新型人類(lèi)腸道病毒山東分離株的分子流行病學(xué)及其基因組特征研究
發(fā)布時(shí)間:2021-04-05 18:44
[背景]人類(lèi)腸道病毒(Human Enteroviruses, HEVs)屬于小RNA病毒科(Picornaviridae)腸道病毒屬(Enterovirus),目前有A、B、C、D4個(gè)組共109種血清型。HEVs抗原型別復(fù)雜,進(jìn)化活躍,隸屬不同組別的HEVs具有相同或相似的致病性,而導(dǎo)致不同疾病的HEVs在生物學(xué)特性和進(jìn)化上非常相似和接近。根據(jù)HEVs抗原性及致病性的不同,最初被分為64個(gè)血清型:脊髓灰質(zhì)炎病毒(Polioviruses, PV)1-3型,柯薩奇病毒A(Coxsackievirus A, CVA)1-22和24型,柯薩奇病毒B(CVB)1-6型和?刹《荆‥chovirus, Echo)1-7、9、11-21、24-27、29-33型,以及20世紀(jì)70年代后發(fā)現(xiàn)的新型腸道病毒(Newer Enteroviruses)EV68-71型。1999年,基于Oberste等提出的VP1基因序列的分子定型方法,許多使用傳統(tǒng)血清學(xué)方法無(wú)法定型的HEVs(即新型HEVs)陸續(xù)被發(fā)現(xiàn),目前已有50多個(gè)新型HEVs基因型,而且隨著分子定型方法的推廣,將來(lái)還會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的新型HEVS。HE...
【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:172 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
前言
一、背景
(一) 人類(lèi)腸道病毒(HEVs)的分類(lèi)
(二) 新型HEVs的致病性
(三) 新型HEVs的流行狀況
(四) HEVs病原學(xué)及分子進(jìn)化
(五) 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀
二、研究目的與意義
(一) 本研究的意義
(二) 本研究的目的
三、本研究的技術(shù)路線(xiàn)
材料與方法
一、材料
(一) 標(biāo)本與資料來(lái)源
(二) 細(xì)胞培養(yǎng)材料
(三) 病毒分離實(shí)驗(yàn)材料
(四) 中和實(shí)驗(yàn)材料
(五) 核酸提取及RT-PCR實(shí)驗(yàn)材料
(六) 引物設(shè)計(jì)合成
(七) 瓊脂糖凝膠電泳材料
(八) DNA序列測(cè)定材料
(九) 生物信息學(xué)軟件
二、方法
(一) 細(xì)胞培養(yǎng)
(二) 病毒分離
(三) 血清學(xué)型別鑒定
(四) 病毒核酸(RNA)的提取
(五) 逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)
(六) 瓊脂糖凝膠電泳
(七) 序列測(cè)定
(八) 分子定型與序列提交
(九) 系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析與同源性分析
(十) 進(jìn)化遺傳學(xué)分析
(十一) 重組分析
三、質(zhì)量控制
(一) 實(shí)驗(yàn)中的質(zhì)量控制
(二) 其他步驟質(zhì)量控制
結(jié)果
一、新型HEVs山東分離株的鑒定與基因型分布
(一) AFP監(jiān)測(cè)系統(tǒng)來(lái)源的新型HEVs
(二) HFMD病例來(lái)源的新型HEVs
(三) 無(wú)菌性腦膜炎病例中的新型HEVs
二、新型HEVs山東分離株的細(xì)胞病變特征
(一) 細(xì)胞敏感性分析
(二) 在敏感細(xì)胞上的CPE特征
三、新型HEVs VP1序列分析與進(jìn)化遺傳學(xué)研究
(一) EV71山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(二) EV73山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(三) EV74山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(四) EV75山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(五) EV76山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(六) EV80山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(七) EV87山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(八) EV90山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(九) EV96山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(十) EV97山東分離株遺傳進(jìn)化分析
