目的1、對細粒棘球絳蟲水通道蛋白（Eg AQPs）的序列和結構特性進行生物信息學分析,為研究其生物學功能提供基礎。2、篩選以RT-qPCR方法檢測棘球蚴EgAQPs基因轉錄表達狀態(tài)的內(nèi)參基因,并檢測EgAQPs基因在棘球蚴發(fā)育不同時間的轉錄表達水平,為探討EgAQPs基因轉錄表達水平變化與棘球蚴液形成或積累的關系提供依據(jù)。3、克隆Eg AQPs基因,并在非洲爪蟾卵母細胞中進行異源表達以驗證其水通道蛋白的功能,為研究EgAQPs基因在棘球蚴液形成或積累中的作用及機制提供基礎。方法1、對Eg AQPs蛋白的序列和結構特性進行生物信息學分析,并構建進化樹,以比較EgAQPs與其他物種來源的AQPs之間的親緣關系。采用ProtParam、MotifScan、Conserved Domain、TMHMM 2.0、Prot Scale等生物信息學在線分析程序,分析EgAQPs蛋白的理化性質、翻譯后修飾位點、保守結構域、跨膜結構域、親/疏水性等。采用Clustal omega程序對不同物種來源的AQPs進行多序列比對,并通過MEGA 6.06程序構建進化樹。2、采用geNorm軟件分析體內(nèi)外發(fā)育不同... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學重慶市

【文章頁數(shù)】：116 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

EgAQPs蛋白的親/疏水性圖

圖 1-3 EgAQPs 蛋白的跨膜結構域。在 TopPred 1.10 的預測結果中，黑色的圓柱體代表確定的跨膜結構域，白色的圓柱體代表推測的跨膜結構域。在 TMPred 的預測結果中，分值大于500 的峰為跨膜結構域。在 TMHMM 2.0 的預測結果中，圖形上方紅色的橫線代表跨膜結構域。Figure 1-3 The transmembrane regions of EgAQPs. In TopPred 1.10, barrels in blackindicate the certain transmembrane regions, barrels in white indicate the putativetransmembrane regions. In TMPred, peaks with score more than 500 represent thetransmembrane regions. In TMHMM 2.0, horizon lines in red above the figure indicate thetransmembrane regions.除跨膜結構域的相關信息外，TMHMM 2.0 和 TopPred 1.10 軟件還分析了蛋白的 N-末端和 C-末端的定位。TMHMM 2.0 程序分析結果表明，除了 EgAQP1（N末端和 C 末端均位于胞外）、EgAQP9（accession number: CDS21164，N 末端和 C

EgAQPs 與人 AQP1、AQP9 的多序列比對結果。所用蛋白及登錄號如下：人 number:AAX24129）、AQP9（accession number: BAA24864）、EgAQP1（aS21750）、EgAQP9 的 2 種轉錄本（accession number: CDS21164 和 CDS 3 種轉錄本（accession number: CDS21745、CDS21752 和 CDS21753）、26

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3120140