鹽城地區(qū)柯薩奇病毒A組16型分離株VP1區(qū)基因分子生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-04-22 15:08
目的分析鹽城地區(qū)柯薩奇病毒A組16型(coxsackievirus A16,CVA16)VP1區(qū)蛋白結構和B細胞表位。方法基于鹽城地區(qū)2017年CVA16分離株J837 VP1區(qū)蛋白序列,采用分子生物信息學軟件預測蛋白質理化特性、親水性、二級結構和抗原表位等。結果鹽城地區(qū)CVA16分離株VP1區(qū)編碼蛋白為親水蛋白,無信號肽,有1個跨膜螺旋區(qū)域,二級結構以無規(guī)則卷曲為主,存在7個潛在的B細胞抗原表位。結論本文成功預測了CVA16分離株VP1區(qū)蛋白二級結構和B細胞優(yōu)勢表位,為CVA16疫苗研研發(fā)提供了科學依據。
【文章來源】:現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2019,46(21)北大核心
【文章頁數】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 CVA16分離株VP1序列的獲取
1.2 生物信息學軟件
2 結 果
2.1 氨基酸組成
2.2 蛋白質理化性質分析
2.3 信號肽分析
2.4 疏水性分析
2.5 跨膜螺旋預測
2.6 磷酸化位點預測
2.7 糖基化、脂;刃揎椢稽c預測
2.8 蛋白質二級結構
2.9 B細胞表位預測
3 討 論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2009-2017年江蘇省手足口病病原譜及柯薩奇A16型的分子流行病學研究[J]. 嵇紅,鮑倡俊,祁賢,霍翔,胡建利,樊歡. 中國人獸共患病學報. 2019(02)
[2]2010-2016年北京地區(qū)兒童腸道病毒感染疾病的病原特征分析[J]. 于方圓,朱汝南,鄧潔,宋秦偉,賈立平,劉立穎,錢淵. 中華兒科雜志. 2018 (08)
[3]2016-2017年鹽城地區(qū)手足口病病原譜構成及EV71型腸道病毒VP1基因特征[J]. 陳國清,李春香,王瑤,李峰,徐士林,李長城,邵榮標. 現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2018(13)
[4]鹽城市腸道病毒71型和柯薩奇病毒A組16型分子流行病學特征分析[J]. 姚學君,嵇紅,姜仁杰,李長城,管書慧,劉秀蘭,單軍. 現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2018(03)
[5]2012~2016年沈陽市手足口病流行特征分析[J]. 齊英,安向東,陳葉,王冰,陳會杰. 預防醫(yī)學論壇. 2018(01)
[6]1株九江分離的柯薩奇A6病毒VP1基因分析及B細胞表位預測[J]. 徐煥新,柯秀梅,蔡曼,王萌,楊生晟,陳春輝,余文敏. 江蘇預防醫(yī)學. 2017(01)
[7]柯薩奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息學分析[J]. 劉洪波,陽廣菲,歐維琳,沈關心. 中國免疫學雜志. 2016(04)
[8]腸道病毒71型六安地區(qū)分離株VP1基因的生物信息學分析及B細胞表位預測[J]. 俞海洋,陳偉,倪德群,常宏偉,王林定,湯仁樹,陳靈芝,丁曉娟,陳敬賢,王明麗. 安徽醫(yī)科大學學報. 2012(03)
[9]腸道病毒71型VP1蛋白二級結構及B細胞表位的預測[J]. 王錦,許國章,倪紅霞. 中國人獸共患病學報. 2011(10)
本文編號:3153989
【文章來源】:現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2019,46(21)北大核心
【文章頁數】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 CVA16分離株VP1序列的獲取
1.2 生物信息學軟件
2 結 果
2.1 氨基酸組成
2.2 蛋白質理化性質分析
2.3 信號肽分析
2.4 疏水性分析
2.5 跨膜螺旋預測
2.6 磷酸化位點預測
2.7 糖基化、脂;刃揎椢稽c預測
2.8 蛋白質二級結構
2.9 B細胞表位預測
3 討 論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2009-2017年江蘇省手足口病病原譜及柯薩奇A16型的分子流行病學研究[J]. 嵇紅,鮑倡俊,祁賢,霍翔,胡建利,樊歡. 中國人獸共患病學報. 2019(02)
[2]2010-2016年北京地區(qū)兒童腸道病毒感染疾病的病原特征分析[J]. 于方圓,朱汝南,鄧潔,宋秦偉,賈立平,劉立穎,錢淵. 中華兒科雜志. 2018 (08)
[3]2016-2017年鹽城地區(qū)手足口病病原譜構成及EV71型腸道病毒VP1基因特征[J]. 陳國清,李春香,王瑤,李峰,徐士林,李長城,邵榮標. 現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2018(13)
[4]鹽城市腸道病毒71型和柯薩奇病毒A組16型分子流行病學特征分析[J]. 姚學君,嵇紅,姜仁杰,李長城,管書慧,劉秀蘭,單軍. 現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2018(03)
[5]2012~2016年沈陽市手足口病流行特征分析[J]. 齊英,安向東,陳葉,王冰,陳會杰. 預防醫(yī)學論壇. 2018(01)
[6]1株九江分離的柯薩奇A6病毒VP1基因分析及B細胞表位預測[J]. 徐煥新,柯秀梅,蔡曼,王萌,楊生晟,陳春輝,余文敏. 江蘇預防醫(yī)學. 2017(01)
[7]柯薩奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息學分析[J]. 劉洪波,陽廣菲,歐維琳,沈關心. 中國免疫學雜志. 2016(04)
[8]腸道病毒71型六安地區(qū)分離株VP1基因的生物信息學分析及B細胞表位預測[J]. 俞海洋,陳偉,倪德群,常宏偉,王林定,湯仁樹,陳靈芝,丁曉娟,陳敬賢,王明麗. 安徽醫(yī)科大學學報. 2012(03)
[9]腸道病毒71型VP1蛋白二級結構及B細胞表位的預測[J]. 王錦,許國章,倪紅霞. 中國人獸共患病學報. 2011(10)
本文編號:3153989
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