四、新型HEVs全基因組序列分析
(一) EV71的全基因組序列分析
(二) EV73和EV75的全基因組序列分析
(三) EV76的全基因組序列分析
(四) EV90的全基因組序列分析
(五) EV96的全基因組序列分析
(六) EV97的全基因組序列分析
討論
一、新型HEVs山東分離株的基因型分布
二、新型HEVs的細(xì)胞病變特征
三、新型HEVs的分子進(jìn)化
(一) EV71山東分離株的分子進(jìn)化
(二) 其他新型HEVs山東分離株的分子進(jìn)化
四、新型HEVs的基因組序列分析
本研究的主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)和不足
后續(xù)研究方向
結(jié)論與建議
附錄、附表
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表
外文論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]云南省邊境地區(qū)健康兒童中腸道病毒96型的鑒定及型分析[J]. 湯晶晶,田炳均,羅梅,趙智嫻,張杰,龐顏坤,張麗芬,丁崢嶸. 中國(guó)病毒病雜志. 2012(01)
[2]腸道病毒71型疫苗的研發(fā)現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 姚昕,毛群穎,梁爭(zhēng)論. 中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2011(02)
[3]腸道病毒71型疫苗候選株和疫苗標(biāo)準(zhǔn)的研究[J]. 梁爭(zhēng)論. 中國(guó)病毒病雜志. 2011(01)
[4]人類(lèi)腸道病毒B組73、75和97型山東地方株的鑒定及其基因特征分析[J]. 陶澤新,王海巖,徐愛(ài)強(qiáng),宋立志,李巖,劉桂芳,劉堯,樊慶瑩. 病毒學(xué)報(bào). 2010(01)
[5]中國(guó)國(guó)內(nèi)首次分離出EV73腸道病毒[J]. 湯晶晶,丁崢嶸,田炳均,趙智嫻,張杰,李立群,何麗芳. 病毒學(xué)報(bào). 2009(06)
[6]1株新型腸道病毒的生物學(xué)特性鑒定[J]. 胡燕,侯俊,沈宏輝,白冰珂,王志杰,于曉方,貌盼勇. 傳染病信息. 2009(03)
[7]新型腸道病毒[J]. 張杰,丁崢嶸,田炳均. 中華流行病學(xué)雜志. 2009 (05)
[8]云南省人類(lèi)腸道病毒(EV)B組中新型EV80 EV81和EV83的分子生物學(xué)鑒定[J]. 田炳均,張杰,康文玉,趙智嫻,丁崢嶸. 中國(guó)疫苗和免疫. 2008(01)
[9]云南省腸道病毒96型的分子生物學(xué)鑒定[J]. 田炳均,趙智嫻,張杰,康文玉,丁崢嶸. 中國(guó)計(jì)劃免疫. 2007(06)
[10]新型腸道病毒EV75的分子生物學(xué)鑒定[J]. 田炳均,吳燕,張東華,何麗芳,丁崢嶸,陸林. 中華流行病學(xué)雜志. 2007(07)
本文編號(hào):3119904
【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:172 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
前言
一、背景
(一) 人類(lèi)腸道病毒(HEVs)的分類(lèi)
(二) 新型HEVs的致病性
(三) 新型HEVs的流行狀況
(四) HEVs病原學(xué)及分子進(jìn)化
(五) 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀
二、研究目的與意義
(一) 本研究的意義
(二) 本研究的目的
三、本研究的技術(shù)路線(xiàn)
材料與方法
一、材料
(一) 標(biāo)本與資料來(lái)源
(二) 細(xì)胞培養(yǎng)材料
(三) 病毒分離實(shí)驗(yàn)材料
(四) 中和實(shí)驗(yàn)材料
(五) 核酸提取及RT-PCR實(shí)驗(yàn)材料
(六) 引物設(shè)計(jì)合成
(七) 瓊脂糖凝膠電泳材料
(八) DNA序列測(cè)定材料
(九) 生物信息學(xué)軟件
二、方法
(一) 細(xì)胞培養(yǎng)
(二) 病毒分離
(三) 血清學(xué)型別鑒定
(四) 病毒核酸(RNA)的提取
(五) 逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)
(六) 瓊脂糖凝膠電泳
(七) 序列測(cè)定
(八) 分子定型與序列提交
(九) 系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析與同源性分析
(十) 進(jìn)化遺傳學(xué)分析
(十一) 重組分析
三、質(zhì)量控制
(一) 實(shí)驗(yàn)中的質(zhì)量控制
