海南省百歲老人隊(duì)列的建立與長壽相關(guān)腸道宏基因組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-04-26 20:39
目的通過建立海南省百歲老人隨訪隊(duì)列并分析其腸道菌群結(jié)構(gòu)變化,揭示百歲老人由健康狀態(tài)至死亡前的這一生命周期特定階段的腸道菌群變化規(guī)律,探討腸道菌群在維系百歲老人身體健康方面可能的作用及影響,以及腸道菌群變化與死亡進(jìn)程之間可能的互相影響,為長壽狀態(tài)的保持提供新的思路和途徑。方法1.采用前瞻性研究的方法,隨機(jī)選取海南省146名健康百歲以上老人建立隨訪隊(duì)列。對澄邁、儋州地區(qū)64名老人進(jìn)行為期15個(gè)月,間隔3個(gè)月的健康狀態(tài)隨訪,并收集糞便及血液標(biāo)本直至死亡。2.通過自身對照的方法,分別對4名百歲老人臨去世前6個(gè)月(Predeath6)和去世前(Death)兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)的腸道菌群進(jìn)行宏基因組測序研究。3.利用隨機(jī)森林算法建立預(yù)測模型,尋找百歲老人臨去世前相關(guān)的顯著差異菌作為生物標(biāo)記,對百歲老人的身體衰亡狀態(tài)(即:瀕臨去世狀態(tài))進(jìn)行預(yù)測。結(jié)果1.本隊(duì)列研究始于2016年8月,入組百歲老人平均年齡為105.2±3.1歲,截至本論文完成時(shí)(2018年1月),共有15位老人達(dá)到隨訪終點(diǎn)(去世),其平均去世年齡為105.6±2.9歲,一年期死亡率為17.2%,氣候因素對生存期有影響(P<0.05),性別...
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 百歲老人隊(duì)列情況
一、實(shí)驗(yàn)對象
1. 試驗(yàn)對象的選擇
2. 樣本量估計(jì)
3. 納入和排除標(biāo)準(zhǔn)
4. 研究資料收集
二、實(shí)驗(yàn)樣本采集及保存
1. 糞便標(biāo)本的采集
2. 糞便標(biāo)本命名
三、結(jié)果
1. 隊(duì)列完成情況
2. 百歲老人生存情況分析
四、討論
第二部分 百歲老人腸道菌群分析結(jié)果
一、分析方法
1. 材料
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑及耗材明細(xì)
1.2 主要試驗(yàn)儀器明細(xì)
2. 建庫
3. 生物信息分析
二、結(jié)果及討論
1. 長隊(duì)列百歲老人基本信息
2. 數(shù)據(jù)質(zhì)控
2.1 原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2.2 單個(gè)樣品的單次測序Reads各位置堿基分布與質(zhì)量分布
3. 物種注釋與差異物種分析
3.1 物種注釋統(tǒng)計(jì)
3.2 各水平物種豐度表
3.3 單樣品物種組成分析
3.4 多樣品物種分析
3.5 核心物種統(tǒng)計(jì)分析
3.6 物種累積曲線
3.7 優(yōu)勢物種分析
3.8 三角Ternary圖
3.9 優(yōu)勢物種聚類分析
3.10 主成分分析(PCA)
3.11 主坐標(biāo)分析(PCoA)
3.12 NMDS分析
3.13 物種Anosim分析
3.14 物種MRPP分析
3.15 組內(nèi)組間顯著差異物種
3.16 物種LEfSe差異分析
4. 隨機(jī)森林模型預(yù)測顯著差異菌
三、小結(jié)
四、討論
五、全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
附錄
附表一
附表二
攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國海南百歲老人隊(duì)列研究:研究設(shè)計(jì)及初步結(jié)果[J]. 何耀,欒復(fù)新,姚堯,楊?yuàn)檴?解恒革,李靖,劉淼,王建華,吳蕾,朱喬,陳小萍,寧超學(xué),王魯寧,李小鷹,張思兵,張福,趙亞力. 中華流行病學(xué)雜志. 2017 (09)
[2]21世紀(jì)的人口老齡化:成就與挑戰(zhàn)[J]. 人口與計(jì)劃生育. 2013(01)
本文編號(hào):3162079
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 百歲老人隊(duì)列情況
一、實(shí)驗(yàn)對象
1. 試驗(yàn)對象的選擇
2. 樣本量估計(jì)
3. 納入和排除標(biāo)準(zhǔn)
4. 研究資料收集
二、實(shí)驗(yàn)樣本采集及保存
1. 糞便標(biāo)本的采集
2. 糞便標(biāo)本命名
三、結(jié)果
1. 隊(duì)列完成情況
2. 百歲老人生存情況分析
四、討論
第二部分 百歲老人腸道菌群分析結(jié)果
一、分析方法
1. 材料
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑及耗材明細(xì)
1.2 主要試驗(yàn)儀器明細(xì)
2. 建庫
3. 生物信息分析
二、結(jié)果及討論
1. 長隊(duì)列百歲老人基本信息
2. 數(shù)據(jù)質(zhì)控
2.1 原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2.2 單個(gè)樣品的單次測序Reads各位置堿基分布與質(zhì)量分布
3. 物種注釋與差異物種分析
3.1 物種注釋統(tǒng)計(jì)
3.2 各水平物種豐度表
3.3 單樣品物種組成分析
3.4 多樣品物種分析
3.5 核心物種統(tǒng)計(jì)分析
3.6 物種累積曲線
3.7 優(yōu)勢物種分析
3.8 三角Ternary圖
3.9 優(yōu)勢物種聚類分析
3.10 主成分分析(PCA)
3.11 主坐標(biāo)分析(PCoA)
3.12 NMDS分析
3.13 物種Anosim分析
3.14 物種MRPP分析
3.15 組內(nèi)組間顯著差異物種
3.16 物種LEfSe差異分析
4. 隨機(jī)森林模型預(yù)測顯著差異菌
三、小結(jié)
四、討論
五、全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
附錄
附表一
附表二
攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國海南百歲老人隊(duì)列研究:研究設(shè)計(jì)及初步結(jié)果[J]. 何耀,欒復(fù)新,姚堯,楊?yuàn)檴?解恒革,李靖,劉淼,王建華,吳蕾,朱喬,陳小萍,寧超學(xué),王魯寧,李小鷹,張思兵,張福,趙亞力. 中華流行病學(xué)雜志. 2017 (09)
[2]21世紀(jì)的人口老齡化:成就與挑戰(zhàn)[J]. 人口與計(jì)劃生育. 2013(01)
本文編號(hào):3162079
本文鏈接:http://sikaile.net/xiyixuelunwen/3162079.html
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