的一個(gè)第二信使小分子,在細(xì)菌中存在廣泛,其中一個(gè)方面就是可以調(diào)節(jié)生物膜的形成。主要由鳥(niǎo)苷酸環(huán)化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)催化它的合成和分解,其中EAL domain是分解C-di-GMP的一種PDE酶,可以將...
【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號(hào)說(shuō)明
第1章 前言
1.1 銅綠假單胞菌
1.1.1 銅綠假單胞菌的介紹
1.1.2 群體效應(yīng)
1.1.3 生物膜
1.2 第二信使C-di-GMP
1.3 T3SS分泌系統(tǒng)
1.4 課題研究主要內(nèi)容
第2章 蛋白質(zhì)VqsR的結(jié)構(gòu)與功能研究
2.1 蛋白質(zhì)VqsR
2.2 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.1 菌種和質(zhì)粒載體
2.2.2 常用工具酶和試劑
2.2.3 配制試劑
2.2.4 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 蛋白質(zhì)VqsR的相關(guān)克隆
2.3.2 蛋白質(zhì)表達(dá)純化
2.3.3 蛋白質(zhì)的結(jié)晶和優(yōu)化
2.3.4 蛋白質(zhì)晶體的衍射和數(shù)據(jù)收集
2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 VqsR全長(zhǎng)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.2 VqsR1-193的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.3 VqsR的其他實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5 本章小結(jié)
第3章 膜蛋白Arr的結(jié)構(gòu)與功能研究
3.1 膜蛋白Arr
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 膜蛋白Arr的相關(guān)克隆
3.2.2 膜蛋白Arr的表達(dá)純化
3.2.3 膜蛋白Arr和EAL domain的結(jié)晶
3.2.4 膜蛋白Arr和EAL domain的酶活實(shí)驗(yàn)
3.2.5 膜蛋白Arr和EAL domain的其他實(shí)驗(yàn)
3.3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 膜蛋白Arr全長(zhǎng)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.2 EAL domain的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.3 膜蛋白Arr周質(zhì)空間結(jié)構(gòu)域?qū)嶒?yàn)結(jié)果
3.3.4 膜蛋白Arr的其他實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4 本章小結(jié)
第4章 膜蛋白PopB/D的結(jié)構(gòu)與功能研究
4.1 膜蛋白PopB和PopD
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.1 膜蛋白PopD的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.2 膜蛋白PopB的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.4 本章小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
學(xué)化論文評(píng)閣及答辯情況表
本文編號(hào):3601734
【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
符號(hào)說(shuō)明
第1章 前言
1.1 銅綠假單胞菌
1.1.1 銅綠假單胞菌的介紹
1.1.2 群體效應(yīng)
1.1.3 生物膜
1.2 第二信使C-di-GMP
1.3 T3SS分泌系統(tǒng)
1.4 課題研究主要內(nèi)容
第2章 蛋白質(zhì)VqsR的結(jié)構(gòu)與功能研究
2.1 蛋白質(zhì)VqsR
2.2 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.1 菌種和質(zhì)粒載體
2.2.2 常用工具酶和試劑
2.2.3 配制試劑
2.2.4 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 蛋白質(zhì)VqsR的相關(guān)克隆
2.3.2 蛋白質(zhì)表達(dá)純化
2.3.3 蛋白質(zhì)的結(jié)晶和優(yōu)化
2.3.4 蛋白質(zhì)晶體的衍射和數(shù)據(jù)收集
2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 VqsR全長(zhǎng)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.2 VqsR1-193的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.3 VqsR的其他實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5 本章小結(jié)
第3章 膜蛋白Arr的結(jié)構(gòu)與功能研究
3.1 膜蛋白Arr
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 膜蛋白Arr的相關(guān)克隆
3.2.2 膜蛋白Arr的表達(dá)純化
3.2.3 膜蛋白Arr和EAL domain的結(jié)晶
3.2.4 膜蛋白Arr和EAL domain的酶活實(shí)驗(yàn)
3.2.5 膜蛋白Arr和EAL domain的其他實(shí)驗(yàn)
3.3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 膜蛋白Arr全長(zhǎng)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.2 EAL domain的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.3 膜蛋白Arr周質(zhì)空間結(jié)構(gòu)域?qū)嶒?yàn)結(jié)果
3.3.4 膜蛋白Arr的其他實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4 本章小結(jié)
第4章 膜蛋白PopB/D的結(jié)構(gòu)與功能研究
4.1 膜蛋白PopB和PopD
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.1 膜蛋白PopD的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.2 膜蛋白PopB的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.4 本章小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
學(xué)化論文評(píng)閣及答辯情況表
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