目的1、對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲水通道蛋白（Eg AQPs）的序列和結(jié)構(gòu)特性進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為研究其生物學(xué)功能提供基礎(chǔ)。2、篩選以RT-qPCR方法檢測(cè)棘球蚴EgAQPs基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)狀態(tài)的內(nèi)參基因,并檢測(cè)EgAQPs基因在棘球蚴發(fā)育不同時(shí)間的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平,為探討EgAQPs基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平變化與棘球蚴液形成或積累的關(guān)系提供依據(jù)。3、克隆Eg AQPs基因,并在非洲爪蟾卵母細(xì)胞中進(jìn)行異源表達(dá)以驗(yàn)證其水通道蛋白的功能,為研究EgAQPs基因在棘球蚴液形成或積累中的作用及機(jī)制提供基礎(chǔ)。方法1、對(duì)Eg AQPs蛋白的序列和結(jié)構(gòu)特性進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并構(gòu)建進(jìn)化樹,以比較EgAQPs與其他物種來源的AQPs之間的親緣關(guān)系。采用ProtParam、MotifScan、Conserved Domain、TMHMM 2.0、Prot Scale等生物信息學(xué)在線分析程序,分析EgAQPs蛋白的理化性質(zhì)、翻譯后修飾位點(diǎn)、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、親/疏水性等。采用Clustal omega程序?qū)Σ煌锓N來源的AQPs進(jìn)行多序列比對(duì),并通過MEGA 6.06程序構(gòu)建進(jìn)化樹。2、采用geNorm軟件分析體內(nèi)外發(fā)育不同... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：116 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

EgAQPs蛋白的親/疏水性圖

圖 1-3 EgAQPs 蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域。在 TopPred 1.10 的預(yù)測(cè)結(jié)果中，黑色的圓柱體代表確定的跨膜結(jié)構(gòu)域，白色的圓柱體代表推測(cè)的跨膜結(jié)構(gòu)域。在 TMPred 的預(yù)測(cè)結(jié)果中，分值大于500 的峰為跨膜結(jié)構(gòu)域。在 TMHMM 2.0 的預(yù)測(cè)結(jié)果中，圖形上方紅色的橫線代表跨膜結(jié)構(gòu)域。Figure 1-3 The transmembrane regions of EgAQPs. In TopPred 1.10, barrels in blackindicate the certain transmembrane regions, barrels in white indicate the putativetransmembrane regions. In TMPred, peaks with score more than 500 represent thetransmembrane regions. In TMHMM 2.0, horizon lines in red above the figure indicate thetransmembrane regions.除跨膜結(jié)構(gòu)域的相關(guān)信息外，TMHMM 2.0 和 TopPred 1.10 軟件還分析了蛋白的 N-末端和 C-末端的定位。TMHMM 2.0 程序分析結(jié)果表明，除了 EgAQP1（N末端和 C 末端均位于胞外）、EgAQP9（accession number: CDS21164，N 末端和 C

EgAQPs 與人 AQP1、AQP9 的多序列比對(duì)結(jié)果。所用蛋白及登錄號(hào)如下：人 number:AAX24129）、AQP9（accession number: BAA24864）、EgAQP1（aS21750）、EgAQP9 的 2 種轉(zhuǎn)錄本（accession number: CDS21164 和 CDS 3 種轉(zhuǎn)錄本（accession number: CDS21745、CDS21752 和 CDS21753）、26

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3120140