目的：造血干細(xì)胞（Hematopoietic stem cell, HSC）是一類(lèi)血液系統(tǒng)成體干細(xì)胞,具有長(zhǎng)期自我更新的能力和分化成各類(lèi)成熟血細(xì)胞的潛能。造血干細(xì)胞命運(yùn)維持與轉(zhuǎn)化機(jī)制的研究,對(duì)血液疾病的預(yù)防、診斷和治療具有重要意義,然而這些機(jī)制至今仍未被闡明。本研究通過(guò)分析基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù)尋找造血干細(xì)胞與分化、衰老和疾病相關(guān)的關(guān)鍵基因及其重要功能通路,為進(jìn)一步探討造血干細(xì)胞維持與轉(zhuǎn)化機(jī)制和尋找新的疾病治療靶點(diǎn)奠定基礎(chǔ)。方法：（1）轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)選取自GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中造血干細(xì)胞差異基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。（2）采用編程方法對(duì)芯片的原始圖像信號(hào)進(jìn)行預(yù)處理,從而得到數(shù)據(jù)集中有效探針的表達(dá)值。（3）選擇基于倍數(shù)變化的RankProd算法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,獲得顯著差異表達(dá)的基因（DEGs）。（4）基于DAVID在線(xiàn)工具進(jìn)行DEGs的功能注釋與通路富集分析。（5）通過(guò)GeneMANIA在線(xiàn)工具構(gòu)建以功能基因?yàn)楣?jié)點(diǎn)的差異表達(dá)基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)、物理互作網(wǎng)絡(luò)；（6）通過(guò)StemCellNet在線(xiàn)工具發(fā)現(xiàn)可能與細(xì)胞干性相關(guān)（linked to sternness）的基因。結(jié)果：（1）分別獲得造血干細(xì)胞的分化、衰老和疾病相關(guān)... 

【文章來(lái)源】：北京交通大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：58 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

HSC分化數(shù)據(jù)集差異表達(dá)基因聚類(lèi)結(jié)果

圖7. AML-HSC數(shù)據(jù)集差異表達(dá)基因聚類(lèi)結(jié)果Figure 7. AML-HSC dataset DEG heat map圖中方格顏色由綠到紅表示表達(dá)值由低到高；橫向分類(lèi)軸中，紅色表示正常HSC,綠色表示AML-HSC;縱向分類(lèi)中紅色表示上調(diào)基閃。聚類(lèi)圖具

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Web Resources for Stem Cell Research[J]. Ting Wei,Xing Peng,Lili Ye,Jiajia Wang,Fuhai Song,Zhouxian Bai,Guangchun Han,Fengmin Ji,Hongxing Lei.  Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(01)
[2]FK506和CSA對(duì)異體造血干細(xì)胞在粒單白血病小鼠存活及其血清IL-2和IL-4水平的影響[J]. 陳靜,李春富.  四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2009(03)



本文編號(hào)：3459662