目的：造血干細胞（Hematopoietic stem cell, HSC）是一類血液系統(tǒng)成體干細胞,具有長期自我更新的能力和分化成各類成熟血細胞的潛能。造血干細胞命運維持與轉(zhuǎn)化機制的研究,對血液疾病的預(yù)防、診斷和治療具有重要意義,然而這些機制至今仍未被闡明。本研究通過分析基因表達芯片數(shù)據(jù)尋找造血干細胞與分化、衰老和疾病相關(guān)的關(guān)鍵基因及其重要功能通路,為進一步探討造血干細胞維持與轉(zhuǎn)化機制和尋找新的疾病治療靶點奠定基礎(chǔ)。方法：（1）轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)選取自GEO數(shù)據(jù)庫中造血干細胞差異基因表達譜數(shù)據(jù)。（2）采用編程方法對芯片的原始圖像信號進行預(yù)處理,從而得到數(shù)據(jù)集中有效探針的表達值。（3）選擇基于倍數(shù)變化的RankProd算法進行統(tǒng)計分析,獲得顯著差異表達的基因（DEGs）。（4）基于DAVID在線工具進行DEGs的功能注釋與通路富集分析。（5）通過GeneMANIA在線工具構(gòu)建以功能基因為節(jié)點的差異表達基因的共表達網(wǎng)絡(luò)、物理互作網(wǎng)絡(luò)；（6）通過StemCellNet在線工具發(fā)現(xiàn)可能與細胞干性相關(guān)（linked to sternness）的基因。結(jié)果：（1）分別獲得造血干細胞的分化、衰老和疾病相關(guān)... 

【文章來源】：北京交通大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

HSC分化數(shù)據(jù)集差異表達基因聚類結(jié)果

圖7. AML-HSC數(shù)據(jù)集差異表達基因聚類結(jié)果Figure 7. AML-HSC dataset DEG heat map圖中方格顏色由綠到紅表示表達值由低到高；橫向分類軸中，紅色表示正常HSC,綠色表示AML-HSC;縱向分類中紅色表示上調(diào)基閃。聚類圖具

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3459662