(二) 其他步驟質(zhì)量控制
結(jié)果
一、新型HEVs山東分離株的鑒定與基因型分布
(一) AFP監(jiān)測(cè)系統(tǒng)來(lái)源的新型HEVs
(二) HFMD病例來(lái)源的新型HEVs
(三) 無(wú)菌性腦膜炎病例中的新型HEVs
二、新型HEVs山東分離株的細(xì)胞病變特征
(一) 細(xì)胞敏感性分析
(二) 在敏感細(xì)胞上的CPE特征
三、新型HEVs VP1序列分析與進(jìn)化遺傳學(xué)研究
(一) EV71山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(二) EV73山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(三) EV74山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(四) EV75山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(五) EV76山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(六) EV80山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(七) EV87山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(八) EV90山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(九) EV96山東分離株遺傳進(jìn)化分析
(十) EV97山東分離株遺傳進(jìn)化分析
四、新型HEVs全基因組序列分析
(一) EV71的全基因組序列分析
(二) EV73和EV75的全基因組序列分析
(三) EV76的全基因組序列分析
(四) EV90的全基因組序列分析
(五) EV96的全基因組序列分析
(六) EV97的全基因組序列分析
討論
一、新型HEVs山東分離株的基因型分布
二、新型HEVs的細(xì)胞病變特征
三、新型HEVs的分子進(jìn)化
(一) EV71山東分離株的分子進(jìn)化
(二) 其他新型HEVs山東分離株的分子進(jìn)化
四、新型HEVs的基因組序列分析
本研究的主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)和不足
后續(xù)研究方向
結(jié)論與建議
附錄、附表
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表
外文論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]云南省邊境地區(qū)健康兒童中腸道病毒96型的鑒定及型分析[J]. 湯晶晶,田炳均,羅梅,趙智嫻,張杰,龐顏坤,張麗芬,丁崢嶸. 中國(guó)病毒病雜志. 2012(01)
[2]腸道病毒71型疫苗的研發(fā)現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 姚昕,毛群穎,梁爭(zhēng)論. 中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2011(02)
[3]腸道病毒71型疫苗候選株和疫苗標(biāo)準(zhǔn)的研究[J]. 梁爭(zhēng)論. 中國(guó)病毒病雜志. 2011(01)
[4]人類(lèi)腸道病毒B組73、75和97型山東地方株的鑒定及其基因特征分析[J]. 陶澤新,王海巖,徐愛(ài)強(qiáng),宋立志,李巖,劉桂芳,劉堯,樊慶瑩. 病毒學(xué)報(bào). 2010(01)
[5]中國(guó)國(guó)內(nèi)首次分離出EV73腸道病毒[J]. 湯晶晶,丁崢嶸,田炳均,趙智嫻,張杰,李立群,何麗芳. 病毒學(xué)報(bào). 2009(06)
[6]1株新型腸道病毒的生物學(xué)特性鑒定[J]. 胡燕,侯俊,沈宏輝,白冰珂,王志杰,于曉方,貌盼勇. 傳染病信息. 2009(03)
[7]新型腸道病毒[J]. 張杰,丁崢嶸,田炳均. 中華流行病學(xué)雜志. 2009 (05)
[8]云南省人類(lèi)腸道病毒(EV)B組中新型EV80 EV81和EV83的分子生物學(xué)鑒定[J]. 田炳均,張杰,康文玉,趙智嫻,丁崢嶸. 中國(guó)疫苗和免疫. 2008(01)
[9]云南省腸道病毒96型的分子生物學(xué)鑒定[J]. 田炳均,趙智嫻,張杰,康文玉,丁崢嶸. 中國(guó)計(jì)劃免疫. 2007(06)
[10]新型腸道病毒EV75的分子生物學(xué)鑒定[J]. 田炳均,吳燕,張東華,何麗芳,丁崢嶸,陸林. 中華流行病學(xué)雜志. 2007(07)
本文編號(hào):3119904
本文鏈接:http://sikaile.net/xiyixuelunwen/3119904.html
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