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鹽城地區(qū)柯薩奇病毒A組16型分離株VP1區(qū)基因分子生物信息學分析

發(fā)布時間:2021-04-22 15:08
  目的分析鹽城地區(qū)柯薩奇病毒A組16型(coxsackievirus A16,CVA16)VP1區(qū)蛋白結構和B細胞表位。方法基于鹽城地區(qū)2017年CVA16分離株J837 VP1區(qū)蛋白序列,采用分子生物信息學軟件預測蛋白質理化特性、親水性、二級結構和抗原表位等。結果鹽城地區(qū)CVA16分離株VP1區(qū)編碼蛋白為親水蛋白,無信號肽,有1個跨膜螺旋區(qū)域,二級結構以無規(guī)則卷曲為主,存在7個潛在的B細胞抗原表位。結論本文成功預測了CVA16分離株VP1區(qū)蛋白二級結構和B細胞優(yōu)勢表位,為CVA16疫苗研研發(fā)提供了科學依據。 

【文章來源】:現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2019,46(21)北大核心

【文章頁數】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 CVA16分離株VP1序列的獲取
    1.2 生物信息學軟件
2 結 果
    2.1 氨基酸組成
    2.2 蛋白質理化性質分析
    2.3 信號肽分析
    2.4 疏水性分析
    2.5 跨膜螺旋預測
    2.6 磷酸化位點預測
    2.7 糖基化、脂;刃揎椢稽c預測
    2.8 蛋白質二級結構
    2.9 B細胞表位預測
3 討 論


【參考文獻】:
期刊論文
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[9]腸道病毒71型VP1蛋白二級結構及B細胞表位的預測[J]. 王錦,許國章,倪紅霞.  中國人獸共患病學報. 2011(10)



本文編號:3153989

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