不同鼠種的腸道菌群在不同飲食結(jié)構(gòu)干預(yù)中的組成改變
發(fā)布時(shí)間:2021-05-09 16:02
目的:采取454高通量測(cè)序方法對(duì)不同飲食結(jié)構(gòu)喂養(yǎng)的不同鼠種腸道菌群進(jìn)行分析,觀察并闡明不同的飲食結(jié)構(gòu)下腸道多樣性及群落結(jié)構(gòu)的組成差異,同時(shí)進(jìn)一步比較飲食對(duì)腸道菌群的影響在不同鼠種之間是否存在種屬差異,為研究不同人種在同種飲食結(jié)構(gòu)下在肥胖、炎癥性腸病等的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)上仍存在差異的原因提供線索。方法:選取仍處于腸道菌群建立階段的剛斷乳Bal20b/c小鼠及SD大鼠作為研究載體,采取為期2個(gè)月的五種特制的不同結(jié)構(gòu)飲食干預(yù)方法,收集各個(gè)飲食組新鮮糞便樣品,提取糞便細(xì)菌總基因組DNA,對(duì)細(xì)菌16SrRNA基因序列V1-V3高變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物并切膠回收純化。定量檢測(cè)PCR產(chǎn)物,按照每個(gè)樣品的測(cè)序量要求,進(jìn)行相應(yīng)比例的混合。寄往中國(guó)上海美吉生物醫(yī)藥科技公司進(jìn)行454GS20FLX測(cè)序。結(jié)果:多樣性分析結(jié)果顯示,同一鼠種不同飲食組腸道菌群多樣性存在差異,同時(shí),同種飲食干預(yù)對(duì)腸道菌群多樣性的影響在兩種鼠種中也存在差異。Bal20b/c小鼠高脂組腸道菌群多樣性最高,顯著高于高纖維組、高蛋白組(P<0.05)。SD大鼠高蛋白組腸道菌群多樣性最高,但無(wú)論是Bal20b/c小鼠還是SD大...
【文章來(lái)源】:中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
1 前言
1.1 飲食對(duì)腸道菌群的影響
1.2 研究飲食、腸道菌群及健康之間關(guān)系的策略
2 材料及方法
2.1 主要儀器和設(shè)備
2.2 試劑與材料
3 對(duì)象與分組
3.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.2 飼料及配方
3.3 動(dòng)物分組及干預(yù)
4 實(shí)驗(yàn)方法
4.1 動(dòng)物喂養(yǎng)
4.2 動(dòng)物糞便的收集
4.3 糞便細(xì)菌基因組總DNA的提取—QIAampDNA stool mini kit法
4.4 16SrRNA基因序列V1-V3高變區(qū)PCR擴(kuò)增
4.5 PCR產(chǎn)物的定量、混勻及454焦磷酸測(cè)序
4.6 序列的生物信息分析
5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
6. 結(jié)果與分析
6.1 豐度與多樣性分析
6.2 分類學(xué)分析
7 討論
7.1 腸道菌群微生物非培養(yǎng)研究方法
7.2 不同飲食組腸道菌群多樣性分析
7.3 不同飲食組大小鼠各分類學(xué)水平上菌群組成差異
8 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
References
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Probiotics20and20prebiotics20in20chronic20inflammatory20bowel20diseases[J]. Julia B Ewaschuk,Levinus A Dieleman. World Journal of Gastroenterology. 2006(37)
本文編號(hào):3177600
【文章來(lái)源】:中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
1 前言
1.1 飲食對(duì)腸道菌群的影響
1.2 研究飲食、腸道菌群及健康之間關(guān)系的策略
2 材料及方法
2.1 主要儀器和設(shè)備
2.2 試劑與材料
3 對(duì)象與分組
3.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.2 飼料及配方
3.3 動(dòng)物分組及干預(yù)
4 實(shí)驗(yàn)方法
4.1 動(dòng)物喂養(yǎng)
4.2 動(dòng)物糞便的收集
4.3 糞便細(xì)菌基因組總DNA的提取—QIAampDNA stool mini kit法
4.4 16SrRNA基因序列V1-V3高變區(qū)PCR擴(kuò)增
4.5 PCR產(chǎn)物的定量、混勻及454焦磷酸測(cè)序
4.6 序列的生物信息分析
5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
6. 結(jié)果與分析
6.1 豐度與多樣性分析
6.2 分類學(xué)分析
7 討論
7.1 腸道菌群微生物非培養(yǎng)研究方法
7.2 不同飲食組腸道菌群多樣性分析
7.3 不同飲食組大小鼠各分類學(xué)水平上菌群組成差異
8 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
References
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Probiotics20and20prebiotics20in20chronic20inflammatory20bowel20diseases[J]. Julia B Ewaschuk,Levinus A Dieleman. World Journal of Gastroenterology. 2006(37)
本文編號(hào):3177600
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