高原肺水腫大鼠肺組織差異表達microRNA的篩
發(fā)布時間:2021-07-31 08:37
目的篩選高原肺水腫大鼠肺組織差異表達microRNA(miRNA),并分析其生物學(xué)功能。方法將大鼠隨機分為對照組和低氧24、48、72 h組,每組6只。低氧組建立大鼠高原肺水腫模型。各組處死后提取大鼠肺組織。利用miRNA 4. 0-Rat芯片篩選出低氧組與對照組大鼠肺組織差異表達miRNA,采用miRanda和Target Scan兩個數(shù)據(jù)庫對篩選出的差異表達miRNA進行靶基因預(yù)測,并對其進行基因本體功能分析和信號通路分析。實時熒光定量PCR檢測四組高原肺水腫大鼠肺組織中篩選出來相對表達強度上調(diào)、下調(diào)最為明顯基因。結(jié)果以差異表達倍數(shù)(FC值)>2. 0為準(zhǔn),高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA 14種,上調(diào)的5種,下調(diào)的9種,其中持續(xù)上調(diào)的有rno-miR-344g、rno-miR-541-5p,下調(diào)的有rno-miR-3556b、rno-miR-101a-5p、rno-miR-361-3p。14種差異miRNA之間存在多個相互關(guān)聯(lián)的靶基因如Med22、Plekhh2、Parg、Rora、Lrch1、Slcla2等。在生物學(xué)過程方面,差異表達miRNA主要參與核酸的調(diào)控、蛋...
【文章來源】:山東醫(yī)藥. 2020,60(06)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 動物、試劑、儀器
1.2 高原肺水腫大鼠模型建立及鑒定
1.3 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA篩選、靶基因預(yù)測及其相互作用分析
1.4 大鼠肺組織差異表達miRNA基因本體功能(GO)及信號通路分析
1.5 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA檢測
1.6 統(tǒng)計學(xué)方法
2 結(jié)果
2.1 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA
2.2 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA靶基因預(yù)測結(jié)果及其對靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
2.3 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA的基因本體功能及信號通路
2.4 四組關(guān)鍵差異miRNA比較
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]初次進入高原人群發(fā)生急性重型高原病危險因素的Logistic回歸分析[J]. 張西南,洛桑,李雪梅,雷聯(lián)會. 高原醫(yī)學(xué)雜志. 2018(03)
[2]PI3K/Akt信號通路上調(diào)急性肺損傷大鼠肺泡上皮鈉通道表達[J]. 鄧旺,王導(dǎo)新,鄧嘉,朱濤. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2012(09)
本文編號:3313136
【文章來源】:山東醫(yī)藥. 2020,60(06)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 動物、試劑、儀器
1.2 高原肺水腫大鼠模型建立及鑒定
1.3 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA篩選、靶基因預(yù)測及其相互作用分析
1.4 大鼠肺組織差異表達miRNA基因本體功能(GO)及信號通路分析
1.5 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA檢測
1.6 統(tǒng)計學(xué)方法
2 結(jié)果
2.1 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA
2.2 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA靶基因預(yù)測結(jié)果及其對靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
2.3 高原肺水腫大鼠肺組織差異表達miRNA的基因本體功能及信號通路
2.4 四組關(guān)鍵差異miRNA比較
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]初次進入高原人群發(fā)生急性重型高原病危險因素的Logistic回歸分析[J]. 張西南,洛桑,李雪梅,雷聯(lián)會. 高原醫(yī)學(xué)雜志. 2018(03)
[2]PI3K/Akt信號通路上調(diào)急性肺損傷大鼠肺泡上皮鈉通道表達[J]. 鄧旺,王導(dǎo)新,鄧嘉,朱濤. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2012(09)
本文編號:3313136
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